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山葡萄‘双红与葡萄霜霉菌互作的分子机制研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
缩略语与中英文对照第8-14页
第一章 引言第14-26页
    1.1 葡萄霜霉病研究概况第14-18页
        1.1.1 葡萄霜霉病的危害第14页
        1.1.2 葡萄霜霉病抗性第14-15页
        1.1.3 葡萄霜霉菌生活史第15-16页
        1.1.4 葡萄霜霉菌致病力研究进展第16-17页
        1.1.5 葡萄霜霉菌群体遗传结构研究进展第17-18页
    1.2 植物免疫第18-22页
        1.2.1 植物抗病机制第18-19页
        1.2.2 植物R蛋白与病原菌无毒蛋白之间的互作机制第19-20页
        1.2.3 植物R基因的分类第20-21页
        1.2.4 葡萄抗霜霉病R基因的研究进展第21-22页
    1.3 植物病原卵菌的效应因子研究概况第22-25页
        1.3.1 卵菌RxLR类效应因子的结构特征第22-23页
        1.3.2 卵菌RxLR类效应因子的毒性功能第23-24页
        1.3.3 葡萄霜霉菌的RxLR类效应因子研究进展第24-25页
    1.4 本研究的目的与意义第25-26页
第二章 中国葡萄霜霉菌的致病力与群体遗传结构分析第26-41页
    2.1 实验材料第26-28页
        2.1.1 供试葡萄霜霉菌与葡萄品种第26-27页
        2.1.2 供试引物第27-28页
    2.2 实验方法第28-32页
        2.2.1 葡萄盆栽苗的种植第28页
        2.2.2 葡萄霜霉菌的纯化、扩繁与保存第28-29页
        2.2.3 葡萄霜霉菌的致病力分析第29-30页
        2.2.4 葡萄霜霉菌DNA的提取第30-31页
        2.2.5 PCR扩增第31页
        2.2.6 PCR产物检测第31页
        2.2.7 群体遗传学分析第31-32页
    2.3 实验结果与分析第32-38页
        2.3.1 葡萄霜霉菌分离、纯化结果第32-33页
        2.3.2 葡萄霜霉菌致病力分析结果第33-34页
        2.3.3 葡萄霜霉菌群体结构多样性分析第34-37页
        2.3.4 葡萄霜霉菌群体的遗传分化与变异第37-38页
    2.4 讨论第38-41页
第三章 中国山葡萄‘双红’抗霜霉病分子机制研究第41-63页
    3.1 实验材料第41-42页
        3.1.1 供试葡萄霜霉菌和葡萄品种第41页
        3.1.2主要试剂第41页
        3.1.3 主要仪器第41-42页
        3.1.4 供试引物第42页
    3.2 实验方法第42-46页
        3.2.1 葡萄盆栽苗的种植第42页
        3.2.2 葡萄霜霉菌的扩繁第42页
        3.2.3 葡萄的活体接菌第42页
        3.2.4 葡萄霜霉菌的组织学观察第42-43页
        3.2.5 葡萄叶片RNA的提取第43页
        3.2.6 cDNA文库构建和测序第43-44页
        3.2.7 数据分析第44-45页
        3.2.8 荧光定量PCR验证第45页
        3.2.9 水杨酸(SA)和茉莉酸(JA)的提取与测定第45-46页
        3.2.10 芪类化合物的提取与测定第46页
        3.2.11 过氧化氢的提取与测定第46页
    3.3 结果与分析第46-61页
        3.3.1 霜霉菌菌株JL-7-2和ZJ-1-1侵染山葡萄‘双红’后的组织学观察第46-48页
        3.3.2 总RNA质量评估第48页
        3.3.3 转录组测序数据统计结果第48-50页
        3.3.4 山葡萄‘双红’中参与非亲和互作基因的鉴定第50页
        3.3.5 非亲和基因的GO和pathway富集分析第50-53页
        3.3.6 植物与病原菌互作第53-54页
        3.3.7 信号传导第54-56页
        3.3.8 次级代谢第56页
        3.3.9 病程相关蛋白第56-57页
        3.3.10 泛素化介导的蛋白水解第57页
        3.3.11 初级代谢第57页
        3.3.12 转录因子第57-58页
        3.3.13 转录组数据的qRT-PCR验证第58-60页
        3.3.14 植物激素、芪类化合物和ROS的测定结果第60-61页
    3.4 讨论第61-63页
第四章 山葡萄‘双红’VaRGA1基因的抗生物和非生物胁迫研究第63-88页
    4.1 实验材料第63-65页
        4.1.1 供试植物材料和植物病原菌第63页
        4.1.2 主要试剂第63-64页
        4.1.3 主要仪器第64-65页
        4.1.4 供试引物第65页
    4.2 实验方法第65-75页
        4.2.1 植物材料的培养第65-66页
        4.2.2 葡萄的活体接菌第66页
        4.2.3 山葡萄‘双红’的干旱处理和盐处理第66页
        4.2.4 RNA的提取第66页
        4.2.5 cDNA的合成第66-67页
