| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 英文缩写词中英文对照表(Abbreviations) | 第12-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-44页 |
| 1.1 传统发酵乳制品概述 | 第19-21页 |
| 1.2 新疆传统乳制品中的微生物种类概述 | 第21-23页 |
| 1.3 益生菌概述 | 第23-26页 |
| 1.4 益生菌的生理功能 | 第26-29页 |
| 1.5 益生菌研究中存在的问题 | 第29-30页 |
| 1.6 益生菌分离鉴定方法概述 | 第30-34页 |
| 1.6.1 传统分析手段 | 第30-31页 |
| 1.6.2 分子生物学手段 | 第31-34页 |
| 1.7 秀丽隐杆线虫概述 | 第34-36页 |
| 1.8 秀丽隐杆线虫与衰老 | 第36-39页 |
| 1.8.1 热量限制 | 第37-38页 |
| 1.8.2 环境胁迫 | 第38-39页 |
| 1.9 秀丽隐杆线虫作为模式生物的优势 | 第39-40页 |
| 1.10 本课题立题依据及研究内容 | 第40-44页 |
| 1.10.1 立题依据及研究目的 | 第40-41页 |
| 1.10.2 研究内容 | 第41-44页 |
| 第二章 采集自新疆不同地区奶疙瘩样品的细菌多样性研究 | 第44-64页 |
| 2.1 前言 | 第44-45页 |
| 2.2 材料与方法 | 第45页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第45页 |
| 2.3 试剂和培养基 | 第45页 |
| 2.4 仪器和设备 | 第45-46页 |
| 2.5 实验方法 | 第46-52页 |
| 2.5.1 基因组DNA的提取 | 第46页 |
| 2.5.2 PCR扩增 | 第46页 |
| 2.5.3 PCR产物的混样和纯化 | 第46页 |
| 2.5.4 高通量测序基本信息分析 | 第46-48页 |
| 2.5.5 物种注释原则 | 第48-49页 |
| 2.5.6 Alpha多样性 | 第49-50页 |
| 2.5.7 Beta多样性 | 第50页 |
| 2.5.8 主成分分析 | 第50页 |
| 2.5.9 文库构建和上机测序 | 第50-51页 |
| 2.5.10 信息分析流程 | 第51-52页 |
| 2.6 结果与分析 | 第52-62页 |
| 2.6.1 PCR扩增产物检测 | 第52-53页 |
| 2.6.2 高通量测序结果分析 | 第53-54页 |
| 2.6.3 物种注释 | 第54-58页 |
| 2.6.4 Alpha多样性分析 | 第58-60页 |
| 2.6.5 Beta多样性分析 | 第60页 |
| 2.6.6 PCA分析 | 第60-61页 |
| 2.6.7 聚类分析 | 第61-62页 |
| 2.7 讨论 | 第62-64页 |
| 第三章 不同地区奶疙瘩中乳酸菌的分离与鉴定 | 第64-79页 |
| 3.1 前言 | 第64页 |
| 3.2 材料与方法 | 第64页 |
| 3.2.1 样品 | 第64页 |
| 3.3 试剂与培养基 | 第64-65页 |
| 3.3.1 主要培养基 | 第64-65页 |
| 3.4 仪器与设备 | 第65页 |
| 3.5 实验方法 | 第65-68页 |
| 3.5.1 益生菌的分离 | 第65-66页 |
| 3.5.2 形态特征与生理生化特征 | 第66-67页 |
| 3.5.3 分子生物学鉴定 | 第67-68页 |
| 3.6 结果与分析 | 第68-76页 |
| 3.6.1 奶疙瘩中乳酸菌的筛选及其形态特征 | 第68-69页 |
| 3.6.2 生理生化特征 | 第69-74页 |
| 3.6.3 不同地区奶疙瘩16S rDNA鉴定及菌群差异性分析 | 第74-76页 |
