| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-25页 |
| 1.1 云南传统发酵食品简介 | 第12-15页 |
| 1.1.1 豆豉简介 | 第12-13页 |
| 1.1.2 酸笋简介 | 第13页 |
| 1.1.3 老面简介 | 第13-14页 |
| 1.1.4 乳饼简介 | 第14页 |
| 1.1.5 酸浆米线简介 | 第14-15页 |
| 1.1.6 酸肉简介 | 第15页 |
| 1.2 食品中微生物群落结构的研究方法 | 第15-17页 |
| 1.2.1 微生物培养方法 | 第15页 |
| 1.2.2 不依赖培养的分子生物学方法 | 第15-17页 |
| 1.2.3 元转录组学(Metatranscriptomics) | 第17页 |
| 1.3 测序技术 | 第17-18页 |
| 1.3.1 测序技术的发展 | 第17-18页 |
| 1.3.2 高通量测序技术在微生物群落结构上的应用 | 第18页 |
| 1.4 食品腐败微生物研究现状 | 第18-22页 |
| 1.4.1 食品中腐败微生物组成的研究现状 | 第20-21页 |
| 1.4.2 食品腐败菌群研究的必要性 | 第21页 |
| 1.4.3 腐败过程中微生物群落结构分析 | 第21-22页 |
| 1.5 研究内容 | 第22页 |
| 1.6 技术路线 | 第22-25页 |
| 第二章 云南传统发酵食品细菌群落多样性及元转录组研究 | 第25-68页 |
| 2.1 前言 | 第29-30页 |
| 2.2 实验材料 | 第30-31页 |
| 2.2.1 发酵食品样品采集 | 第30页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第30-31页 |
| 2.3 实验方法 | 第31-35页 |
| 2.3.1 DNA提取 | 第31页 |
| 2.3.2 细菌16S rDNA区域扩增及高通量测序 | 第31-32页 |
| 2.3.3 测序结果分类鉴定 | 第32页 |
| 2.3.4 多样性指数和系统发育分析 | 第32-33页 |
| 2.3.5 元转录组数据分析 | 第33-35页 |
| 2.4 结果 | 第35-66页 |
| 2.4.1 细菌群落多样性分析 | 第35-59页 |
| 2.4.2 元转录组分析 | 第59-66页 |
| 2.5 讨论 | 第66-68页 |
| 第三章 猪肉馅和巴氏乳中腐败菌群落多样性研究 | 第68-84页 |
| 3.1 前言 | 第71-72页 |
| 3.2 实验材料 | 第72页 |
| 3.2.1 猪肉馅和巴氏乳样品采集 | 第72页 |
| 3.2.2 实验仪器 | 第72页 |
| 3.2.3 实验用试剂及配制 | 第72页 |
| 3.3 实验方法 | 第72-74页 |
| 3.3.1 样品采集 | 第72-73页 |
| 3.3.2 腐败食品的表观感官评定 | 第73页 |
| 3.3.3 DNA提取 | 第73页 |
| 3.3.4 细菌16S rDNA区域扩增及高通量测序 | 第73-74页 |
| 3.3.5 测序结果分类鉴定 | 第74页 |
| 3.3.6 多样性指数和系统发育分析 | 第74页 |
| 3.4 结果 | 第74-82页 |
| 3.4.1 腐败食品的表观感官评估 | 第74-75页 |
| 3.4.2 腐败食品样品的序列信息和多样性指数分析 | 第75-77页 |
| 3.4.3 腐败过程中微生物群落结构分析 | 第77-82页 |
| 3.5 讨论 | 第82-84页 |
| 总结 | 第84-86页 |
| 致谢 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-94页 |
| 附录 攻读硕士期间发表论文 | 第94页 |
