摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 综述 | 第10-17页 |
1.1 概述 | 第10-13页 |
1.1.1 鲍鱼简介 | 第10-11页 |
1.1.2 鲍鱼的营养价值与食用价值 | 第11页 |
1.1.3 鲍鱼的生物活性与药疗价值 | 第11页 |
1.1.4 鲍鱼的研究现状 | 第11-12页 |
1.1.5 海产品中的安全问题 | 第12页 |
1.1.6 海产品腐败的原因 | 第12-13页 |
1.1.7 细菌多样性分析在鲍鱼中的应用 | 第13页 |
1.2 细菌菌群多样性的研究方法 | 第13-16页 |
1.2.1 细菌常规鉴定法 | 第13-14页 |
1.2.2 16S rDNA基因技术 | 第14-15页 |
1.2.2.1 RFLP——限制性片段长度多态性分析技术 | 第15页 |
1.2.2.2 DGGE——变性梯度凝胶电泳技术 | 第15页 |
1.2.3 高通量测序 | 第15-16页 |
1.3 本课题研究的意义 | 第16-17页 |
第二章 PCR-RLFP分析鲍鱼贮藏过程细菌多样性 | 第17-34页 |
2.1 实验材料 | 第17-19页 |
2.1.1 实验样品 | 第17页 |
2.1.2 主要仪器 | 第17-18页 |
2.1.3 主要试剂 | 第18-19页 |
2.2 实验方法 | 第19-23页 |
2.2.1 样品前处理 | 第19页 |
2.2.2 鲍鱼细菌总DNA的提取 | 第19页 |
2.2.3 DNA模板的检测 | 第19-20页 |
2.2.4 16S rDNA片段的PCR扩增 | 第20页 |
2.2.5 PCR产物的回收纯化 | 第20-21页 |
2.2.6 鲍鱼贮藏过程中细菌多样性分析 | 第21-23页 |
2.2.6.1 连接pMD19-T载体过夜 | 第21-22页 |
2.2.6.2 导入感受态细胞 | 第22页 |
2.2.6.3 蓝白斑筛选 | 第22页 |
2.2.6.4 一次克隆与二次克隆 | 第22-23页 |
2.2.6.5 限制性片段长度多态性(RFLP)分析 | 第23页 |
2.2.7 细菌16S rDNA片段测序及菌种鉴定 | 第23页 |
2.3 结果与讨论 | 第23-33页 |
2.3.1 鲍鱼细菌总DNA的提取 | 第24页 |
2.3.2 PCR扩增 | 第24-25页 |
2.3.3 鲍鱼贮藏过程中细菌多样性分析 | 第25-27页 |
2.3.3.1 一次克隆和二次克隆 | 第26-27页 |
2.3.4 限制性片段长度多态性(RFLP)分析 | 第27-28页 |
2.3.5 鲍鱼细菌的基因序列的分析 | 第28-33页 |
2.3.5.1 鲍鱼在4℃条件下贮藏过程中细菌多样性分析 | 第28-30页 |
2.3.5.2 鲍鱼在20℃条件下贮藏过程中细菌多样性分析 | 第30-33页 |
2.4 本章小结 | 第33-34页 |
第三章 高通量测序法分析鲍鱼贮藏过程细菌多样性 | 第34-49页 |
3.1 实验材料 | 第34-35页 |
3.1.1 实验样品 | 第34页 |
3.1.2 主要仪器 | 第34页 |
3.1.3 主要试剂 | 第34-35页 |
3.2 实验方法 | 第35-36页 |
3.2.1 样品的前处理 | 第35页 |
3.2.2 贮藏的温度 | 第35页 |
3.2.3 鲍鱼细菌总DNA的提取 | 第35页 |
3.2.4 Hiseq测序 | 第35页 |
3.2.5 数据分析 | 第35-36页 |
3.3 结果与讨论 | 第36-47页 |
3.3.1 Alpha多样性分析结果 | 第36-37页 |
3.3.2 OTUs聚类和物种注释结果 | 第37-47页 |
3.4 本章小结 | 第47-49页 |
第四章 结论 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-53页 |
致谢 | 第53页 |