| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-26页 |
| 1.1 冷鲜鸡概述 | 第14页 |
| 1.1.1 冷鲜鸡的定义 | 第14页 |
| 1.1.2 冷鲜鸡产业链的发展 | 第14页 |
| 1.2 冷鲜鸡产业链中微生物污染状况 | 第14-17页 |
| 1.2.1 冷鲜鸡中食源性致病菌的种类 | 第16页 |
| 1.2.2 冷鲜鸡中食源性致病菌的传播 | 第16-17页 |
| 1.3 冷鲜鸡源大肠杆菌耐药性 | 第17-20页 |
| 1.3.1 大肠杆菌概述 | 第17页 |
| 1.3.2 大肠杆菌耐药性 | 第17-18页 |
| 1.3.3 大肠杆菌耐药性的机理 | 第18-19页 |
| 1.3.3.1 靶位蛋白的改变 | 第18页 |
| 1.3.3.2 产生灭活酶 | 第18页 |
| 1.3.3.3 细菌外膜通透性的改变 | 第18-19页 |
| 1.3.3.4 细菌的药物外输作用 | 第19页 |
| 1.3.3.5 生物被膜的形成 | 第19页 |
| 1.3.4 市售冷鲜鸡大肠杆菌耐药性研究现状 | 第19-20页 |
| 1.4 冷鲜鸡微生物污染的检测方法 | 第20页 |
| 1.5 冷鲜鸡源大肠杆菌检测鉴定方法 | 第20-21页 |
| 1.5.1 鉴别培养基法 | 第20页 |
| 1.5.2 VITEK仪器鉴定 | 第20-21页 |
| 1.5.3 生化试验 | 第21页 |
| 1.5.4 16S rRNA鉴定方法 | 第21页 |
| 1.5.5 以免疫为基础的方法 | 第21页 |
| 1.5.6 以核酸为基础的方法 | 第21页 |
| 1.6 大肠杆菌耐药性的分析方法 | 第21-23页 |
| 1.6.1 传统药敏实验 | 第21-22页 |
| 1.6.2 基于分子生物学的药敏实验 | 第22-23页 |
| 1.6.2.1 PCR技术 | 第22页 |
| 1.6.2.2 基因芯片技术 | 第22页 |
| 1.6.2.3 全基因组测序 | 第22-23页 |
| 1.7 微生物基因组学技术 | 第23-24页 |
| 1.7.1 微生物基因组学的应用 | 第23-24页 |
| 1.7.1.1 基因功能的鉴定 | 第23页 |
| 1.7.1.2 血清型的预测 | 第23-24页 |
| 1.7.1.3 多位点序列分型 | 第24页 |
| 1.8 研究目的与意义 | 第24-25页 |
| 1.9 研究内容与技术路线 | 第25-26页 |
| 1.9.1 研究内容 | 第25页 |
| 1.9.2 技术路线 | 第25-26页 |
| 第二章 浙江省市售冷鲜鸡微生物污染水平分析 | 第26-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 实验仪器和试剂 | 第26-27页 |
| 2.1.2 样本的采集 | 第27页 |
| 2.1.3 冷鲜鸡中菌落总数的检测 | 第27页 |
| 2.1.4 冷鲜鸡中大肠菌群的检测 | 第27-28页 |
| 2.1.5 冷鲜鸡中霉菌和酵母数量的检测 | 第28页 |
| 2.2 结果 | 第28-31页 |
| 2.2.1 冷鲜鸡中菌落总数污染情况 | 第28-29页 |
| 2.2.2 冷鲜鸡中大肠菌群测定情况 | 第29-30页 |
| 2.2.3 冷鲜鸡中霉菌和酵母污染情况 | 第30-31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-33页 |
| 2.3.1 不同地区冷鲜鸡微生物污染情况对比与分析 | 第31页 |
| 2.3.2 来自不同市场（农贸市场和超市）的冷鲜鸡微生物污染情况对比与分析 | 第31-32页 |
| 2.3.3 市售冷鲜鸡物生物污染来源分析 | 第32-33页 |
| 第三章 浙江省市售冷鲜鸡污染大肠杆菌分离鉴定及耐药性分析 | 第33-47页 |
| 3.1 材料与方法 | 第33-37页 |
| 3.1.1 实验仪器和试剂 | 第33-34页 |
| 3.1.2 样品来源 | 第34页 |
| 3.1.3 大肠杆菌的分离 | 第34页 |
| 3.1.4 大肠杆菌的鉴定 | 第34页 |
| 3.1.5 分离大肠杆菌的耐药表型测定 | 第34-35页 |
| 3.1.6 分离大肠杆菌的耐药基因的测定 | 第35-37页 |
| 3.1.6.1 DNA的提取 | 第35-37页 |
| 3.1.6.2 PCR扩增目的基因 | 第37页 |
| 3.1.7 分离大肠杆菌的毒力基因PCR检测 | 第37页 |
| 3.2 结果 | 第37-45页 |
| 3.2.1 不同来源的冷鲜鸡中大肠杆菌的分离情况 | 第37-39页 |
| 3.2.2 分离大肠杆菌的耐药表型检测情况 | 第39-41页 |
| 3.2.3 分离大肠杆菌的多重耐药性检测情况 | 第41-44页 |
| 3.2.4 分离大肠杆菌毒力基因的检测情况 | 第44页 |
| 3.2.5 分离大肠杆菌的耐药基因检测情况 | 第44-45页 |
| 3.3 讨论 | 第45-47页 |
| 3.3.1 来自不同地区，不同市场（农贸市场和超市）的大肠杆菌分离情况对比 | 第45页 |
| 3.3.2 不同来源的冷鲜鸡中大肠杆菌耐药情况对比 | 第45-46页 |
| 3.3.3 大肠杆菌耐药基因与耐药表型的符合情况 | 第46页 |
| 3.3.4 大肠杆菌的毒力基因检测情况 | 第46-47页 |
| 第四章 浙江省市售冷鲜鸡污染大肠杆菌耐药性分子基础分析 | 第47-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第47-49页 |
| 4.1.1 实验所用试剂 | 第47页 |
| 4.1.2 实验材料 | 第47-48页 |
| 4.1.3 菌株的测序 | 第48页 |
| 4.1.4 测序结果的分析与比对 | 第48-49页 |
| 4.2 结果 | 第49-53页 |
| 4.2.1 耐药基因的预测结果 | 第49页 |
| 4.2.2 质粒的预测结果 | 第49-52页 |
| 4.2.4 血清型的预测结果 | 第52-53页 |
| 4.2.5 多位点序列分型（MLST） | 第53页 |
| 4.3 讨论 | 第53-55页 |
| 4.3.1 耐药基因和质粒的预测结果分析 | 第53-54页 |
| 4.3.2 血清型结果分析 | 第54页 |
| 4.3.3 多位点序列分型（MLST）结果分析 | 第54-55页 |
| 第五章 结论、创新点和展望 | 第55-57页 |
| 5.1 结论 | 第55-56页 |
| 5.2 创新点 | 第56页 |
| 5.3 展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 作者简介 | 第64页 |
