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酿酒酵母Ras2蛋白的功能研究

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-10页
前言第10-11页
第一章 文献综述第11-37页
   ·G蛋白与细胞信号转导第11-12页
   ·RAS基因及其蛋白产物第12-14页
   ·CAMP信号通路的组成及作用第14-15页
   ·蛋白质的可逆磷酸化第15-17页
     ·蛋白激酶及蛋白磷酸酶第15-16页
     ·蛋白质可逆磷酸化对信号转导的调节方式及意义第16-17页
   ·酿酒酵母CAMP信号转导通路第17-26页
     ·G蛋白偶联的受体体系(Gp11-Gpa2)第18-19页
     ·Ras-cAMP 信号通路组成第19-25页
       ·Ras 蛋白第19-21页
       ·Cdc25 和Sdc25第21-22页
       ·Ira1 和Ira2第22-23页
       ·Cdc35/Cy11第23页
       ·Cap第23-24页
       ·Pde1 和Pde2第24-25页
     ·cAMP途径的主要靶标--cAMP依赖的蛋白激酶PKA第25-26页
   ·酿酒酵母RAS-CAMP信号通路的反馈抑制作用第26-28页
   ·酿酒酵母细胞中CAMP途径的生理作用第28-30页
     ·葡萄糖诱导的cAMP信号途径的激活对碳代谢的影响第28-29页
     ·葡萄糖激活cAMP信号通路的生理作用第29-30页
   ·RAS-CAMP途径和发酵生长培养基诱导的途径(FGM途径)第30-32页
     ·在葡萄糖和非发酵碳源上生长的细胞显示出相反表型第30-31页
     ·FGM途径与Ras-cAMP途径的重叠靶标特异性第31-32页
   ·RAS-CAMP途径/PKA活性与胁迫抗性第32-36页
     ·酿酒酵母的通用胁迫响应第32-33页
     ·胁迫抗性的获得与Ras-cAMP途径第33-36页
       ·cAMP-PKA途径与胁迫响应之间的关系第33-34页
       ·胁迫响应元件STRE第34-35页
       ·STRE的结合因子M5112p和M5114第35页
       ·胁迫条件与M5112p和 M5114p功第35-36页
     ·STRE调控基因和通用胁迫响应的生理任务第36页
   ·本研究的目的和内容第36-37页
第二章 材料与方法第37-63页
   ·实验材料第37-46页
     ·质粒、菌株与引物第37-41页
       ·质粒第37-38页
       ·菌株第38-39页
       ·引物第39-41页
     ·主要实验仪器第41页
     ·主要试剂第41-43页
     ·培养基第43-44页
     ·主要溶液第44-46页
   ·实验方法第46-63页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备与转化第46-47页
       ·CaC1_2 法第46页
       ·电转化法第46-47页
     ·小规模提取大肠杆菌质粒法(CTAB法)第47-48页
     ·酵母染色体的快速分离第48页
     ·PCR扩增反应第48-49页
     ·定点诱变PCR第49-50页
     ·融合PCR第50页
     ·DNA的限制酶消化第50-51页
     ·DNA的连接反应第51-52页
     ·DNA的琼脂糖凝胶电泳第52页
     ·从琼脂糖中回收DNA第52页
     ·酵母细胞的转化方法第52-53页
     ·质粒缺口修复(Gap-Repair)第53页
     ·酵母中质粒的回收第53-54页
     ·酵母交配型的验证第54页
     ·不同交配型酵母细胞之间的杂交第54页
     ·产孢及四分体孢子拆分第54-55页
     ·Dilution实验方法第55页
     ·热击实验方法第55-56页
       ·水浴热击第55页
       ·固体培养热击第55-56页
     ·cAMP定量测量第56-58页
       ·cAMP定量测量原理第56页
       ·样品采集第56-57页
       ·待测cAMP样品制备第57页
       ·试剂制备(Cyclic AMP[3H]分析系统试剂盒)第57页
       ·cAMP系列浓度标准溶液制备第57页
