| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 引言 | 第11-12页 |
| 1.2 浓香型白酒窖池微生态研究进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 泸州老窖窖泥中功能菌研究进展 | 第12-14页 |
| 1.2.2 酒曲中微生物的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2.3 糟醅微生物研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 分子生物学技术在微生物多样性研究中的应用 | 第16-21页 |
| 1.3.1 DGGE/TGGE技术 | 第17-18页 |
| 1.3.2 16S rDNA文库构建 | 第18-19页 |
| 1.3.3 ARDRA技术的应用 | 第19页 |
| 1.3.4 宏基因组学技术(Metagenomics) | 第19-21页 |
| 1.4 本论文的研究目的、意义和主要内容 | 第21-22页 |
| 第二章 不同窖龄窖泥细菌种群多样性 | 第22-55页 |
| 2.1 材料和方法 | 第22-27页 |
| 2.1.1 窖泥样品 | 第22-23页 |
| 2.1.2 DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.1.3 不同窖龄窖泥中细菌的PCR-DGGE分析 | 第24-25页 |
| 2.1.4 不同窖龄窖泥中细菌16S rDNA基因文库的构建 | 第25-27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-50页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第27-28页 |
| 2.2.2 不同窖龄窖泥中细菌的PCR-DGGE分析 | 第28-33页 |
| 2.2.3 不同窖龄窖泥中细菌16S rDNA基因文库的构建 | 第33-50页 |
| 2.3 讨论 | 第50-55页 |
| 第三章 不同窖龄窖泥古菌16S rDNA基因文库构建 | 第55-71页 |
| 3.1 实验方法 | 第55-56页 |
| 3.1.1 古菌16S rDNA PCR扩增 | 第55页 |
| 3.1.2 16S rDNA PCR产物纯化 | 第55页 |
| 3.1.3 16S rDNA产物的连接反应 | 第55页 |
| 3.1.4 转化 | 第55-56页 |
| 3.1.5 克隆子检测 | 第56页 |
| 3.1.6 限制性内切酶酶切 | 第56页 |
| 3.1.7 克隆子文库的酶切分析 | 第56页 |
| 3.1.8 文库的评估及统计分析 | 第56页 |
| 3.2 结果与分析 | 第56-69页 |
| 3.2.1 古菌16S rDNA PCR扩增及纯化 | 第56页 |
| 3.2.2 古菌文库构建与酶切分析 | 第56-58页 |
| 3.2.3 古菌文库评价 | 第58-59页 |
| 3.2.4 古菌群落结构及其系统发育多样性 | 第59-69页 |
| 3.3 讨论 | 第69-71页 |
| 第四章 不同窖龄窖泥中几种功能菌的PCR-DGGE分析 | 第71-101页 |
| 4.1 不同窖龄窖泥中产甲烷古菌的PCR-DGGE分析 | 第71-72页 |
| 4.1.1 产甲烷古菌PCR扩增 | 第71-72页 |
| 4.1.2 产甲烷古菌的DGGE分析 | 第72页 |
| 4.1.3 产甲烷古菌DGGE图谱分析 | 第72页 |
| 4.2 不同窖龄窖泥中乳酸菌的PCR-DGGE分析 | 第72-73页 |
| 4.2.1 窖泥中乳酸菌的PCR扩增 | 第72-73页 |
| 4.2.2 乳酸菌的DGGE分析 | 第73页 |
| 4.2.3 乳酸菌DGGE图谱分析 | 第73页 |
| 4.3 不同窖龄窖泥中己酸菌的PCR-DGGE分析 | 第73-74页 |
| 4.3.1 己酸菌PCR扩增 | 第73-74页 |
| 4.3.2 己酸菌DGGE分析和代表性菌株克隆测序 | 第74页 |
| 4.3.3 己酸菌DGGE图谱分析 | 第74页 |
| 4.4 不同窖龄窖泥中甲烷氧化菌的PCR-DGGE分析 | 第74-76页 |
| 4.4.1 Ⅰ型甲烷氧化菌 | 第74-75页 |
| 4.4.2 Ⅱ型甲烷氧化菌 | 第75-76页 |
| 4.5 结果与分析 | 第76-97页 |
| 4.5.1 不同窖龄窖泥中产甲烷古菌的PCR-DGGE分析 | 第76-81页 |
| 4.5.2 不同窖龄窖泥中乳酸菌的PCR-DGGE分析 | 第81-85页 |
| 4.5.3 不同窖龄窖泥中己酸菌的PCR-DGGE分析 | 第85-90页 |
| 4.5.4 不同窖龄窖泥中甲烷氧化菌的PCR-DGGE分析 | 第90-97页 |
| 4.6 讨论 | 第97-101页 |
| 第五章 基于高通量测序的不同窖龄窖泥中细菌及古菌群落多样性分析 | 第101-121页 |
| 5.1 不同窖龄窖泥中细菌群落多样性分析 | 第101-104页 |
| 5.1.1 窖泥样品 | 第101页 |
| 5.1.2 Miseq测序流程 | 第101-103页 |
| 5.1.3 测序数据统计及优化 | 第103页 |
| 5.1.4 样品多样性及丰富度分析 | 第103页 |
| 5.1.5 细菌群落多样性分析 | 第103-104页 |
| 5.2 不同窖龄窖底泥中古菌群落多样性分析 | 第104-106页 |
| 5.2.1 窖底泥样品及编号 | 第104页 |
| 5.2.2 Roche 454高通量测序流程 | 第104-105页 |
| 5.2.3 测序数据统计及优化 | 第105页 |
| 5.2.4 样品多样性及丰富度分析 | 第105-106页 |
| 5.2.5 古菌群落多样性分析 | 第106页 |
| 5.3 结果及分析 | 第106-118页 |
| 5.3.1 细菌群落多样性分析 | 第106-112页 |
| 5.3.2 古菌群落多样性分析 | 第112-118页 |
| 5.4 讨论 | 第118-121页 |
| 第六章 全文结论、创新及展望 | 第121-124页 |
| 6.1 全文结论 | 第121-123页 |
| 6.2 创新点 | 第123页 |
| 6.3 展望 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
| 附录 | 第144-156页 |
| 攻读学位期间发表论文及专利情况 | 第156页 |
