| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第16-37页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第16-18页 |
| 1.2 古井贡酒酿酒工艺及其酿酒微生物群落 | 第18-27页 |
| 1.2.1 大曲制作工艺及其微生物群落 | 第18-23页 |
| 1.2.2 浓香型白酒发酵工艺及其相关微生物群落 | 第23-27页 |
| 1.3 白酒中呈香物质的研究现状 | 第27-29页 |
| 1.4 酿酒微生物群落结构研究技术进展 | 第29-36页 |
| 1.4.1 传统纯培养技术研究酿酒微生物群落 | 第30页 |
| 1.4.2 磷酸脂肪酸技术（PLFA）研究微生物群落结构 | 第30-31页 |
| 1.4.3 基于 16S rDNA/ITS序列信息分析微生物群落结构 | 第31-35页 |
| 1.4.4 基于宏基因组信息分析微生物群落多样性 | 第35页 |
| 1.4.5 荧光定量qPCR方法检测微生物群落中的物种含量 | 第35-36页 |
| 1.5 本文的主要研究内容 | 第36-37页 |
| 第2章 实验原料与研究方法 | 第37-57页 |
| 2.1 实验原料及仪器设备 | 第37-41页 |
| 2.1.1 实验原料与试剂 | 第37-38页 |
| 2.1.2 实验仪器及设备 | 第38-40页 |
| 2.1.3 菌种来源 | 第40页 |
| 2.1.4 实验培养基 | 第40-41页 |
| 2.2 实验方法 | 第41-51页 |
| 2.2.1 本论文研究用到的取样方法 | 第41-43页 |
| 2.2.2 微生物样本基因组DNA的提取 | 第43页 |
| 2.2.3 核糖体 16S/ITS TA克隆文库构建 | 第43-44页 |
| 2.2.4 克隆测序序列处理 | 第44-45页 |
| 2.2.5 克隆测序序列的系统分类和统计学分析 | 第45页 |
| 2.2.6 克隆测序序列的系统发育树分析 | 第45-46页 |
| 2.2.7 绝对定量qPCR方法检测具有全基因组信息的物种的含量 | 第46-48页 |
| 2.2.8 古井样本 16S rDNA高通量测序 | 第48页 |
| 2.2.9 古井酒醅样本的denovo宏基因组高通量测序 | 第48-49页 |
| 2.2.10 古井酒样中各组分的气相色谱检测 | 第49页 |
| 2.2.11 古井窖泥中代谢组分的液相色谱-质谱联用检测 | 第49-51页 |
| 2.2.12 古井酒样的口感鉴定 | 第51页 |
| 2.2.13 古井微生物群落与酒样中风味物质之间的CCA分析 | 第51页 |
| 2.3 酒样中风味物质与其口感打分之间的多元线性回归模型 | 第51-55页 |
| 2.3.1 最小二乘法回归分析步骤和代码 | 第52-53页 |
| 2.3.2 Lasso回归分析步骤和代码 | 第53-55页 |
| 2.4 相关术语简称介绍 | 第55-57页 |
| 第3章 古井特色微生物群落结构解析 | 第57-82页 |
| 3.1 引言 | 第57-58页 |
| 3.2 古井大曲特色微生物群落结构解析 | 第58-67页 |
| 3.2.1 古井大曲 16S rDNA/ITS克隆文库 α 群落多样性参数解析 | 第58-59页 |
| 3.2.2 古井大曲样本中原核微生物的基本组成和系统发育分析 | 第59-62页 |
| 3.2.3 古井大曲样本中真核微生物的基本组成和系统发育分析 | 第62-64页 |
| 3.2.4 古井大曲中的主要特色微生物种类分析 | 第64-67页 |
| 3.3 古井窖泥微生物群落结构解析 | 第67-75页 |
| 3.3.1 古井窖泥 16S rDNA克隆文库分析 | 第67-69页 |
| 3.3.2 古井窖泥中微生物群落基本组成分析 | 第69-72页 |
| 3.3.3 新老窖池中池壁泥池底泥的微生物群落差异分析 | 第72-75页 |
| 3.4 古井酒醅样本中物种组成谱的深入测序解析 | 第75-80页 |
| 3.4.1 酒醅中微生物群落组成分析 | 第75-79页 |
| 3.4.2 各种酿酒微生物群落中主要乳酸杆菌种类 | 第79-80页 |
| 3.5 本章小结 | 第80-82页 |
