| 中文摘要 | 第11-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 第1章 前言 | 第16-26页 |
| 1.1 中国白酒的发展 | 第16-18页 |
| 1.1.1 起源 | 第16页 |
| 1.1.2 成分和分类 | 第16-17页 |
| 1.1.3 发展 | 第17页 |
| 1.1.4 白酒酒糟和窖泥 | 第17-18页 |
| 1.2 宏基因组学 | 第18-21页 |
| 1.2.1 概念 | 第18-19页 |
| 1.2.2 宏基因组文库 | 第19页 |
| 1.2.2.1 样品总DNA的提取 | 第19页 |
| 1.2.2.2 载体选择 | 第19页 |
| 1.2.2.3 宿主细胞表达 | 第19页 |
| 1.2.3 宏基因组文库的筛选方法 | 第19-20页 |
| 1.2.4 宏基因组学的应用 | 第20-21页 |
| 1.2.4.1 发现新基因 | 第20页 |
| 1.2.4.2 生物活性物质的发现 | 第20页 |
| 1.2.4.3 微生物多样性研究 | 第20-21页 |
| 1.3 宏蛋白质组学与iTRAQ技术 | 第21-23页 |
| 1.3.1 宏蛋白质组学 | 第21页 |
| 1.3.2 研究策略 | 第21-23页 |
| 1.3.2.1 样品的制备 | 第21-22页 |
| 1.3.2.2 样品的分离 | 第22页 |
| 1.3.2.3 蛋白鉴定 | 第22-23页 |
| 1.3.3 iTRAQ技术 | 第23页 |
| 1.4 Bt的分离 | 第23-24页 |
| 1.4.1 Bt简介 | 第23-24页 |
| 1.4.2 Bt分离 | 第24页 |
| 1.5 本研究的目的及其意义 | 第24-26页 |
| 第2章 窖泥细菌16S rDNA高通量测序分析 | 第26-39页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-29页 |
| 2.1.1 窖泥样品的采集 | 第27页 |
| 2.1.2 酶与试剂 | 第27页 |
| 2.1.3 窖泥总DNA的提取 | 第27-28页 |
| 2.1.4 PCR扩增与纯化 | 第28页 |
| 2.1.5 Illumina Miseq高通量测序 | 第28-29页 |
| 2.1.6 OTU分析和物种注释 | 第29页 |
| 2.1.7 样品复杂度分析 | 第29页 |
| 2.2 结果与分析 | 第29-37页 |
| 2.2.1 测序数据处理 | 第29-31页 |
| 2.2.2 OTU分析及物种注释 | 第31-35页 |
| 2.2.3 样品复杂度分析 | 第35-37页 |
| 2.3 讨论 | 第37-38页 |
| 2.4 小结 | 第38-39页 |
| 第3章 白酒窖泥微生物宏基因组分析 | 第39-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第39-42页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第39页 |
| 3.1.2 酶与试剂 | 第39页 |
| 3.1.3 建库测序流程 | 第39-40页 |
| 3.1.3.1 窖泥总DNA的提取 | 第39页 |
| 3.1.3.2 窖泥总DNA的检测 | 第39-40页 |
| 3.1.3.3 宏基因组文库的构建 | 第40页 |
| 3.1.3.4 Illumina测序 | 第40页 |
| 3.1.4 测序下机数据预处理 | 第40页 |
| 3.1.5 物种注释 | 第40-41页 |
| 3.1.6 功能注释及丰度分析 | 第41-42页 |
| 3.1.7 代谢通路比较分析 | 第42页 |
| 3.2 结果与分析 | 第42-52页 |
| 3.2.1 数据预处理 | 第42页 |
| 3.2.2 物种注释 | 第42-45页 |
| 3.2.3 基因功能注释 | 第45-50页 |
| 3.2.3.1 KEGG数据库注释 | 第45-48页 |
| 3.2.3.2 eggNOG注释和CAZy注释 | 第48-50页 |
| 3.2.4 代谢通路比较分析 | 第50-52页 |
| 3.3 讨论 | 第52-53页 |
| 3.4 小结 | 第53-54页 |
| 第4章 白酒窖泥微生物总蛋白的提取和iTRAQ标记 | 第54-69页 |
| 4.1 材料与方法 | 第54-58页 |
| 4.1.1 窖泥样品的采集 | 第54页 |
| 4.1.2 酶与试剂 | 第54-55页 |
| 4.1.3 窖泥总蛋白的提取 | 第55-56页 |
| 4.1.3.1 SDS提取法 | 第55-56页 |
| 4.1.3.2 SDS-苯酚提取法 | 第56页 |
| 4.1.3.3 NaOH提取法 | 第56页 |
| 4.1.3.4 C/S-P-M提取法 | 第56页 |
| 4.1.4 SDS-PAGE与蛋白浓度测定 | 第56-57页 |