       ·测定方案第57-58页
       ·数据处理第58页
     ·蛋白质浓度的定量(Bio-Rad方法)第58-59页
     ·玻璃珠法提取酿酒酵母总蛋白第59页
     ·免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)第59-60页
     ·大肠杆菌BL21 中GST-RAD的诱导表达及总蛋白的超声提取第60页
     ·Sepharose Beads-GSH与融合蛋白GST-RAD结合第60-61页
     ·亲合产物与酵母总蛋白中Ras2-GTP的Pulldown第61页
     ·SDS-聚丙烯酰胺凝胶的制备第61-62页
     ·Western blot蛋白免疫实验第62-63页
第三章 RAS/PKA活性对细胞质粒保持性的影响第63-77页
   ·概述第63页
   ·实验结果与讨论第63-76页
     ·Ras/PKA活性在热击胁迫条件下对细胞质粒保持性的影响第63-68页
       ·质粒YCplac22-Ras2 和YCplac22-Ras2Va119 的构建第63-65页
       ·采用质粒缺口修复技术克隆Ras2 和Ras2Va119第65-67页
       ·Ras/PKA活性对热击胁迫条件下细胞质粒保持性的影响第67-68页
     ·Ras/PKA活性对氮源饥饿及泠击胁迫下细胞质粒保持性的影响第68-70页
     ·载体与Ras/PKA活性对热击胁迫下细胞质粒保持性的影响第70-74页
       ·质粒载体选择标记的影响第70-72页
       ·质粒载体类型的影响第72-74页
     ·细胞PKA水平对质粒保持性的影响第74-76页
   ·本章小结第76-77页
第四章 磷酸化作用对酿酒酵母RAS-CAMP信号途径反馈抑制第77-110页
   ·概述第77-78页
   ·实验结果与讨论第78-108页
     ·Ras2 蛋白磷酸化位点突变对细胞表型的影响第78-89页
       ·质粒和菌株的构建第78-84页
       ·Ras2 蛋白磷酸化位点突变对细胞表型的影响第84-89页
     ·Ras2 蛋白磷酸化位点突变对Ras2-GTP相对含量的影响第89-96页
       ·大肠杆菌表达质粒的构建及融合蛋白的表达、纯化和功能验证..第89-94页
       ·Ras2 蛋白磷酸化位点突变对Ras2-GTP相对含量的影响第94-96页
     ·PKA活性对Ras2-GTP相对含量的影响第96-99页
     ·碳源及PKA活性对Ras2-GTP相对含量的影响第99-100页
     ·碳源及PKA活性对Cdc25-Ras2 相互作用的影响第100-102页
     ·葡萄糖诱导下PKA的激活对Ras2-GTP水平及Cdc25-Ras2 相互作用的影响第102-103页
     ·磷酸化位点突变及PKA活性对Ras2 蛋白定位的影响第103-108页
       ·YCplac22-GFP-Ras2 等位基因质粒的构建第103-105页
       ·磷酸化位点突变及PKA活性对Ras2 蛋白定位的影响第105-108页
   ·本章小结第108-110页
第五章 RAS蛋白启动子对蛋白表达及细胞表型的影响第110-121页
   ·概述第110-111页
   ·实验结果与讨论第111-120页
     ·不同基因背景下RAS1 或Ras2 对细胞热击敏感性和碳代谢的影响第111-112页
       ·菌株的构建第111页
       ·不同基因背景下RAS1 或Ras2 对细胞热击胁迫抗性和碳代谢的影响第111-112页
     ·RAS1 与Ras2 启动子效率的比较研究第112-120页
       ·质粒的构建第113-117页
       ·不同启动子对细胞在非发酵碳源上生长情况的影响第117-119页
       ·RAS1p,Ras2p在葡萄糖激活Ras-cAMP 信号途径中的作用第119-120页
       ·Westen实验检验启动子对蛋白表达量的影响第120页
   ·本章小结第120-121页
第六章 总结与展望第121-124页
   ·主要工作总结第121-122页
   ·相关工作的展望第122-124页
参考文献第124-136页
附录1 生化名词缩写第136-137页
附录2 基因及其相应编码产物第137-138页
致谢第138页

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