| 3.7 讨论 | 第76-79页 |
| 第四章 不同地区奶疙瘩中乳酸菌益生特性的研究 | 第79-95页 |
| 4.1 前言 | 第79页 |
| 4.2 材料与方法 | 第79-80页 |
| 4.2.1 菌株 | 第79-80页 |
| 4.3 试剂与培养基 | 第80页 |
| 4.4 仪器与设备 | 第80-81页 |
| 4.5 实验方法 | 第81-85页 |
| 4.5.1 乳酸菌的耐酸性测定 | 第81页 |
| 4.5.2 耐胆盐性质测定 | 第81页 |
| 4.5.3 模拟胃液、肠液中的耐酸性测定 | 第81-82页 |
| 4.5.4 抑菌实验 | 第82页 |
| 4.5.5 乳酸菌自聚集特性测定 | 第82-83页 |
| 4.5.6 乳酸菌亲水性测定 | 第83页 |
| 4.5.7 抗氧化活性测定 | 第83-84页 |
| 4.5.8 脂肪降解实验 | 第84-85页 |
| 4.5.9 数据统计 | 第85页 |
| 4.6 结果与分析 | 第85-93页 |
| 4.6.1 耐酸和耐胆盐特性 | 第85-87页 |
| 4.6.2 模拟胃液、肠液耐受性测定 | 第87-89页 |
| 4.6.3 抑菌性 | 第89页 |
| 4.6.4 自聚集特性和表面疏水性 | 第89-91页 |
| 4.6.5 抗氧化性 | 第91-92页 |
| 4.6.6 胆固醇和甘油三酯降解特性 | 第92-93页 |
| 4.7 讨论 | 第93-95页 |
| 第五章 秀丽线虫动物模型的构建及对六株乳酸菌的抗衰老作用的评价研究 | 第95-115页 |
| 5.1 前言 | 第95-96页 |
| 5.2 材料与方法 | 第96页 |
| 5.2.1 菌株 | 第96页 |
| 5.3 试剂与培养基 | 第96-97页 |
| 5.4 仪器与设备 | 第97页 |
| 5.5 实验方法 | 第97-103页 |
| 5.5.1 秀丽线虫的一般培养 | 第97-99页 |
| 5.5.2 线虫的微量液体培养 | 第99页 |
| 5.5.3 线虫寿命的测定 | 第99-100页 |
| 5.5.4 线虫产卵量的观测 | 第100页 |
| 5.5.5 线虫运动能力的观测 | 第100页 |
| 5.5.6 线虫的抗氧化应激能力的测定 | 第100-101页 |
| 5.5.7 线虫的抗热应激能力的测定 | 第101页 |
| 5.5.8 超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和丙二醛(MDA)活力测定 | 第101-102页 |
| 5.5.9 数据分析 | 第102-103页 |
| 5.6 结果与分析 | 第103-113页 |
| 5.6.1 线虫的微量液体培养 | 第103-104页 |
| 5.6.2 不同菌株对线虫寿命的影响 | 第104-105页 |
| 5.6.3 不同菌株对线虫产卵量的影响 | 第105-106页 |
| 5.6.4 不同菌株对线虫运动能力的影响 | 第106-107页 |
| 5.6.5 不同菌株对线虫抗热激能力的影响 | 第107-109页 |
| 5.6.6 不同菌株对线虫抗氧化应激能力的影响 | 第109-110页 |
| 5.6.7 筛选得到的不同乳酸菌菌株对线虫生化指标的影响 | 第110-113页 |
| 5.7 讨论 | 第113-115页 |
| 第六章 L.rhamnosus R4对秀丽线虫相关生理活动的影响及其机理初探 | 第115-132页 |
| 6.1 前言 | 第115页 |
| 6.2 材料与方法 | 第115页 |
| 6.2.1 菌株 | 第115页 |
| 6.3 试剂与培养基 | 第115-116页 |
| 6.4 仪器与设备 | 第116页 |
| 6.5 实验方法 | 第116-118页 |
| 6.5.1 线虫寿命的测定 | 第116-117页 |
| 6.5.2 线虫产卵量的观测 | 第117页 |
| 6.5.3 线虫运动能力的观测 | 第117页 |
