| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 0 前言 | 第13-25页 |
| 0.1 软体类过敏原研究进展 | 第13-17页 |
| 0.1.1 食物过敏现象 | 第13页 |
| 0.1.2 软体类过敏原种类及性质 | 第13-14页 |
| 0.1.3 软体类过敏原克隆概况 | 第14-16页 |
| 0.1.4 软体类过敏原交叉反应性 | 第16-17页 |
| 0.1.5 软体类过敏原的过敏差异性 | 第17页 |
| 0.2 生物信息学分析 | 第17-22页 |
| 0.2.1 生物信息学概论 | 第17-18页 |
| 0.2.2 生物信息学在过敏原研究中的应用 | 第18-22页 |
| 0.2.2.1 过敏原同源性分析 | 第19-20页 |
| 0.2.2.2 免疫原性及交叉反应性分析 | 第20-21页 |
| 0.2.2.3 序列微不均一性分析 | 第21-22页 |
| 0.3 研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 0.4 研究内容和技术路线 | 第23-25页 |
| 0.4.1 研究内容 | 第23-24页 |
| 0.4.2 技术路线 | 第24-25页 |
| 1 软体类海产品原肌球蛋白 cDNA 克隆 | 第25-40页 |
| 1.1 引言 | 第25-26页 |
| 1.2 仪器与试剂 | 第26-27页 |
| 1.2.1 实验主要仪器 | 第26页 |
| 1.2.2 实验材料 | 第26页 |
| 1.2.3 实验试剂 | 第26-27页 |
| 1.3 实验方法 | 第27-34页 |
| 1.3.1 扇贝柱肌肉组织总 RNA 的提取 | 第27-28页 |
| 1.3.2 cDNA 第一链的反转录反应 | 第28-29页 |
| 1.3.3 原肌球蛋白 cDNA 部分序列的克隆 | 第29-32页 |
| 1.3.3.1 引物设计 | 第29-30页 |
| 1.3.3.2 PCR 扩增 | 第30页 |
| 1.3.3.3 PCR 扩增产物胶回收 | 第30-31页 |
| 1.3.3.4 大肠杆菌 DH5α感受态的制备 | 第31页 |
| 1.3.3.5 外源片段的连接转化 | 第31-32页 |
| 1.3.3.6 重组子的筛选 | 第32页 |
| 1.3.3.7 阳性重组子菌株的保存及测序 | 第32页 |
| 1.3.4 原肌球蛋白 cDNA 序列的 3 端 RACE 克隆 | 第32-33页 |
| 1.3.4.1 引物设计 | 第32-33页 |
| 1.3.4.2 PCR 扩增及测序 | 第33页 |
| 1.3.5 原肌球蛋白 cDNA 全长序列的克隆 | 第33-34页 |
| 1.3.5.1 引物设计 | 第33-34页 |
| 1.3.5.2 PCR 扩增及测序 | 第34页 |
| 1.4 结果与讨论 | 第34-39页 |
| 1.4.1 扇贝柱肌肉组织总 RNA 的提取及 cDNA 的合成 | 第34-35页 |
| 1.4.2 原肌球蛋白 cDNA 部分序列的克隆 | 第35-36页 |
| 1.4.3 原肌球蛋白 cDNA 序列的 3 端 RACE 克隆 | 第36-37页 |
| 1.4.4 原肌球蛋白 cDNA 全长序列的克隆 | 第37-39页 |
| 1.5 小结 | 第39-40页 |
| 2 软体类海产品原肌球蛋白结构预测及分析 | 第40-53页 |
| 2.1 引言 | 第40-42页 |
| 2.2 实验材料 | 第42页 |
| 2.3 实验方法 | 第42-43页 |
| 2.3.1 二级结构分析 | 第42页 |
| 2.3.2 蛋白性质分析 | 第42页 |
| 2.3.3.1 亲疏水性分析 | 第42页 |
| 2.3.3.2 可及性分析 | 第42页 |
| 2.3.3.3 可塑性分析 | 第42页 |
| 2.3.3.4 抗原性指数分析 | 第42页 |
| 2.3.3 空间结构的模拟 | 第42-43页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第43-52页 |
| 2.4.1 二级结构分析 | 第43-45页 |
| 2.4.2 蛋白性质分析 | 第45-48页 |
| 2.4.2.1 亲疏水性分析 | 第45-46页 |
| 2.4.2.2 溶剂可及性分析 | 第46-47页 |
| 2.4.2.3 可塑性分析 | 第47-48页 |
| 2.4.2.4 抗原指数分析 | 第48页 |
| 2.4.3 空间结构的模拟 | 第48-52页 |
| 2.5 小结 | 第52-53页 |
| 3 软体类海产品原肌球蛋白同源性及序列微不均一性分析 | 第53-81页 |
| 3.1 引言 | 第53-54页 |
| 3.2 实验材料 | 第54页 |
| 3.3 实验方法 | 第54-57页 |
| 3.3.1 软体类海产品原肌球蛋白序列相似性分析 | 第54-55页 |
| 3.3.2 软体类海产品原肌球蛋白二级结构比对分析 | 第55页 |
| 3.3.3 软体类海产品原肌球蛋白氨基酸性质比对分析 | 第55页 |
| 3.3.4 软体类海产品原肌球蛋白空间结构比对分析 | 第55-56页 |
| 3.3.5 软体类海产品原肌球蛋白微不均一性分析 | 第56-57页 |
| 3.3.5.1 多序列比对与微不均一性分析 | 第56页 |
| 3.3.5.2 由单个氨基酸残基突变引起的蛋白质序列稳定性改变的预测分析 | 第56-57页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第57-79页 |
| 3.4.1 软体类海产品原肌球蛋白序列相似性分析 | 第57-61页 |
| 3.4.2 软体类海产品原肌球蛋白二级结构比对分析 | 第61-65页 |
| 3.4.3 软体类海产品原肌球蛋白性质比对分析 | 第65-70页 |
| 3.4.3.1 蛋白基本性质比较分析 | 第65-67页 |
| 3.4.3.2 亲疏水性比较分析 | 第67-68页 |
| 3.4.3.3 溶剂可及性比对分析 | 第68-69页 |
| 3.4.3.4 可塑性比对分析 | 第69页 |
| 3.4.3.5 抗原指数比对分析 | 第69-70页 |
| 3.4.4 软体类海产品原肌球蛋白空间结构比对分析 | 第70页 |
| 3.4.5 软体类海产品原肌球蛋白序列微不均一性分析 | 第70-79页 |
| 3.4.5.1 软体类海产品原肌球蛋白序列微不均一性情况 | 第70-71页 |
| 3.4.5.2 序列微不均一性的氨基酸突变分析 | 第71-79页 |
| 3.5 小结 | 第79-81页 |
| 6 结论与创新点 | 第81-83页 |
| 7 展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 个人简历 | 第92-93页 |
| 发表的学术论文 | 第93-94页 |
