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上海市水产品中致病性副溶血性弧菌的分布及多样性研究

摘要第4-6页
abstract第6-7页
第一章 绪论第11-19页
    1 前言第11页
    2 副溶血性弧菌快速检测技术第11-13页
        2.1 传统的细菌分离、纯化与鉴定第11-12页
        2.2 副溶血性弧菌的分子检测技术第12-13页
            2.2.1 PCR技术第12页
            2.2.2 多重PCR第12-13页
            2.2.3 实时荧光定量PCR第13页
            2.2.4 环介导恒温扩增第13页
    3 遗传多样性研究技术第13-18页
        3.1 脉冲场凝胶电泳PFGE(Pulsed-field gel electrophoresis)第13-14页
        3.2 多位点序列分型MLST(Multilocus sequence typing)第14-15页
        3.3 多位点可变数目串联重复序列分析MLVA(Multiple Loci Variable Number of Tandem Repeats Analysis)第15-16页
        3.4 肠道细菌基因间重复序列(ERIC-PCR)第16页
        3.5 基因外重复回文序列聚合酶链式反应(REP-PCR )第16-17页
        3.6 随机放大多态性DNA(RAPD)第17页
        3.7 限制性内切酶片段多态性RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)第17页
        3.8 MLST-SNP第17-18页
    4 研究目的和意义第18-19页
第二章 上海市水产品副溶血性弧菌的污染情况及毒力基因分布第19-26页
    1 材料与方法第19-21页
        1.1 样品采集第19页
        1.2 主要试剂和培养基第19页
        1.3 主要仪器设备第19-20页
        1.4 实验方法第20-21页
            1.4.1 样品采集第20页
            1.4.2 菌株的分离第20页
            1.4.3 MPN值计算第20页
            1.4.4 基因组DNA的提取第20页
            1.4.5 毒力基因的PCR检测第20页
            1.4.5 毒力基因的LAMP检测第20-21页
    2 结果与分析第21-24页
        2.1 不同类型水产品中副溶血性弧菌污染率第21页
        2.2 不同地点来源的水产品中副溶血性弧菌污染率第21-22页
        2.3 不同季节水产品副溶血性弧菌污染率第22页
        2.4 疑似副溶血性弧菌的PCR、LAMP鉴定第22-23页
        2.5 副溶血性弧菌tdh基因和trh基因PCR、LAMP扩增结果第23页
        2.6 不同水产品中致病性副溶血性弧菌检出率第23-24页
    3 本章小结第24-26页
第三章 副溶血性弧菌对Caco-2 细胞的毒性作用第26-38页
    1 材料与方法第26-30页
        1.1 实验菌株第26-27页
        1.2 实验细胞株第27页
        1.3 主要试剂和培养基第27页
        1.4 主要仪器设备第27-28页
        1.5 实验方法第28-30页
            1.5.1 人结肠腺癌细胞(Caco-2)复苏第28页
            1.5.2 细胞传代培养第28页
            1.5.3 细胞冻存第28页
            1.5.4 细胞侵染铺板:第28-29页
            1.5.5 细胞毒性铺板第29页
            1.5.6 细菌培养及侵染前处理第29页
            1.5.7 细菌侵染实验第29页
            1.5.8 细胞毒性实验第29-30页
            1.5.9 标准差分析第30页
    2. 结果与分析第30-36页
        2.1 副溶血性弧菌侵染实验第30-33页
            2.1.1 3h副溶血性弧菌侵染细胞致死率第31页
            2.1.2 含有不同毒力基因的副溶血性弧菌侵染Caco-2 能力第31-32页
            2.1.3 不同来源的副溶血性弧菌侵染Caco-2 能力第32页
            2.1.4 不同类型水产品中副溶血性弧菌的细胞侵染能力第32-33页
            2.1.5 不同采样地点水产品中副溶血性弧菌的细胞侵染能力第33页
        2.2 细胞毒性试验第33-36页
            2.2.1 细菌侵染时间的优化第33-34页
            2.2.2 3 h细菌侵染细胞第34页
            2.2.3 不同副溶血性弧菌所含毒力基因及其细胞毒性第34-35页
            2.2.4 不同来源的副溶血性弧菌细胞毒性大小第35页
            2.2.5 不同类型水产品中副溶血性弧菌的细胞毒性大小第35-36页
            2.2.6 不同采样地点水产品中副溶血性弧菌细胞毒性大小第36页
    3 本章小结第36-38页
第四章 REP-PCR及ERIC-PCR法对致病性副溶血性弧菌的遗传多样性研究第38-48页
    1 材料与方法第38-40页
        1.1 实验菌株第38页
        1.2 主要试剂和培养基第38页
        1.3 主要仪器设备第38-39页
        1.4 实验方法第39-40页
            1.4.1 细菌基因组DNA的提取第39页
            1.4.2 DNA的质量检测及质量浓度测定第39页
            1.4.3 REP-PCR体系第39页
            1.4.4 ERIC-PCR体系第39-40页
            1.4.5 REP-PCR及ERIC-PCR数据处理及聚类分析第40页
    2 结果与分析第40-47页
        2.1 REP-PCR扩增结果第40-43页
            2.1.1 不同年份副溶血性弧菌REP -PCR分布第41-42页
            2.1.2 不同样品种类副溶血性弧菌REP –PCR分布第42页
            2.1.3 不同采样地点副溶血性弧菌REP -PCR分布第42-43页
        2.2 ERIC-PCR扩增结果第43-47页
            2.2.1 不同年份副溶血性弧菌ERIC-PCR分布第45页
            2.2.2 不同种类副溶血性弧菌ERIC-PCR分布第45-46页
            2.2.3 不同采样地点副溶血性弧菌ERIC-PCR分布第46-47页
    3.本章小结第47-48页
第五章 总结与展望第48-50页
    5.1 全文总结第48页
    5.2 不足与展望第48-50页
参考文献第50-55页
致谢第55页

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