| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-26页 |
| 1.1 概述 | 第11-19页 |
| 1.1.1 Surfactin的结构与活性 | 第11-14页 |
| 1.1.2 Surfactin的工应用价值 | 第14-16页 |
| 1.1.3 枯草芽孢杆菌surfactin的合成与调控 | 第16-19页 |
| 1.2 Surfactin的国内外研究现状 | 第19-22页 |
| 1.2.1 Surfactin高效合成策略 | 第19-21页 |
| 1.2.2 Surfactin作为信号分子在芽孢杆菌细胞分化中的天然功能 | 第21-22页 |
| 1.3 本研究主要研究内容 | 第22-26页 |
| 1.3.1 本研究立项依据及研究意义 | 第22-24页 |
| 1.3.2 本论文主要研究内容 | 第24-26页 |
| 第二章 Surfactin高产菌株的筛选鉴定及其发酵特性研究 | 第26-51页 |
| 2.1 前言 | 第26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-31页 |
| 2.2.1 大曲样品 | 第26页 |
| 2.2.2 主要试剂和仪器 | 第26页 |
| 2.2.3 培养基和菌种 | 第26-27页 |
| 2.2.4 菌株筛选和分析方法 | 第27-29页 |
| 2.2.5 菌株B. amyloliquefaciens 1-45 的发酵条件优化 | 第29-31页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第31-49页 |
| 2.3.1 菌株初筛与分子鉴定 | 第31-33页 |
| 2.3.2 菌株复筛摇瓶培养及其产surfactin的定性定量分析 | 第33-36页 |
| 2.3.3 高产菌种B. amyloliquefaciens 1-45 的形态和进化分析 | 第36-38页 |
| 2.3.4 高产菌株B. amyloliquefaciens 1-45 的发酵条件优化 | 第38-49页 |
| 2.4 本章小结 | 第49-51页 |
| 第三章 Surfactin在酿造大曲中的抗菌功能 | 第51-67页 |
| 3.1 前言 | 第51页 |
| 3.2 材料与方法 | 第51-55页 |
| 3.2.1 试剂和仪器 | 第51页 |
| 3.2.2 微生物菌株和培养条件 | 第51-52页 |
| 3.2.3 大曲芽孢杆菌对不良风味链霉菌的抑制效应 | 第52页 |
| 3.2.4 大曲芽孢杆菌与S. sampsonii的相互作用关系研究 | 第52-53页 |
| 3.2.5 链霉菌生长和geosmin含量的测定 | 第53-54页 |
| 3.2.6 抗菌素的分析方法 | 第54页 |
| 3.2.7 菌株 2-16 和 1-45 对geosmin的去除能力研究 | 第54-55页 |
| 3.2.8 统计分析 | 第55页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第55-65页 |
| 3.3.1 大曲中天然抑制S. sampsonii的微生物鉴定 | 第55-58页 |
| 3.3.2 大曲芽孢杆菌与链霉菌的相互作用关系研究 | 第58-60页 |
| 3.3.3 菌株 2-16 和 1-45 抗菌代谢物分析 | 第60-63页 |
| 3.3.4 HPLC纯化脂肽对S. sampsonii的抑制作用 | 第63-64页 |
| 3.3.5 菌株 2-16 和 1-45 对geosmin的消除作用 | 第64-65页 |
| 3.4 本章小结 | 第65-67页 |
| 第四章 大曲内部芽孢杆菌相互作用关系研究 | 第67-79页 |
| 4.1 前言 | 第67页 |
| 4.2 材料与方法 | 第67-69页 |
| 4.2.1 试剂与仪器 | 第67页 |
| 4.2.2 微生物和培养基 | 第67-68页 |
| 4.2.3 发酵实验设计 | 第68页 |
| 4.2.4 分析方法 | 第68-69页 |
| 4.2.5 数据处理 | 第69页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第69-76页 |
| 4.3.1 大曲中产surfactin与产水解酶芽孢杆菌的功能分化 | 第69-71页 |
| 4.3.2 大曲中高产surfactin与高产水解酶芽孢杆菌的相互作用关系 | 第71-72页 |
| 4.3.3 不同功能大曲芽孢杆菌协同发酵优化提高surfactin产量 | 第72-76页 |
| 4.4 特殊环境中微生物相互作用关系与功能定向强化的思考 | 第76-77页 |
| 4.5 本章小结 | 第77-79页 |
| 第五章 基于比较基因组与转录组学的surfactin高产机制解析 | 第79-98页 |
| 5.1 前言 | 第79页 |
| 5.2 材料与方法 | 第79-82页 |
| 5.2.1 菌株 | 第79页 |
| 5.2.2 试剂和仪器 | 第79页 |
| 5.2.3 培养基和培养条件 | 第79页 |
| 5.2.4 细胞生长和surfactin含量测定 | 第79-80页 |
| 5.2.5 基因组研究 | 第80-81页 |
| 5.2.6 转录组研究 | 第81-82页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第82-97页 |
| 5.3.1 B. amyloliquefaciens MT45和DSM7T菌体生长和产surfactin能力的比较分析 | 第82-84页 |
| 5.3.2 基因组和比较基因组分析 | 第84-87页 |
| 5.3.3 转录组分析 | 第87-90页 |
| 5.3.4 从头构建B. amyloliquefaciens MT45生物合成surfactin的KEGG途径 | 第90-93页 |
| 5.3.5 基于时间序列表达趋势的srfA转录调控分析 | 第93-97页 |
| 5.4 本章小结 | 第97-98页 |
| 第六章 基因组优化构建surfactin高效合成细胞工厂 | 第98-119页 |
| 6.1 前言 | 第98页 |
| 6.2 材料与方法 | 第98-106页 |
| 6.2.1 质粒、菌株与引物 | 第98-100页 |
| 6.2.2 试剂和药品 | 第100-101页 |
| 6.2.3 仪器和设备 | 第101页 |
| 6.2.4 培养基 | 第101-102页 |
| 6.2.5 DNA操作 | 第102-105页 |
| 6.2.6 分析方法 | 第105-106页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第106-117页 |
| 6.3.1 B. subtilis整合片段的高效融合方法建立 | 第106-107页 |
| 6.3.2 敲除竞争途径对surfactin合成的影响 | 第107-109页 |
| 6.3.3 过量表达抗性基因对surfactin合成的影响 | 第109-111页 |
| 6.3.4 强化支链脂肪酸合成途径对surfactin合成的影响 | 第111-114页 |
| 6.3.5 强化乙酰CoA供应对surfactin合成的影响 | 第114-115页 |
| 6.3.6 提高srfA转录水平对surfactin合成的影响 | 第115-117页 |
| 6.4 本章小结 | 第117-119页 |
| 主要结论与展望 | 第119-121页 |
| 主要结论 | 第119-120页 |
| 展望 | 第120-121页 |
| 论文主要创新点 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-138页 |
| 附录Ⅰ: 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第138-139页 |
| 附录Ⅱ: 附表 | 第139-148页 |