        4.2.6 荧光定量PCR分析第67页
        4.2.7 山葡萄‘双红’VaRGA1基因的克隆第67-69页
        4.2.8 山葡萄‘双红’VaRGA1基因表达载体构建第69-70页
        4.2.9 农杆菌电击感受态的制备第70页
        4.2.10 农杆菌的电击转化第70-71页
        4.2.11 VaRGA1基因的亚细胞定分析第71页
        4.2.12 葡萄的瞬时转化和霜霉菌接种第71页
        4.2.13 烟草的稳定转化第71-73页
        4.2.14 转基因烟草抗病性分析第73页
        4.2.15 烟草激素含量的提取与测定第73页
        4.2.16 转基因烟草对抗旱胁迫耐受性分析第73-74页
        4.2.17 转基因烟草对抗盐胁迫耐受性分析第74-75页
    4.3 结果与分析第75-85页
        4.3.1 山葡萄‘双红’VaRGA1基因的序列特征第75-77页
        4.3.2 山葡萄‘双红’的VaRGA1受到霜霉菌侵染后的表达模式第77-78页
        4.3.3 山葡萄‘双红’的VaRGA1基因受到非生物胁迫后的表达模式第78页
        4.3.4 基因VaRGA1的亚细胞定位第78-80页
        4.3.5 VaRGA1基因的过表达提高对卵菌病原菌的抗性第80页
        4.3.6 VaRGA1基因的表达激活了SA信号传导途径和苯丙烷类代谢途径第80-82页
        4.3.7 VaRGA1转基因烟草表现出增强的耐旱性第82-84页
        4.3.8 VaRGA1转基因烟草表现出增强的耐盐性第84-85页
    4.4 讨论第85-88页
第五章 葡萄霜霉菌的RxLR类效应因子的特征与功能研究第88-116页
    5.1 实验材料第88-92页
        5.1.1 供试植物材料和植物病原菌第88页
        5.1.2 主要试剂第88-91页
        5.1.3 主要仪器第91-92页
    5.2 实验方法第92-101页
        5.2.1 植物材料的培养第92页
        5.2.2 植物病原菌的接种第92页
        5.2.3 RNA的提取第92页
        5.2.4 cDNA文库构建和测序第92页
        5.2.5 转录组从头组装和RxLR效应因子预测第92-93页
        5.2.6 cDNA的合成第93页
        5.2.7 荧光定量PCR分析第93页
        5.2.8 农杆菌感受态的制备第93页
        5.2.9 RxLR类效应因子的亚细胞定位分析第93-94页
        5.2.10 RxLR类效应因子抑制PCD的功能分析第94页
        5.2.11 利用酵母双杂实验筛选效应因子PvRxL13在葡萄体内的靶蛋白第94-97页
        5.2.12 分子荧光互补(BiFC)第97-98页
        5.2.13 效应因子PvRxL13与靶蛋白HY5在体内的共定位分析第98页
        5.2.14 Western Blot分析第98-99页
        5.2.15 免疫共沉淀(CoIP)第99页
        5.2.16 病毒介导的基因沉默(VIGS)第99-100页
        5.2.17 GUS定性和定量检测第100页
        5.2.18 葡萄的瞬时转化第100页
        5.2.19 烟草的稳定转化第100页
        5.2.20 转基因烟草抗病性分析第100-101页
        5.2.21 植物激素的提取与测定第101页
        5.2.22 过氧化氢的测定第101页
        5.2.23 效应因子PvRxL13的转基因烟草的数字表达谱分析第101页
    5.3 结果与分析第101-115页
        5.3.1 RNA质量评估第101-102页
        5.3.2 转录组测序与重头组装第102页
        5.3.3 霜霉菌分泌的胞外和胞内效应因子第102-103页
        5.3.4 葡萄霜霉菌菌株JL-7-2在侵染不同抗性寄主的过程中RxLR类效应因子的表达谱分析第103-104页
        5.3.5 葡萄霜霉菌菌株JL-7-2的RxLR类效应因子的亚细胞定位第104-105页
        5.3.6 葡萄霜霉菌菌株JL-7-2的RxLR类效应因子抑制Bax、INF1和Avr3a-R3a引起的PCD第105-106页
        5.3.7 效应因子PvRxL13与葡萄的转录因子HY5互作第106-108页
        5.3.8 效应因子PvRxL13的TPR结构域和核定位信号是其与HY5互作和抑制PCD所必须的第108-109页
        5.3.9 转录因子HY5的bzip结构是其与效应因子PvRxL13互作必不可少的第109-110页
        5.3.10 靶基因HY5的沉默降低了烟草对疫霉病菌的抗性第110页
        5.3.11 效应因子PvRxL13抑制转录因子HY5的转录活性第110-112页
        5.3.12 效应因子PvRxL13的表达降低了寄主的抗病性第112-113页
        5.3.13 转基因烟草全基因组表达分析第113-115页
    5.4 讨论第115-116页
结论第116-117页
参考文献第117-129页
附录第129-134页
致谢第134-135页
作者简介第135页

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