| 6.5.4 线虫抗氧化应激能力的测定 | 第117页 |
| 6.5.5 线虫抗热应激能力的测定 | 第117页 |
| 6.5.6 超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)和丙二醛(MDA)活力测定 | 第117页 |
| 6.5.7 乳酸菌在线虫肠道的菌数测定 | 第117-118页 |
| 6.5.8 脂肪颗粒染色实验 | 第118页 |
| 6.5.9 数据分析 | 第118页 |
| 6.6 结果与分析 | 第118-130页 |
| 6.6.1 L.rhamnosus R4对线虫寿命的影响 | 第118-120页 |
| 6.6.2 L.rhamnosus R4对线虫产卵量的影响 | 第120-121页 |
| 6.6.3 L.rhamnosus R4对线虫运动能力的影响 | 第121-122页 |
| 6.6.4 L.rhamnosus R4对线虫抵抗热应激和氧化应激的影响 | 第122-126页 |
| 6.6.5 L.rhamnosus R4对线虫生化指标的影响 | 第126-128页 |
| 6.6.6 线虫肠道内乳酸菌的菌数测定 | 第128-129页 |
| 6.6.7 乳酸菌对线虫脂肪沉积的影响 | 第129-130页 |
| 6.7 讨论 | 第130-132页 |
| 第七章 L.rhamnosus R4对秀丽线虫相关基因转录水平的影响 | 第132-158页 |
| 7.1 前言 | 第132-133页 |
| 7.2 材料与方法 | 第133页 |
| 7.3 试剂与培养基 | 第133页 |
| 7.4 仪器设备 | 第133-134页 |
| 7.5 实验方法 | 第134-141页 |
| 7.5.1 转录组重测序研究流程 | 第134-135页 |
| 7.5.2 测序数据过滤 | 第135-136页 |
| 7.5.3 参考基因组比对 | 第136页 |
| 7.5.4 新转录本预测 | 第136页 |
| 7.5.5 SNP和INDEL检测 | 第136页 |
| 7.5.6 差异剪接基因检测 | 第136-137页 |
| 7.5.7 基因表达量分析 | 第137页 |
| 7.5.8 差异表达基因检测 | 第137页 |
| 7.5.9 差异表达基因层次聚类分析 | 第137-138页 |
| 7.5.10 差异表达基因GO功能检测 | 第138页 |
| 7.5.11 差异表达基因pathway功能分析 | 第138页 |
| 7.5.12 实时定量RT-PCR实验 | 第138-141页 |
| 7.5.13 数据分析 | 第141页 |
| 7.6 结果与分析 | 第141-154页 |
| 7.6.1 测序后的reads质量 | 第141-142页 |
| 7.6.2 参考基因组比对结果 | 第142-143页 |
| 7.6.3 新转录本预测 | 第143页 |
| 7.6.4 SNP和INDEL检测 | 第143-144页 |
| 7.6.5 差异表达基因检测 | 第144页 |
| 7.6.6 差异表达基因GO功能分析 | 第144-147页 |
| 7.6.7 差异表达基因Pathway功能分析 | 第147-148页 |
| 7.6.8 L.rhamnosus R4对线虫体内代谢通路的影响 | 第148-149页 |
| 7.6.9 L.rhamnosus R4对线虫体内差异基因变化的影响及功能分析 | 第149-152页 |
| 7.6.10 R4菌株对线虫与寿命相关基因表达的影响 | 第152-154页 |
| 7.7 讨论 | 第154-158页 |
| 第八章 结论与展望 | 第158-163页 |
| 8.1 主要结论 | 第158-161页 |
| 8.2 主要创新点 | 第161-162页 |
| 8.3 展望 | 第162-163页 |
| 参考文献 | 第163-172页 |
| 致谢 | 第172-173页 |
| 作者简历 | 第173-174页 |