| 第4章 不同质量酿酒菌群组成差异解析 | 第82-120页 |
| 4.1 引言 | 第82-83页 |
| 4.2 本章相关的实验样本情况介绍 | 第83-86页 |
| 4.2.1 古井不同厂区的窖池实验样本介绍 | 第83-85页 |
| 4.2.2 古井不同厂区窖池生产的酒样的打分鉴定 | 第85-86页 |
| 4.3 窖泥和酒醅微生物群落多样性统计学分析 | 第86-91页 |
| 4.3.1 窖泥和酒醅 α 微生物群落多样性参数统计学比较分析 | 第86-89页 |
| 4.3.2 主成分分析法比较分析窖泥和酒醅样本的微生物群落差异性 | 第89-91页 |
| 4.4 窖泥和酒醅样本中微生物群落组成的比较与分析 | 第91-96页 |
| 4.4.1 窖泥和酒醅在门水平上的微生物群落结构分析 | 第91-93页 |
| 4.4.2 窖泥和酒醅微生物群落在属水平上的微生物群落结构分析 | 第93-96页 |
| 4.5 窖泥和酒醅微生物群落中乳酸杆菌差异性分析 | 第96-100页 |
| 4.6 窖池发酵微生物群落OTU相关性研究 | 第100-109页 |
| 4.6.1 优质窖泥与普通窖泥微生物群落OTU相关性特征比较分析 | 第100-103页 |
| 4.6.2 优质酒醅与普通酒醅微生物群落OTU相关性特征比较分析 | 第103-105页 |
| 4.6.3 优质与普通窖泥菌群代谢功能变化与菌群之间相互作用分析 | 第105-109页 |
| 4.7 古井菌群结构的快速定量方法研究 | 第109-119页 |
| 4.7.1 物种特异性引物的设计 | 第109-114页 |
| 4.7.2 物种特异性引物的特异性验证 | 第114-115页 |
| 4.7.3 物种特异性引物qPCR定量检测微生物群落变化研究 | 第115-119页 |
| 4.8 本章小结 | 第119-120页 |
| 第5章 不同酒质相关的风味物质和菌群之间的代谢关系解析 | 第120-165页 |
| 5.1 引言 | 第120页 |
| 5.2 古井贡酒酒体风味物质的色谱解析 | 第120-135页 |
| 5.2.1 两个排次酒样中风味物质组成差异 | 第120-129页 |
| 5.2.2 不同厂区酒样风味物质含量的差异显著性分析 | 第129-131页 |
| 5.2.3 酒样中各风味物质含量与窖龄之间的相关性 | 第131-133页 |
| 5.2.4 酒样中各风味物质含量与口感之间的相关性 | 第133-135页 |
| 5.3 风味物质含量与窖泥菌群之间的CCA关联分析 | 第135-139页 |
| 5.3.1 含量最多的风味物质与窖泥菌群之间的CCA关联分析 | 第135-136页 |
| 5.3.2 差异最显著的风味物质与窖泥菌群之间的CCA关联分析 | 第136-137页 |
| 5.3.3 与窖龄最相关的风味物质与窖泥菌群之间的CCA关联分析 | 第137-138页 |
| 5.3.4 与口感最相关的风味物质与窖泥菌群之间的CCA关联分析 | 第138-139页 |
| 5.4 酒样中风味物质与口感之间的回归模型的构建 | 第139-147页 |
| 5.4.1 最小二乘法线性回归模型 | 第140-141页 |
| 5.4.2 Lasso多元线性回归模型 | 第141-144页 |
| 5.4.3 Lasso多元线性回归模型的验证 | 第144-146页 |
| 5.4.4 A、B厂区酒样的Lasso模型构建 | 第146-147页 |
| 5.4.5 C厂区酒样的Lasso模型构建 | 第147页 |
| 5.5 窖泥中的代谢组分解析 | 第147-159页 |
| 5.5.1 液相色谱-质谱联用解析古井窖泥中化学物质组成 | 第148-154页 |
| 5.5.2 窖泥样本中含量最多的代谢成分分析 | 第154-159页 |
| 5.6 白酒酿酒过程中发酵微生物群落可能的变化过程分析 | 第159-163页 |
| 5.7 本章小结 | 第163-165页 |
| 结论 | 第165-167页 |
| 论文创新点 | 第167-168页 |
| 展望 | 第168-169页 |
| 参考文献 | 第169-188页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文及其它成果 | 第188-191页 |
| 致谢 | 第191-192页 |
| 个人简历 | 第192页 |
