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菊糖果糖转移酶晶体结构及超高压对其构象和功能影响

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第11-27页
    1.1 引言第11页
    1.2 菊糖果糖转移酶概述第11-15页
        1.2.1 菊糖果糖转移酶微生物来源及性质第11-13页
        1.2.2 菊糖果糖转移酶结构及催化机制第13-15页
    1.3 调控酶活性的物理化学以及生物学方法第15页
    1.4 超高压生物技术研究进展第15-17页
        1.4.1 超高压生物技术概念、特点及其发展第15-16页
        1.4.2 超高压生物技术应用第16-17页
    1.5 超高压对酶影响及其可能作用机制第17-21页
        1.5.1 超高压对酶催化能力影响第17-19页
        1.5.2 超高压对酶热稳定性影响第19页
        1.5.3 超高压对酶构象影响第19-20页
        1.5.4 超高压作用酶分子机制第20-21页
    1.6 酶结构研究方法第21-25页
        1.6.1 结晶衍射法第21-23页
        1.6.2 光谱技术第23-24页
        1.6.3 分子动力学模拟第24-25页
    1.7 本课题立题依据、研究意义及主要研究内容第25-27页
        1.7.1 立题依据和研究意义第25页
        1.7.2 本论文研究内容第25-27页
第二章 IFTase晶体结构第27-43页
    2.1 引言第27页
    2.2 材料与方法第27-30页
        2.2.1 主要试剂第27页
        2.2.2 主要仪器第27页
        2.2.3 IFTase制备及分离纯化第27-28页
        2.2.4 蛋白纯度鉴定第28页
        2.2.5 蛋白浓度确定第28-29页
        2.2.6 酶活测定第29页
        2.2.7 结晶方法第29页
        2.2.8 X-衍射晶体数据收集及结构解析与模型修正第29页
        2.2.9 定点突变第29-30页
        2.2.10 IFTase及突变体热稳定性检测第30页
        2.2.11 数据处理第30页
    2.3 结果与讨论第30-41页
        2.3.1 IFTase制备与分离纯化第30-31页
        2.3.2 结晶条件筛选以及衍射数据收集第31-33页
        2.3.3 IFTase及IFTase-GF4复合物结构分析第33-37页
        2.3.4 讨论第37-41页
    2.4 本章小结第41-43页
第三章 超高压下IFTase的活性和构象第43-62页
    3.1 引言第43页
    3.2 材料与方法第43-47页
        3.2.1 主要试剂第43-44页
        3.2.2 主要仪器第44页
        3.2.3 超高压处理IFTase溶液第44页
        3.2.4 不同温度处理IFTase溶液第44页
        3.2.5 盐酸胍处理IFTase溶液第44页
        3.2.6 酶活测定第44页
        3.2.7 SDS-PAGE第44页
        3.2.8 圆二色谱(CD)第44-45页
        3.2.9 内源荧光第45页
        3.2.10 表面疏水性第45页
        3.2.11 体积排阻色谱第45-46页
        3.2.12 粒径分析第46页
        3.2.13 原子力显微镜(AFM)第46页
        3.2.14 LC-MS第46页
        3.2.15 分子动力学模拟第46-47页
        3.2.16 数据处理第47页
    3.3 结果与讨论第47-61页
        3.3.1 超高压处理对IFTase酶活影响第47-49页
        3.3.2 超高压处理对IFTase构象影响第49-58页
        3.3.3 压力处理、温度处理、变性剂处理后IFTase构象比较第58-61页
    3.4 本章小结第61-62页
第四章 山梨糖醇对IFTase高压稳定性的调节第62-69页
    4.1 引言第62页
    4.2 材料与方法第62-63页
        4.2.1 主要试剂第62页
        4.2.2 主要仪器第62页
        4.2.3 IFTase-糖/糖醇复合物制备第62-63页
        4.2.4 超高压处理方法第63页
        4.2.5 酶活测定第63页
        4.2.6 粘度测定第63页
        4.2.7 水分活度确定第63页
        4.2.8 圆二色谱第63页
        4.2.9 内源荧光第63页
        4.2.10 紫外吸收光谱第63页
        4.2.11 数据处理第63页
    4.3 结果与讨论第63-68页
        4.3.1 不同种类糖及浓度对IFTase压力稳定性影响第63-64页
        4.3.2 山梨糖醇对IFTase构象稳定作用第64-66页
        4.3.3 可能机制分析第66-68页
    4.4 本章小结第68-69页
第五章 超高压下IFTase的热稳定性第69-79页
    5.1 引言第69页
    5.2 材料与方法第69-71页
        5.2.1 主要试剂第69页
        5.2.2 主要仪器第69-70页
        5.2.3 高压高温处理IFTase第70页
        5.2.4 超高压下热失活及热失活动力学第70页
        5.2.5 IFTase酶活测定第70页
        5.2.6 圆二色谱第70页
        5.2.7 内源荧光第70页
        5.2.8 原子力显微镜第70页
        5.2.9 体积排阻色谱第70页
        5.2.10 二硫键含量测定第70-71页
        5.2.11 SDS-PAGE第71页
        5.2.12 β-巯基乙醇对IFTase影响第71页
        5.2.13 数据处理第71页
    5.3 结果与讨论第71-78页
        5.3.1 超高压提高IFTase热稳定性作用第71-73页
        5.3.2 超高压处理后IFTase构象分析第73-76页
        5.3.3 讨论:分子机制第76-78页
    5.4 本章小结第78-79页
第六章 超高压下IFTase的催化反应第79-90页
    6.1 引言第79页
    6.2 材料与方法第79-81页
        6.2.1 主要试剂第79页
        6.2.2 主要仪器第79页
        6.2.3 压力对IFTase催化反应影响第79页
        6.2.4 超高压下IFTase最适反应温度的确定第79-80页
        6.2.5 超高压下IFTase最适反应pH的确定第80页
        6.2.6 超高压下金属离子对IFTase催化反应的影响第80页
        6.2.7 在超高压下无机盐对IFTase催化反应的影响第80页
        6.2.8 超高压下IFTase催化动力学及热动力学参数计算第80-81页
        6.2.9 DFAIII含量的确定及催化反应速度的计算第81页
        6.2.10 数据处理第81页
    6.3 结果与讨论第81-89页
        6.3.1 超高压下对IFTase催化反应速度的影响第81-82页
        6.3.2 超高压下IFTase催化反应最适温度的变化第82-83页
        6.3.3 超高压下IFTase催化反应最适pH的变化第83页
        6.3.4 超高压下金属离子对IFTase催化反应的影响第83-84页
        6.3.5 超高压下无机盐对IFTase催化反应的影响第84-85页
        6.3.6 在超高压下IFTase催化反应热动力学参数变化第85-89页
    6.4 本章小结第89-90页
主要结论与展望第90-92页
    主要结论第90页
    展望第90-92页
论文创新点第92-93页
致谢第93-94页
参考文献第94-103页
附录:作者在攻读博士学位期间发表的论文第103页

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