| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第11-13页 |
| 1.1.1 课题背景 | 第11-12页 |
| 1.1.2 研究目的和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 细菌素的生物合成 | 第13-15页 |
| 1.2.1 植物乳杆菌细菌素的pln基因座 | 第13-14页 |
| 1.2.2 片球菌素(Pediocins)的生物合成 | 第14-15页 |
| 1.3 细菌素的作用模式及分析方法 | 第15-19页 |
| 1.3.1 细菌素的作用模式 | 第16-17页 |
| 1.3.2 流式细胞(FC)分析法 | 第17-18页 |
| 1.3.3 荧光探针分析法 | 第18-19页 |
| 1.4 细菌素的作用受体 | 第19-21页 |
| 1.4.1 免疫沉淀法 | 第20页 |
| 1.4.2 普通分子生物学方法 | 第20-21页 |
| 1.5 技术路线 | 第21页 |
| 1.6 主要研究内容 | 第21-23页 |
| 第2章 材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 材料及仪器 | 第23-25页 |
| 2.1.1 菌种 | 第23页 |
| 2.1.2 主要实验仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.1.3 主要实验试剂 | 第24页 |
| 2.1.4 培养基 | 第24-25页 |
| 2.2 全基因组测序 | 第25-26页 |
| 2.2.1 测序策略 | 第25页 |
| 2.2.2 基因组序列拼装与分析 | 第25-26页 |
| 2.2.3 功能元件分析及预测 | 第26页 |
| 2.2.4 系统发育树的构建 | 第26页 |
| 2.2.5 全基因组序列的对比 | 第26页 |
| 2.3 细菌素结构的研究方法 | 第26-29页 |
| 2.3.1 细菌素的一级结构的预测 | 第27页 |
| 2.3.2 细菌素二级结构的预测 | 第27页 |
| 2.3.3 细菌素的分离纯化 | 第27-28页 |
| 2.3.4 Tricine-SDS-PAGE | 第28页 |
| 2.3.5 贴胶抑菌实验 | 第28页 |
| 2.3.6 MALDI-TOF质谱法 | 第28-29页 |
| 2.3.7 圆二色谱法(CD) | 第29页 |
| 2.4 细菌素抑菌作用的研究方法 | 第29-32页 |
| 2.4.1 生理分析菌悬液的制备 | 第29-30页 |
| 2.4.2 细菌表面疏水性的测定 | 第30页 |
| 2.4.3 细胞内外无机磷浓度的测定 | 第30页 |
| 2.4.4 细胞内外ATP含量的测定 | 第30页 |
| 2.4.5 细胞外膜渗透性的测定 | 第30-31页 |
| 2.4.6 细胞膜电位(ΔΨ)的测定 | 第31页 |
| 2.4.7 胞内外pH梯度(ΔpH)的测定 | 第31-32页 |
| 2.4.8 扫描电镜(SEM)与透射电镜(TEM) | 第32页 |
| 2.5 数据统计与分析 | 第32-33页 |
| 第3章 Lactobacillus plantarum Q7的全基因组分析 | 第33-45页 |
| 3.1 引言 | 第33页 |
| 3.2 Lactobacillus plantarum Q7的全基因组序列分析 | 第33-34页 |
| 3.3 系统发育树的构建 | 第34-35页 |
| 3.4 染色体基因功能注释分析 | 第35-38页 |
| 3.4.1 染色体的基因圈图 | 第35-36页 |
| 3.4.2 染色体基因功能对比分析 | 第36-38页 |
| 3.5 质粒上基因功能注释分析 | 第38-39页 |
| 3.6 细菌素基因簇分析 | 第39-43页 |
| 3.6.1 质粒上细菌素相关基因 | 第39-41页 |
| 3.6.2 染色体上细菌素相关基因 | 第41-43页 |
| 3.7 本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 细菌素结构的初探 | 第45-56页 |
| 4.1 引言 | 第45页 |
| 4.2 细菌素一级结构的预测 | 第45-47页 |
| 4.2.1 细菌素理化性质的分析 | 第45-46页 |
| 4.2.2 细菌素亲疏水性分析 | 第46-47页 |
| 4.2.3 细菌素跨膜区域分析 | 第47页 |
| 4.3 细菌素二级结构的预测 | 第47-48页 |
| 4.4 细菌素的分离纯化 | 第48-51页 |
| 4.4.1 SP Sepherose Fast Flow阳离子交换柱层析 | 第49-50页 |
| 4.4.2 Superdex Peptide 10/300 GL分子筛 | 第50-51页 |
| 4.5 圆二色谱法(CD)获得细菌素的二级结构 | 第51-53页 |
| 4.6 质谱法验证细菌素的一级结构 | 第53-55页 |
| 4.6.1 Tricine-SDS-PAGE和贴胶 | 第53-54页 |
| 4.6.2 MALDI-TOF质谱法确定细菌素一级结构 | 第54-55页 |
| 4.7 本章小结 | 第55-56页 |
| 第5章 细菌素对荧光假单胞菌抑制机理的研究 | 第56-66页 |
| 5.1 引言 | 第56页 |
| 5.2 Pseudomonas fluorescens细胞内溶物的变化 | 第56-58页 |
| 5.2.1 细胞内外无机磷浓度的变化 | 第56-57页 |
| 5.2.2 细胞内外ATP含量的变化 | 第57-58页 |
| 5.3 Pseudomonas fluorescens细胞外膜渗透性的变化 | 第58-60页 |
| 5.3.1 荧光探针NPN最佳浓度及波长的确定 | 第58-59页 |
| 5.3.2 细胞外膜的变化 | 第59-60页 |
| 5.4 Pseudomonas fluorescens细胞跨膜电位(ΔΨ)的变化 | 第60-61页 |
| 5.5 Pseudomonas fluorescens胞内外PH梯度(ΔPH)的变化 | 第61-62页 |
| 5.6 Pseudomonas fluorescens表面疏水性的变化 | 第62-63页 |
| 5.7 扫描电镜(SEM)与透射电镜(TEM) | 第63-64页 |
| 5.8 本章小结 | 第64-66页 |
| 结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-76页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
