| 摘要 | 第2-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 符号说明 | 第11-13页 |
| 综述 | 第13-22页 |
| 1 前言 | 第13页 |
| 2 猪李斯特菌病流行现状 | 第13页 |
| 3 Lm沿生猪产业链的传播 | 第13-15页 |
| 3.1 养殖环节的Lm流行特点 | 第13-14页 |
| 3.2 Lm在生猪屠宰链中的流行情况 | 第14-15页 |
| 3.2.1 我国生猪屠宰链中Lm的流行情况 | 第14页 |
| 3.2.2 国外Lm在生猪屠宰链中的流行情况 | 第14-15页 |
| 3.3 销售环节猪肉中Lm的污染现状 | 第15页 |
| 4 猪肉源Lm引起的人李斯特菌病的流行现状 | 第15-16页 |
| 5 微生物基因组学研究 | 第16-18页 |
| 5.1 基因组学的研究进展 | 第16页 |
| 5.2 DNA测序技术的发展 | 第16-17页 |
| 5.3 病原微生物基因组的研究进展 | 第17-18页 |
| 6 展望 | 第18页 |
| 参考文献 | 第18-22页 |
| 第一章 不同屠宰环节单核细胞增生李斯特菌的分离鉴定 | 第22-37页 |
| 1 材料和方法 | 第22-28页 |
| 1.1 材料 | 第22-24页 |
| 1.1.1 样品 | 第22-23页 |
| 1.1.3 主要试剂 | 第23页 |
| 1.1.4 仪器和设备 | 第23页 |
| 1.1.5 引物合成 | 第23-24页 |
| 1.2 方法 | 第24-28页 |
| 1.2.1 样品采集 | 第24-25页 |
| 1.2.1.1 生猪屠宰场样品的采集 | 第24页 |
| 1.2.1.2 运输环节样品采集 | 第24-25页 |
| 1.2.2 Lm的分离纯化 | 第25页 |
| 1.2.3 Lm的鉴定 | 第25-26页 |
| 1.2.4 Lm分离株的血清型鉴定 | 第26-27页 |
| 1.2.5 药物敏感性试验 | 第27-28页 |
| 2 结果 | 第28-32页 |
| 2.1 屠宰场Lm的分离鉴定 | 第28-29页 |
| 2.2 运输环节Lm的分离鉴定 | 第29-30页 |
| 2.3 Lm分离株的血清型分布 | 第30-31页 |
| 2.4 不同环节Lm分离株的耐药性分析 | 第31-32页 |
| 3 讨论 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-37页 |
| 第二章 基于单核细胞增生李斯特菌分离株基因组重测序的分子亚分型研究 | 第37-52页 |
| 1 材料和方法 | 第37-40页 |
| 1.1 材料 | 第37-38页 |
| 1.1.1 菌株及来源 | 第37-38页 |
| 1.1.2 主要试剂 | 第38页 |
| 1.1.3 主要仪器和设备 | 第38页 |
| 1.2 方法 | 第38-40页 |
| 1.2.1 基因组重测序 | 第38-39页 |
| 1.2.1.1 基因组DNA的提取 | 第38页 |
| 1.2.1.2 基因组文库的构建 | 第38页 |
| 1.2.1.3 Cluster生成 | 第38-39页 |
| 1.2.1.4 上机测序 | 第39页 |
| 1.2.2 Lm分离株毒力基因分析 | 第39页 |
| 1.2.3 Lm的MLST分型 | 第39-40页 |
| 1.2.4 基于全基因组测序的SNP分型 | 第40页 |
| 1.2.5 基于CRISPR间隔序列的聚类分析 | 第40页 |
| 2 结果 | 第40-48页 |
| 2.1 基因组序列的拼接 | 第40页 |
| 2.2 Lm分离株毒力基因的检测 | 第40-43页 |
| 2.3 MLST型分布情况 | 第43-45页 |
| 2.4 CRISPR分型结果 | 第45-47页 |
| 2.5 基于全基因组测序的SNP分型结果 | 第47-48页 |
| 3 讨论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |