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乳酸乳球菌KLDS4.0325全基因组序列的测定及比较分析

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
1 前言第13-26页
    1.1 立题背景第13-14页
    1.2 文献综述第14-24页
        1.2.1 乳酸菌概述第14页
        1.2.2 微生物基因组学第14-17页
        1.2.3 乳酸菌工业发酵的重要代谢产物合成途径第17-24页
    1.3 研究的目的和意义第24-25页
        1.3.1 研究目的第24页
        1.3.2 研究意义第24-25页
    1.4 研究内容第25页
    1.5 课题来源第25-26页
2 材料与方法第26-30页
    2.1 实验材料第26-27页
        2.1.1 供试菌株第26页
        2.1.2 培养基第26页
        2.1.3 主要试剂第26-27页
        2.1.4 主要仪器第27页
    2.2 实验方法第27-30页
        2.2.1 菌株的活化及总DNA的提取第27页
        2.2.2 基因组的测序、组装及注释第27-28页
        2.2.3 生物信息学分析第28页
        2.2.4 菌株发酵特性测定第28-30页
3 结果与分析第30-66页
    3.1 菌株KLDS4.0325的DNA提取第30页
    3.2 菌株KLDS4.0325的16S rRNA序列相似性分析第30-31页
    3.3 菌株KLDS4.0325的染色体基因组一般特征第31-33页
    3.4 乳酸乳球菌KLDS4.0325的蛋白质水解系统的比较分析第33-36页
        3.4.1 乳酸乳球菌KLDS4.0325的细胞壁粘附蛋白第33-34页
        3.4.2 乳酸乳球菌KLDS4.0325的肽转运系统第34-35页
        3.4.3 乳酸乳球菌KLDS4.0325的肽酶第35-36页
    3.5 乳酸乳球菌KLDS4.0325氨基酸风味形成途径的比较分析第36-41页
        3.5.1 乳酸乳球菌KLDS4.0325转氨途径涉及的酶第36-39页
        3.5.2 乳酸乳球菌KLDS4.0325的蛋氨酸/半胱氨酸代谢途径涉及的酶第39-41页
    3.6 乳酸乳球菌KLDS4.0325的糖代谢过程及乳酸生物合成途径的比较分析第41-53页
        3.6.1 乳酸乳球菌KLDS4.0325的糖转运系统第41-44页
        3.6.2 乳酸乳球菌KLDS4.0325将转运至细胞内的相关糖类物质转化为糖酵解途径中间产物的过程第44-50页
        3.6.3 乳酸乳球菌KLDS4.0325利用产生的糖酵解中间产物进行乳酸合成的途径第50-53页
    3.7 乳酸乳球菌KLDS4.0325的B族维生素生物合成途径的比较分析第53-56页
        3.7.1 乳酸乳球菌KLDS4.0325的叶酸生物合成途径第53-54页
        3.7.2 乳酸乳球菌KLDS4.0325的核黄素生物合成途径第54-55页
        3.7.3 乳酸乳球菌KLDS4.0325的其它B族维生素合成途径第55-56页
    3.8 乳酸乳球菌KLDS4.0325的细菌素合成基因簇分析第56-58页
    3.9 乳酸乳球菌KLDS4.0325的冷应激蛋白基因分析第58-63页
        3.9.1 冷应激蛋白CspD第58-60页
        3.9.2 冷应激蛋白CspE第60-63页
    3.10 功能特性的验证试验第63-66页
        3.10.1 菌株KLDS4.0325的生长曲线第63页
        3.10.2 菌株KLDS4.0325的蛋白质水解性能的测定结果第63-64页
        3.10.3 菌株KLDS4.0325的产酸能力测定结果第64-65页
        3.10.4 菌株KLDS4.0325的糖发酵实验结果第65-66页
4 讨论第66-70页
    4.1 菌株KLDS4.0325的蛋白质水解系统第66-67页
    4.2 菌株KLDS4.0325的氨基酸降解成风味物质系统第67-68页
    4.3 菌株KLDS4.0325的糖代谢系统第68页
    4.4 菌株KLDS4.0325的B族维生素合成系统第68-69页
    4.5 菌株KLDS4.0325其它基因的预测第69-70页
5 结论第70-71页
致谢第71-72页
参考文献第72-77页
附录第77-88页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第88页

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