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活菌多样性分析技术解析酸性电解水处理后南美白对虾中微生物多样性变化

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
英文缩写词表第11-16页
第一章 文献综述第16-23页
    1. 研究背景第16-17页
    2. PMA/EMA应用于食品相关细菌的检测第17-19页
        2.1 食源性致病菌第17-18页
        2.2 腐败菌第18页
        2.3 益生菌第18-19页
        2.4 微生物菌群第19页
    3. PMA/EMA应用于酵母和霉菌的检测第19-20页
    4. PMA/EMA在食品加工过程中的应用第20页
    5. PMA/EMA应用的局限性和解决方案第20-22页
    6. 总结和展望第22-23页
第二章 PMA结合PCR-DGGE和高通量测序技术检测南美白对虾中活菌方法的构建第23-38页
    1. 前言第23-24页
    2. 材料与方法第24-29页
        2.1 样品采集和前处理第24页
        2.2 PMA母液的制备及处理第24-25页
        2.3 细菌总DNA的提取第25页
        2.4 PCR扩增反应第25页
        2.5 DGGE实验第25-26页
        2.6 DGGE胶条带的回收及克隆测序第26页
        2.7 克隆子的建立第26-27页
            2.7.1 在质粒载体中进行定向克隆第26-27页
            2.7.2 转化至大肠杆菌DH5α 感受态细胞第27页
            2.7.3 重组DNA检测及测序第27页
        2.8 DGGE条带的统计分析第27-28页
        2.9 高通量测序第28页
        2.10 高通量测序统计学处理第28-29页
            2.10.1 原始数据处理与样本序列数目统计第28页
            2.10.2 生物信息学分析第28-29页
    3. 结果第29-36页
        3.1 PMA结合PCR-DGGE探究PMA对微生物群落多样性的影响第29-34页
            3.1.1 基于DGGE图谱的微生物多样性分析第29-32页
            3.1.2 PMA处理对微生物群落组成的影响第32-34页
        3.2 PMA结合高通量测序探究PMA对微生物群落多样性的影响第34-36页
    4. 讨论第36-37页
    5. 本章小结第37-38页
第三章 活菌多样性分析技术应用于评价不同浓度AEW对南美白对虾中微生物的杀菌效果第38-48页
    1. 前言第38-39页
    2. 材料与方法第39-41页
        2.1 酸性电解水的制备第39页
        2.2 南美白对虾的采集及处理第39-40页
        2.3 PMA母液的制备及处理第40页
        2.4 细菌总DNA的提取第40页
        2.5 PCR扩增反应第40页
        2.6 DGGE实验第40页
        2.7 DGGE条带的统计分析第40页
        2.8 高通量测序第40页
        2.9 高通量测序统计学处理第40-41页
    3. 结果与分析第41-46页
        3.1 DGGE图谱分析第41页
        3.2 DGGE图谱输出多样性分析和聚类分析第41-43页
        3.3 高通量测序分析第43-46页
    4. 讨论第46-47页
    5. 本章小结第47-48页
第四章 利用活菌多样性分析技术解析AEW处理后南美白对虾在贮藏过程中微生物多样性变化第48-64页
    1. 前言第48-49页
    2. 材料与方法第49-50页
        2.1 酸性电解水的制备第49页
        2.2 南美白对虾的采集及处理第49-50页
        2.3 PMA母液的制备及处理第50页
        2.4 细菌总DNA的提取第50页
        2.5 PCR扩增反应第50页
        2.6 DGGE实验第50页
        2.7 DGGE条带的统计分析第50页
        2.8 高通量测序第50页
        2.9 高通量测序统计学处理第50页
    3. 结果与分析第50-62页
        3.1 PMA对AEW杀菌后的南美白对虾在贮藏过程中微生物多样性的影响第50-56页
            3.1.1 DGGE图谱分析第50-51页
            3.1.2 DGGE输出多样性分析和聚类分析第51-53页
            3.1.3 高通量测序各样本中微生物群落的香浓指数第53-54页
            3.1.4 高通量测序各样本中微生物物种PCoA分析第54-55页
            3.1.5 高通量测序各样本中微生物物种丰度热点图(Heatmap)第55-56页
        3.2 利用活菌多样性分析技术对比分析TW和AEW处理后南美白对虾在贮藏过程中活的微生物多样性变化第56-59页
            3.2.1DGGE图谱分析第56-58页
            3.2.2 高通量测序各样本中微生物群落的香浓指数第58页
            3.2.3 样本PCoA分析第58-59页
        3.3 高通量测序各样本中微生物物种丰度第59-62页
            3.3.1 门水平相对丰度变化第59-60页
            3.3.2 属水平相对丰度变化第60-62页
    4. 讨论第62-63页
    5. 本章小结第63-64页
全文总结第64-66页
参考文献第66-77页
攻读硕士学位期间取得的科研成果第77-78页
致谢第78页

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