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金黄色葡萄球菌与铜绿假单胞菌群体增殖的转录调控机制

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 绪论第13-28页
    1.1 金葡菌的概述第13-15页
        1.1.1 金葡菌污染现状第13-14页
        1.1.2 金葡菌群感效应第14-15页
    1.2 铜绿菌的概述第15-17页
        1.2.1 铜绿菌的污染现状第15页
        1.2.2 铜绿菌群感效应第15-17页
    1.3 金葡菌与铜绿菌群体增殖第17-22页
        1.3.1 多微生物群体增殖概述第17-18页
        1.3.2 金葡菌与铜绿菌种间作用第18-22页
    1.4 金葡菌与铜绿菌混合生物被膜第22-25页
        1.4.1 生物被膜概述与食品安全第22-24页
        1.4.2 金葡菌与铜绿菌混合生物被膜第24-25页
    1.5 多微生物转录组分析第25-26页
    1.6 本课题的研究背景、意义和内容第26-28页
        1.6.1 本课题研究背景和意义第26-27页
        1.6.2 本课题研究内容第27-28页
第二章 金葡菌与铜绿菌相互作用第28-48页
    2.1 引言第28页
    2.2 实验材料与设备第28-30页
        2.2.1 实验菌株第28页
        2.2.2 实验试剂与材料第28-29页
        2.2.3 实验仪器与设备第29页
        2.2.4 培养基与常用溶液的配制第29-30页
    2.3 实验过程与方法第30-33页
        2.3.1 微孔板生物被膜总量的测定第30-31页
        2.3.2 金葡菌与铜绿菌群体中可培养数的测定第31页
        2.3.3 不同营养条件下金葡菌与铜绿菌群体增殖特性第31页
        2.3.4 铜绿菌代谢物对金葡菌生长影响第31页
        2.3.5 金葡菌小菌落突变株(SCV)形态观察第31页
        2.3.6 荧光显微镜观察第31-32页
        2.3.7 原子力显微镜(AFM)测定表面形貌第32页
        2.3.8 数据分析第32-33页
    2.4 实验结果与讨论第33-47页
        2.4.1 铜绿菌被膜形成能力分布第33-35页
        2.4.2 金葡菌与铜绿菌群体增殖特性第35-39页
        2.4.3 不同营养条件下金葡菌与铜绿菌群体增殖特性第39-41页
        2.4.4 铜绿菌代谢物对金葡菌生长影响第41-43页
        2.4.5 金葡菌小菌落突变株(SCV)形态观察第43-45页
        2.4.6 荧光显微镜观察细菌活性第45页
        2.4.7 原子力显微镜测定菌体表面形貌第45-47页
    2.5 小结第47-48页
第三章 金葡菌与铜绿菌混合生物被膜特性第48-58页
    3.1 引言第48页
    3.2 材料与设备第48-49页
        3.2.1 实验菌株第48-49页
        3.2.2 实验试剂与材料第49页
        3.2.3 实验仪器与设备第49页
    3.3 实验方法第49-50页
        3.3.1 微孔板法测定混合生物被膜被膜总量第49页
        3.3.2 金葡菌与铜绿菌形成菌落生物被膜活性测定第49-50页
    3.4 结果与讨论第50-57页
        3.4.1 微孔板法测定生物被膜总量第50-52页
        3.4.2 金葡菌与铜绿菌混合菌落被膜观察第52-54页
        3.4.3 金葡菌与铜绿菌混合菌落被膜活性分析第54-55页
        3.4.4 铜绿菌对金葡菌菌落被膜活性影响第55-57页
    3.5 小结第57-58页
第四章 金葡菌与铜绿菌群体转录组分析第58-82页
    4.1 引言第58页
    4.2 材料与设备第58-59页
        4.2.1 实验菌株第58页
        4.2.2 实验试剂与材料第58页
        4.2.3 实验仪器与设备第58-59页
    4.3 实验方法第59-63页
        4.3.1 培养时间的确定第59页
        4.3.2 RNA提取、质量检测第59页
        4.3.3 文库构建及RNA测序第59-60页
        4.3.4 测序评估与比对统计第60-61页
        4.3.5 转录组基因表达量统计第61-62页
        4.3.6 转录组差异分析第62-63页
        4.3.7 注释及功能预测第63页
    4.4 结果与讨论第63-80页
        4.4.1 送样时间的确定第63-65页
        4.4.2 RNA-seq测序质量评估第65-67页
        4.4.3 基因表达结果统计第67-68页
        4.4.4 转录组样品关系概况第68-70页
        4.4.5 群体增殖中金葡菌的差异表达基因分析第70-76页
        4.4.6 群体增殖中铜绿菌的差异表达基因分析第76-79页
        4.4.7 铜绿菌与金葡菌群体增殖相互作用分子机制第79-80页
    4.5 小结第80-82页
结论与展望第82-85页
    一、结论第82-84页
    二、主要创新点第84页
    三、展望第84-85页
参考文献第85-99页
附录第99-103页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第103-104页
致谢第104-105页
附件第105页

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