| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-10页 |
| 缩略语表 | 第11-15页 |
| 第1章 绪论 | 第15-30页 |
| 1 自然发酵辣椒研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1 辣椒概述 | 第15页 |
| 1.2 自然发酵辣椒概述 | 第15-16页 |
| 2 发酵蔬菜中微生物多样性的研究进展 | 第16-23页 |
| 2.1 微生物多样性概述 | 第16-17页 |
| 2.2 发酵蔬菜中微生物多样性的研究方法 | 第17-23页 |
| 3 高通量测序技术的应用研究进展 | 第23-27页 |
| 3.1 高通量测序技术在研究食品微生物多样性中的应用 | 第23-25页 |
| 3.2 高通量测序技术在宏转录组学中的应用 | 第25-27页 |
| 4 研究意义 | 第27-28页 |
| 5 研究内容 | 第28-29页 |
| 6 技术路线 | 第29-30页 |
| 第2章 线椒和米椒发酵前后细菌多样性研究 | 第30-52页 |
| 1 材料与方法 | 第31-35页 |
| 1.1 试验材料 | 第31页 |
| 1.2 试验方法 | 第31-35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-50页 |
| 2.1 线椒和米椒的理化指标测定结果 | 第35-37页 |
| 2.2 细菌16SrRNA基因V1-V3区PCR扩增结果 | 第37-38页 |
| 2.3 细菌454焦磷酸测序数据统计结果 | 第38-40页 |
| 2.4 线椒和米椒发酵前后细菌多样性研究结果 | 第40-42页 |
| 2.5 线椒和米椒发酵前后细菌群落结构分析结果 | 第42-47页 |
| 2.6 线椒和米椒发酵前后细菌OTUs主成分分析结果 | 第47页 |
| 2.7 基于细菌OTUs的Heatmap分析结果 | 第47-50页 |
| 3 讨论 | 第50-51页 |
| 4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第3章 线椒和米椒发酵前后真菌多样性研究 | 第52-67页 |
| 1 材料与方法 | 第52-53页 |
| 1.1 试验材料 | 第52页 |
| 1.2 试验方法 | 第52-53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-65页 |
| 2.1 真菌18SrRNA基因PCR扩增结果 | 第53-54页 |
| 2.2 真菌高通量测序数据统计结果 | 第54-57页 |
| 2.3 线椒和米椒发酵前后真菌多样性研究结果 | 第57-59页 |
| 2.4 线椒和米椒发酵前后真菌群落结构研究结果 | 第59-61页 |
| 2.5 线椒和米椒发酵前后真菌OTUs的主成分分析结果 | 第61-62页 |
| 2.6 线椒和米椒发酵前后真菌OTUs的Heatmap分析 | 第62-65页 |
| 3 讨论 | 第65-66页 |
| 4 本章小结 | 第66-67页 |
| 第4章 线椒发酵前后微生物宏转录组文库的构建及物种注释 | 第67-85页 |
| 1 材料与方法 | 第67-71页 |
| 1.1 试验材料 | 第67-68页 |
| 1.2 试验方法 | 第68-71页 |
| 2 结果与分析 | 第71-82页 |
| 2.1 RNA质量评价结果 | 第71-73页 |
| 2.2 测序量统计结果 | 第73-74页 |
| 2.3 测序数据处理结果 | 第74-75页 |
| 2.4 非冗余基因物种注释结果 | 第75-82页 |
| 3 讨论 | 第82-83页 |
| 4 本章小结 | 第83-85页 |
| 第5章 线椒发酵前后微生物非冗余基因功能注释和差异表达分析 | 第85-123页 |
| 1 材料与方法 | 第85-87页 |
| 1.1 试验材料 | 第85页 |
| 1.2 试验方法 | 第85-87页 |
| 2 结果与分析 | 第87-120页 |
| 2.1 非冗余基因功能注释结果 | 第87-94页 |
| 2.2 亚硝酸盐代谢相关功能基因KEGG注释结果 | 第94-96页 |
| 2.3 氨基酸代谢相关功能基因KEGG注释结果 | 第96-105页 |
| 2.4 乳酸合成相关基因功能注释 | 第105-110页 |
| 2.5 自然发酵辣椒质构变化相关基因功能注释 | 第110-113页 |
| 2.6 自然发酵辣椒颜色变化相关基因功能注释结果 | 第113-114页 |
| 2.7 新鲜线椒与自然发酵第20d的线椒微生物差异表达基因分析结果 | 第114-120页 |
| 3 讨论 | 第120-121页 |
| 4 本章小结 | 第121-123页 |
| 第6章 结论与展望 | 第123-129页 |
| 1 本文主要结论 | 第123-127页 |
| 2 本文创新点 | 第127页 |
| 3 研究展望 | 第127-129页 |
| 参考文献 | 第129-144页 |
| 附表 | 第144-150页 |
| 附图 | 第150-152页 |
| 致谢 | 第152-153页 |
| 作者简介 | 第153-155页 |
