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SELEX技术体外筛选单增李斯特菌适配子及其荧光快速检测方法的建立

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
致谢第9-13页
插图清单第13页
表格清单第13-14页
英文缩略词表第14-15页
第一章 绪论第15-24页
   ·单核细胞增生李斯特菌概况和危害第15-16页
   ·SELEX 技术的发展与应用第16-23页
     ·经典 SELEX 技术及其原理第16-17页
     ·适配子(aptamer)的优势第17-20页
     ·影响 SELEX 筛选的因素第20-21页
     ·经典 SELEX 技术的发展第21-22页
     ·SELEX 的应用第22-23页
   ·展望第23-24页
第二章 随机 ssDNA 文库的 PCR 扩增条件的摸索第24-32页
   ·实验材料第24-25页
     ·主要试剂第24-25页
     ·随机 ssDNA 文库的构建、引物的设计与合成第25页
     ·主要仪器第25页
   ·方法第25-26页
     ·PCR 扩增条件的探索第25页
     ·PCR 产物的纯化第25-26页
     ·PCR 产物的 12%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第26页
   ·结果第26-29页
     ·退火温度对 PCR 扩增的影响第26-27页
     ·循环次数对 PCR 扩增的影响第27-28页
     ·模板量对 PCR 扩增的影响第28页
     ·引物浓度对 PCR 扩增的影响第28-29页
     ·Mix 含量对 PCR 扩增的影响第29页
   ·讨论第29-31页
   ·小结第31-32页
第三章 SELEX 技术筛选单增李斯特菌适配子方法的建立第32-57页
   ·实验材料第32-36页
     ·随机 ssDNA 文库的构建、引物的设计与合成第32页
     ·单增李斯特菌悬液及反筛菌菌悬液的制备第32页
     ·主要试剂第32-35页
     ·主要仪器第35-36页
   ·方法第36-39页
     ·SELEX 筛选过程第36-37页
     ·磁珠捕获法制备 ssDNA 文库第37页
     ·SELEX 的消减筛选第37-38页
     ·筛选的 ssDNA 文库与单增李斯特菌特异结合率的测定第38页
     ·筛选产物的克隆第38-39页
     ·测序第39页
     ·适配子的软件分析第39页
   ·结果第39-53页
     ·SELEX 筛选过程第39-41页
     ·筛选的 ssDNA 文库与单增李斯特菌特异结合率的测定第41-42页
     ·克隆适配子一级结构分析第42-49页
     ·适配子二级结构模拟分析第49-53页
   ·讨论第53-56页
     ·随机 ssDNA 文库及引物的设计第53-54页
     ·文库用量和靶目标浓度的选择第54页
     ·反向筛选对筛选结果的影响第54-55页
     ·次级文库的制备第55页
     ·筛选轮数的选择第55页
     ·PCR 扩增产物的纯化第55页
     ·适配子的一级结构第55-56页
     ·适配子的二级结构第56页
   ·小结第56-57页
第四章 适配子的鉴定、分析与应用第57-68页
   ·实验材料第57-58页
     ·标记引物的合成第57页
     ·主要试剂第57-58页
     ·主要仪器第58页
   ·方法第58-60页
     ·克隆子质粒的提取第58页
     ·地高辛标记的 ssDNA 的制备第58页
     ·挑选的适配子与单增李斯特菌及反筛菌结合力的测定第58页
     ·适配子 E01 和 F01 与单增李斯特菌亲和力解离常数的测定第58-59页
     ·E01 号适配子群落的特异性检测第59页
     ·建立荧光基团标记适配子 E01 快速鉴定单增李斯特菌的检测方法第59页
     ·适配子 E01 的灵敏度检测比较第59-60页
   ·结果第60-66页
     ·挑选的适配子与单增李斯特菌及反筛菌结合力的测定结果第60-61页
     ·适配子 E01 和 F01 与单增李斯特菌饱和力的测定结果第61-62页
     ·E01 号适配子群落的特异性检测第62-63页
     ·荧光显微镜观察结果第63-65页
     ·适配子 E01 的灵敏度检测比较第65-66页
   ·讨论第66-67页
   ·小结第67-68页
第五章 结论第68-69页
参考文献第69-73页
攻读硕士学位期间发表的论文第73-75页

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