摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
1 引言 | 第9-14页 |
1.1 乳酸菌 | 第9页 |
1.2 肠膜明串株菌 | 第9-10页 |
1.3 传统发酵乳制品 | 第10页 |
1.4 多位点序列分型技术 | 第10-13页 |
1.4.1 多位点序列分型技术概述 | 第10-11页 |
1.4.2 多位点序列分型技术在乳酸菌分型中的应用 | 第11-13页 |
1.5 研究基础、目的及意义 | 第13-14页 |
2 材料与方法 | 第14-23页 |
2.1 试验材料 | 第14-19页 |
2.1.1 样品来源 | 第14-17页 |
2.1.2 试验所用试剂 | 第17-18页 |
2.1.3 主要试验仪器设备 | 第18页 |
2.1.4 生物信息学分析软件 | 第18-19页 |
2.2 试验方法 | 第19-23页 |
2.2.1 菌株培养 | 第19页 |
2.2.2 提取基因组DNA | 第19页 |
2.2.3 基因组DNA检测 | 第19-20页 |
2.2.4 持家基因PCR扩增 | 第20-22页 |
2.2.5 测序及序列分析 | 第22页 |
2.2.6 生物信息学分析 | 第22-23页 |
3 结果与分析 | 第23-38页 |
3.1 DNA检测结果 | 第23页 |
3.2 持家基因扩增结果 | 第23-25页 |
3.3 9个持家基因的测序结果 | 第25-26页 |
3.4 生物信息学软件分析结果 | 第26-38页 |
3.4.1 MLST分型结果 | 第26-29页 |
3.4.2 等位基因多样性分析 | 第29-30页 |
3.4.3 等位基因序列重组分析 | 第30-32页 |
3.4.4 不同ST型的eBURST分析结果 | 第32-34页 |
3.4.5 最小生成树结果分析 | 第34-36页 |
3.4.6 聚类分析结果 | 第36-38页 |
4 结论 | 第38-39页 |
致谢 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-45页 |
作者简介 | 第45页 |