| 致谢 | 第7-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第16-30页 |
| 1.1 乳酸菌研究进展 | 第16-18页 |
| 1.1.1 乳酸菌简介 | 第16-17页 |
| 1.1.2 乳酸菌功能 | 第17-18页 |
| 1.2 噬菌体 | 第18-25页 |
| 1.2.1 乳酸菌噬菌体 | 第19-20页 |
| 1.2.2 噬菌体感染乳酸菌的分子机制 | 第20-21页 |
| 1.2.3 乳酸菌抗噬菌体机制 | 第21-25页 |
| 1.3 噬菌体污染 | 第25-29页 |
| 1.3.1 乳酸菌噬菌体污染来源 | 第25-27页 |
| 1.3.2 乳酸菌噬菌体污染的防治措施 | 第27-29页 |
| 1.4 本课题立体依据及研究内容 | 第29-30页 |
| 1.4.1 立题依据及研究目的 | 第29页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第29-30页 |
| 第二章 植物乳杆菌抗噬菌体菌株的选育 | 第30-41页 |
| 2.1 前言 | 第30页 |
| 2.2 材料与仪器 | 第30-32页 |
| 2.2.1 菌株及噬菌体 | 第30页 |
| 2.2.2 培养基及主要试剂 | 第30-31页 |
| 2.2.3 主要仪器设备 | 第31-32页 |
| 2.3 试验方法 | 第32-34页 |
| 2.3.1 菌种活化 | 第32页 |
| 2.3.2 噬菌体的增殖 | 第32页 |
| 2.3.3 噬菌体最佳感染复数的测定 | 第32页 |
| 2.3.4 抗噬菌体菌株的分离 | 第32-33页 |
| 2.3.5 抗噬菌体菌株的形态观察 | 第33页 |
| 2.3.6 抗性菌株及敏感菌株测序鉴定 | 第33页 |
| 2.3.7 抗噬菌体菌株的抗性特征测定 | 第33-34页 |
| 2.3.8 噬菌体对抗性菌株的吸附测定 | 第34页 |
| 2.3.9 抗噬菌体菌株生长状况和产酸特性 | 第34页 |
| 2.4 结果和分析 | 第34-40页 |
| 2.4.1 噬菌体的最佳感染复数 | 第34-35页 |
| 2.4.2 抗噬菌体菌株的筛选结果 | 第35页 |
| 2.4.3 抗噬菌体菌株的形态 | 第35-36页 |
| 2.4.4 抗性菌株及敏感菌株测序鉴定 | 第36页 |
| 2.4.5 抗噬菌体菌株的抗性及其稳定性 | 第36-38页 |
| 2.4.6 抗性菌株及敏感菌株的吸附特性 | 第38页 |
| 2.4.7 抗噬菌体菌株生长状况和产酸特性 | 第38-40页 |
| 2.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 第三章 植物乳杆菌与抗噬菌体菌株转录组学分析 | 第41-60页 |
| 3.1 前言 | 第41页 |
| 3.2 材料与仪器 | 第41-42页 |
| 3.2.1 菌株 | 第41页 |
| 3.2.2 培养基及主要试剂 | 第41-42页 |
| 3.2.3 主要仪器设备 | 第42页 |
| 3.3 试验方法 | 第42-44页 |
| 3.3.1 样品的制备 | 第42页 |
| 3.3.2 总RNA提取 | 第42-43页 |
| 3.3.3 测序文库构建及质检 | 第43页 |
| 3.3.4 上机测序与数据前处理 | 第43页 |
| 3.3.5 基因表达差异分析 | 第43-44页 |
| 3.3.6 Gene ontology(GO)与KEGG Pathway代谢途经分析 | 第44页 |
| 3.4 结果与分析 | 第44-58页 |
| 3.4.1 转录组测序样品RNA的质量控制 | 第44页 |
| 3.4.2 参考基因组及数据比对 | 第44-46页 |
| 3.4.3 植物乳杆菌敏感菌株与抗噬菌体菌株基因表达差异 | 第46-58页 |
| 3.5 小结 | 第58-60页 |
| 第四章 噬菌体保存方法和灭活条件的研究 | 第60-72页 |
| 4.1 前言 | 第60-61页 |
| 4.2 材料和仪器 | 第61-62页 |
| 4.2.1 菌株及噬菌体 | 第61页 |
| 4.2.2 培养基及主要试剂 | 第61页 |
| 4.2.3 主要仪器设备 | 第61-62页 |
| 4.3 试验方法 | 第62-63页 |
| 4.3.1 噬菌体增殖 | 第62页 |
| 4.3.2 保存剂及保存方法 | 第62页 |
| 4.3.3 噬菌体裂解活性检测 | 第62页 |
| 4.3.4 商业灭菌剂对噬菌体的灭活效果 | 第62-63页 |
| 4.4 结果与分析 | 第63-70页 |
| 4.4.1 噬菌体的保存结果 | 第63-65页 |
| 4.4.2 不同浓度的乙醇对噬菌体的灭活效果 | 第65-66页 |
| 4.4.3 不同浓度的异丙醇对噬菌体的灭活效果 | 第66-67页 |
| 4.4.4 不同浓度的次氯酸钠对噬菌体的灭活效果 | 第67-69页 |
| 4.4.5 不同浓度的过氧乙酸对噬菌体的灭活效果 | 第69-70页 |
| 4.5 本章小结 | 第70-72页 |
| 第五章 结论与展望 | 第72-74页 |
| 5.1 主要结论 | 第72页 |
| 5.2 后续研究展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-83页 |
| 附:作者简历 | 第83页 |