| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 1 引言 | 第13-37页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-14页 |
| 1.2 酿酒葡萄微生物群落结构多样性研究进展 | 第14-19页 |
| 1.2.1 酿酒葡萄根际、叶际微生物群落结构多样性研究进展 | 第14-17页 |
| 1.2.2 酿酒葡萄表皮微生物群落结构多样性研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3 微生物群落结构多样性研究方法 | 第19-25页 |
| 1.3.1 传统的培养分离方法 | 第19-20页 |
| 1.3.2 限制性片段长度多态性技术 | 第20页 |
| 1.3.3 克隆文库法 | 第20-21页 |
| 1.3.4 PCR-DGGE与PCR-TGGE技术 | 第21页 |
| 1.3.5 单链构象多态性分析（SSCP） | 第21-22页 |
| 1.3.6 核酸杂交技术 | 第22页 |
| 1.3.7 高通量测序技术 | 第22-25页 |
| 1.4 同位素标记代谢流研究概述 | 第25-31页 |
| 1.4.1 基于稳定同位素标记(SILAC)的蛋白质定量方法研究 | 第26页 |
| 1.4.2 基于~(13)C标记研究进展 | 第26-28页 |
| 1.4.3 基于~(15)N标记研究进展 | 第28-31页 |
| 1.5 微生物氮的利用对葡萄酒安全的影响 | 第31-35页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第35页 |
| 1.7 研究内容和技术路线 | 第35-37页 |
| 1.7.1 研究内容 | 第35-36页 |
| 1.7.2 技术路线 | 第36-37页 |
| 2 不同品种酿酒葡萄根际、叶际细菌群落结构特点解析 | 第37-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第38-41页 |
| 2.1.1 主要试剂或仪器 | 第38页 |
| 2.1.2 样品采集及处理 | 第38-40页 |
| 2.1.3 细菌16S rRNA基因的扩增和酶切 | 第40-41页 |
| 2.1.4 毛细管电泳 | 第41页 |
| 2.1.5 数据分析 | 第41页 |
| 2.2 结果与分析 | 第41-48页 |
| 2.2.1 不同品种酿酒葡萄根际、叶际细菌群落T-RFLP多态性分析 | 第41-43页 |
| 2.2.2 不同品种酿酒葡萄根际、叶际细菌群落多样性的变化 | 第43-48页 |
| 2.3 和氮利用有关微生物 | 第48-49页 |
| 2.4 本章小结 | 第49-51页 |
| 3 不同品种酿酒葡萄表皮微生物群落多样性分析 | 第51-71页 |
| 3.1 材料与方法 | 第51-54页 |
| 3.1.1 样地概况 | 第51页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第51-52页 |
| 3.1.3 样品采集 | 第52页 |
| 3.1.4 土壤理化指标 | 第52-53页 |
| 3.1.5 总DNA提取 | 第53页 |
| 3.1.6 引物比较 | 第53-54页 |
| 3.1.7 PCR扩增和测序 | 第54页 |
| 3.2 数据分析 | 第54-55页 |
| 3.2.1 数据质控及OTU划分 | 第54-55页 |
| 3.2.2 丰富度和多样性分析 | 第55页 |
| 3.2.3 物种信息注释 | 第55页 |
| 3.3 实验结果 | 第55-66页 |
| 3.3.1 PCR引物扩增效率 | 第55-56页 |
| 3.3.2 测序后的数据分析 | 第56页 |
| 3.3.3 有效序列及OTU统计 | 第56-57页 |
| 3.3.4 丰富度和多样性分析 | 第57-59页 |
| 3.3.5 细菌和真菌类群分析 | 第59-61页 |
| 3.3.6 不同品种葡萄微生物群落之间的差异性 | 第61-62页 |
| 3.3.7 中心OTU及最相似序列分析 | 第62-65页 |
| 3.3.8 酿酒葡萄品种与环境因子的相关性分析 | 第65页 |
| 3.3.9 与氮利用有关的细菌基因功能 | 第65-66页 |
| 3.4 讨论 | 第66-70页 |
| 3.4.1 高通量测序技术是分析微生物群落的有力工具 | 第66-68页 |
| 3.4.2 不同品种酿酒葡萄优势菌群存在差异 | 第68-69页 |
| 3.4.3 微生物群落及其对葡萄酒酿造的影响 | 第69-70页 |
| 3.4.4 与氮利用有关的微生物 | 第70页 |
| 3.5 本章小结 | 第70-71页 |
| 4 葡萄土壤、叶际、果实表面附生微生物群落多样性演变及其关系 | 第71-91页 |
| 4.1 材料和方法 | 第71-74页 |
| 4.1.1 样地描述和取样设计 | 第71-72页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第72页 |
| 4.1.3 土壤取样 | 第72页 |
| 4.1.4 叶片和浆果取样 | 第72-73页 |
| 4.1.5 DNA提取 | 第73页 |
| 4.1.6 PCR扩增和测序 | 第73页 |
| 4.1.7 数据分析 | 第73-74页 |
| 4.2 结果分析 | 第74-84页 |
| 4.2.1 丰富度和多样性分析 | 第74-75页 |
| 4.2.2 微生物群落结构分析 | 第75-79页 |
| 4.2.3 中心OTU和最相似菌种分析 | 第79-84页 |
| 4.3 共有OTU的比较 | 第84-85页 |
| 4.4 LEfse分析 | 第85-87页 |
| 4.5 讨论 | 第87-89页 |
| 4.5.1 比较不同环境系统的微生物多样性 | 第87-88页 |
| 4.5.2 环境变化促进了生物系统多样性 | 第88-89页 |
| 4.6 本章小结 | 第89-91页 |
| 5 酿酒葡萄氮代谢通量研究 | 第91-109页 |
| 5.1 材料与方法 | 第92-97页 |
| 5.1.1 仪器与试剂 | 第92页 |
| 5.1.2 培养基及菌株生长 | 第92-93页 |
| 5.1.3 样品前处理 | 第93-94页 |
| 5.1.4 色谱条件 | 第94-96页 |
| 5.1.5 发酵液生长情况分析 | 第96-97页 |
| 5.2 结果与分析 | 第97-102页 |
| 5.2.1 色谱分离 | 第97-99页 |
| 5.2.2 HPLC对同位素分馏的影响 | 第99-100页 |
| 5.2.3 测定的准确性及稳定性 | 第100-101页 |
| 5.2.4 ~(15)N标记的无机氮源探索 | 第101-102页 |
| 5.3 N代谢通量分析 | 第102-108页 |
| 5.3.1 生化反应的数学表示 | 第102-103页 |
| 5.3.2 质量同模子关系构建 | 第103-105页 |
| 5.3.3 代谢网络模型的建立 | 第105-106页 |
| 5.3.4 标记L-精氨酸发酵过程中氮代谢通量分析 | 第106-108页 |
| 5.3.4.1 氨基酸收集与标记实验 | 第106-107页 |
| 5.3.4.2 ~(15)N精氨酸发酵过程中氮代谢通量分析 | 第107-108页 |
| 5.4 本章小结 | 第108-109页 |
| 6 研究结论、创新点与展望 | 第109-113页 |
| 6.1 研究结论 | 第109-110页 |
| 6.2 研究特色与创新点 | 第110页 |
| 6.3 展望 | 第110-113页 |
| 参考文献 | 第113-131页 |
| 致谢 | 第131-133页 |
| 作者简介 | 第133-134页 |
