| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-18页 |
| ·氧化葡萄糖酸杆菌的研究进展 | 第9-10页 |
| ·氧化葡萄糖酸杆菌的应用研究进展 | 第9页 |
| ·氧化葡萄糖酸杆菌的启动子研究进展 | 第9-10页 |
| ·原核生物启动子的研究进展 | 第10-12页 |
| ·启动子的结构、分类与功能 | 第10-11页 |
| ·启动子的研究方法 | 第11-12页 |
| ·高通量转录组测序(RNA-Seq)的研究进展 | 第12-15页 |
| ·RNA-Seq的原理及流程 | 第12-15页 |
| ·RNA-Seq的主要应用及在启动子筛选方面的研究进展 | 第15页 |
| ·课题背景与意义 | 第15-16页 |
| ·课题研究内容 | 第16-18页 |
| 第二章 材料与方法 | 第18-25页 |
| ·实验材料 | 第18-20页 |
| ·菌种和质粒 | 第18页 |
| ·培养基 | 第18页 |
| ·试剂与试剂盒 | 第18-19页 |
| ·引物序列 | 第19-20页 |
| ·主要仪器 | 第20页 |
| ·实验方法 | 第20-25页 |
| ·RNA-Seq的细胞发酵培养 | 第20页 |
| ·Total RNA的提取与mRNA纯化 | 第20页 |
| ·RNA-Seq的文库构建与上机测序 | 第20-21页 |
| ·RNA-Seq的生物信息学分析 | 第21页 |
| ·启动子检测质粒的构建 | 第21-22页 |
| ·启动子检测重组菌株的构建 | 第22-23页 |
| ·egfp基因的荧光定量PCR检测 | 第23页 |
| ·启动子检测重组菌的荧光检测 | 第23页 |
| ·D-山梨醇脱氢酶基因的研究 | 第23页 |
| ·sldAB1 过表达重组菌的构建 | 第23-24页 |
| ·sldAB1 过表达重组菌的摇瓶发酵 | 第24-25页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第25-41页 |
| ·RNA-Seq的测序结果 | 第25-30页 |
| ·基于梯度组成型启动子筛选的转录组测序 | 第25页 |
| ·文库构建的质量控制 | 第25-26页 |
| ·原始数据的序列质量评估与预处理 | 第26-28页 |
| ·基因组匹配及基因表达分析 | 第28-29页 |
| ·小结 | 第29-30页 |
| ·梯度强度组成型启动子的筛选与荧光检测 | 第30-35页 |
| ·基于RNA-Seq的梯度组成型启动子的初步筛选 | 第30-31页 |
| ·启动子荧光检测重组菌的构建 | 第31-32页 |
| ·荧光定量PCR检测启动子强度 | 第32-33页 |
| ·荧光显微镜与荧光酶标仪检测启动子强度 | 第33-35页 |
| ·小结 | 第35页 |
| ·强启动子Pdnak扩增表达D-山梨醇脱氢酶关键基因sldAB1 | 第35-41页 |
| ·D-山梨醇脱氢酶基因的BLAST比对 | 第35-36页 |
| ·D-山梨醇脱氢酶关键基因的确定 | 第36-37页 |
| ·D-山梨醇脱氢酶关键基因sldAB1 过表达菌株的构建 | 第37-38页 |
| ·重组菌的摇瓶发酵结果 | 第38-40页 |
| ·小结 | 第40-41页 |
| 主要结论与展望 | 第41-43页 |
| 主要结论 | 第41页 |
| 展望 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第48-49页 |
| 附录：启动子区域及核心序列 | 第49-50页 |