| 4.1.5 胰蛋白酶水解和iTRAQ同位素标记 | 第57页 |
| 4.1.6 off-line 2D LC-MS/MS | 第57页 |
| 4.1.7 数据分析 | 第57-58页 |
| 4.2 结果与分析 | 第58-67页 |
| 4.2.1 蛋白提取方法比较 | 第58-59页 |
| 4.2.2 窖泥蛋白iTRAQ定量鉴定 | 第59-61页 |
| 4.2.3 产甲烷菌蛋白表达差异 | 第61页 |
| 4.2.4 丁酸梭菌和克氏梭菌蛋白表达差异 | 第61-67页 |
| 4.3 讨论 | 第67-68页 |
| 4.4 小结 | 第68-69页 |
| 第5章 酒糟生物质转化Bt培养基的前处理条件筛选和配方优化 | 第69-106页 |
| 5.1 材料与方法 | 第69-79页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第70-72页 |
| 5.1.1.1 白酒酒糟和窖泥的采集 | 第70页 |
| 5.1.1.2 培养基 | 第70页 |
| 5.1.1.3 酶与试剂 | 第70-71页 |
| 5.1.1.4 仪器 | 第71页 |
| 5.1.1.5 供试虫源 | 第71-72页 |
| 5.1.2 菌株分离及鉴定 | 第72-74页 |
| 5.1.2.1 菌株分离 | 第72页 |
| 5.1.2.2 Bt总DNA的提取与PCR-RFLP | 第72-73页 |
| 5.1.2.3 琼脂糖凝胶电泳分析 | 第73-74页 |
| 5.1.2.4 晶体蛋白的鉴定 | 第74页 |
| 5.1.2.5 对昆虫的杀虫活性测定 | 第74页 |
| 5.1.3 酒糟成份分析 | 第74-75页 |
| 5.1.3.1 水分的测定 | 第74-75页 |
| 5.1.3.2 灰分的测定 | 第75页 |
| 5.1.3.3 热水提取物的测定 | 第75页 |
| 5.1.3.4 苯醇提取物的测定 | 第75页 |
| 5.1.3.5 纤维素、半纤维素和酸溶木质素的测定 | 第75页 |
| 5.1.4 酒糟前处理 | 第75-77页 |
| 5.1.5 酶水解 | 第77页 |
| 5.1.6 HPLC测定 | 第77-78页 |
| 5.1.6.1 样品的衍生化 | 第77页 |
| 5.1.6.2 色谱条件 | 第77-78页 |
| 5.1.7 浸提液发酵效果初筛 | 第78页 |
| 5.1.8 酒糟液态发酵培养基的优化 | 第78-79页 |
| 5.1.8.1 单因素试验 | 第78页 |
| 5.1.8.2 Plackett-Burman设计 | 第78-79页 |
| 5.1.8.3 最陡爬坡试验 | 第79页 |
| 5.1.8.4 响应面分析(RSM) | 第79页 |
| 5.1.9 芽胞数与生物测定 | 第79页 |
| 5.2 结果与分析 | 第79-104页 |
| 5.2.1 菌株分离及其鉴定 | 第79-84页 |
| 5.2.1.1 菌株分离 | 第79-81页 |
| 5.2.1.2 基因型鉴定 | 第81-83页 |
| 5.2.1.3 杀虫晶体蛋白SDS-PAGE分析 | 第83页 |
| 5.2.1.4 生物测定 | 第83-84页 |
| 5.2.2 利用酒糟培养苏云金芽胞杆菌的前处理研究 | 第84-92页 |
| 5.2.2.1 酒糟成分分析 | 第84页 |
| 5.2.2.2 稀硫酸前处理 | 第84页 |
| 5.2.2.3 氢氧化钠前处理 | 第84页 |
| 5.2.2.4 氢氧化钙前处理 | 第84-85页 |
| 5.2.2.5 热水前处理 | 第85页 |
| 5.2.2.6 酶水解 | 第85页 |
| 5.2.2.7 酒糟前处理和酶水解产物的单糖组成 | 第85-86页 |
| 5.2.2.8 不同前处理的芽胞产量 | 第86-92页 |
| 5.2.3 利用酒糟浸提液制备苏云金芽胞杆菌及其培养基优化 | 第92-94页 |
| 5.2.3.1 单因素试验选择最优氮源和金属离子 | 第92-94页 |
| 5.2.4 Plackett-Burman设计 | 第94-96页 |
| 5.2.5 最陡爬坡试验 | 第96-97页 |
| 5.2.6 响应面分析 | 第97-98页 |
| 5.2.7 最优配方的验证 | 第98-104页 |
| 5.3 讨论 | 第104-105页 |
| 5.4 小结 | 第105-106页 |
| 第6章 全文小结 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-125页 |
| 附录 | 第125-142页 |
| 附录1 iTRAQ与液相色谱-质谱鉴定产甲烷菌中的蛋白质 | 第125-133页 |
| 附录2 iTRAQ与液相色谱-质谱鉴定丁酸梭菌中的蛋白质 | 第133-136页 |
| 附录3 iTRAQ与液相色谱-质谱鉴定克氏梭菌中的蛋白质 | 第136-138页 |
| 附录4 酒糟成份分析 | 第138-142页 |
| 致谢 | 第142页 |
