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荧光假单胞菌PCR检测靶点的筛选及PCR检测体系的建立

摘要第1-9页
Abstract第9-16页
1 绪论第16-28页
   ·前言第16页
   ·荧光假单胞菌概述第16-18页
     ·荧光假单胞菌的生理生化特征第16-17页
     ·荧光假单胞菌的分布第17页
     ·荧光假单胞菌的流行病学特征第17-18页
   ·荧光假单菌分离和检测方法第18-22页
     ·传统分离鉴定方法第18-19页
     ·快速检测方法第19-22页
   ·荧光定量 PCR 原理和应用第22-27页
     ·非特异性染料法第22-23页
     ·水解探针法第23-26页
     ·其它荧光定量 P CR 方法第26-27页
   ·研究目的及意义第27-28页
2 荧光假单胞菌特异性检测靶点筛选第28-43页
   ·材料与方法第28-39页
     ·细菌菌株和载体质粒第28-32页
     ·培养基和试剂第32-33页
     ·仪器设备第33页
     ·菌株的活化与培养第33-34页
     ·基因组 DNA 提取及纯度分析第34-35页
     ·检测靶点筛选和引物设计第35-36页
     ·初步特异性评价第36-39页
   ·结果第39-40页
     ·生物信息学筛选检测靶点第39页
     ·ITS1 和ITS2 的 PCR 验证第39页
     ·gyrB8 和gyrB10 的 PCR 验证第39-40页
   ·讨论第40-43页
3 荧光假单胞菌常规 PCR 检测方法的建立和评价第43-60页
   ·材料与方法第43-51页
     ·细菌菌株和载体质粒第43-45页
     ·主要培养基和试剂第45-47页
     ·仪器与设备第47-48页
     ·PCR 反应体系第48页
     ·Mg~(2 +) 浓度优化实验第48页
     ·退火温度优化实验第48-49页
     ·特异性评价第49页
     ·灵敏度评价第49页
     ·抗干扰能力评价第49-50页
     ·人工污染实验第50页
     ·食品样品检测第50-51页
   ·结果与分析第51-56页
     ·P CR 反应体系建立第51-52页
     ·特异性评价第52页
     ·灵敏度评价第52-54页
     ·抗干扰能力评价第54页
     ·人工污染食品样品实验第54-55页
     ·食品样品检测第55-56页
   ·讨论第56-60页
4 基于 TaqMan 探针的荧光定量 PCR 检测荧光假单胞菌方法的建立和评价第60-78页
   ·材料与方法第60-66页
     ·细菌菌株和载体质粒第60-62页
     ·主要培养基和试剂第62-63页
     ·仪器与设备第63页
     ·引物和探针的设计及初步筛选第63页
     ·P CR 反应体系第63页
     ·退火温度优化实验第63-64页
     ·探针浓度优化实验第64页
     ·标准曲线绘制第64页
     ·特异性评价第64-65页
     ·灵敏度评价第65页
     ·抗干扰能力评价第65页
     ·人工污染豆奶样品实验第65页
     ·食品样品检测第65页
     ·初步定量计算第65-66页
   ·结果与分析第66-74页
     ·引物和探针的设计及初步筛选第66-67页
     ·P CR 反应体系建立 #S2第67-68页
     ·标准曲线绘制第68-69页
     ·特异性评价第69页
     ·灵敏度评价第69-71页
     ·抗干扰能力评价第71-72页
     ·人工污染食品样品实验第72-73页
     ·食品样品检测第73页
     ·初步定量计算第73-74页
   ·讨论第74-78页
5 总结和展望第78-80页
参考文献第80-84页
致谢第84-85页
攻读学位期间发表的学术论文第85-86页
附件第86页

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