| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 脂多糖分子的结构功能及其合成特性 | 第10-14页 |
| 1.1.1 细菌脂多糖的分子结构 | 第10-11页 |
| 1.1.2 核心多糖的结构多样性 | 第11-12页 |
| 1.1.3 脂多糖分子的合成 | 第12-13页 |
| 1.1.4 脂多糖的生物活性及其功能 | 第13-14页 |
| 1.2 细菌鞭毛和胞外多糖 | 第14-16页 |
| 1.2.1 鞭毛结构 | 第14页 |
| 1.2.2 大肠杆菌鞭毛合成的表达调控 | 第14-15页 |
| 1.2.3 胞外多糖 | 第15-16页 |
| 1.3 细菌菌膜的形成及其调控机制 | 第16-18页 |
| 1.3.1 菌膜的形成过程及结构 | 第16页 |
| 1.3.2 菌膜的功能 | 第16-17页 |
| 1.3.3 群体效应对菌膜形成的调控机制 | 第17页 |
| 1.3.4 鞭毛在菌膜形成中的作用 | 第17-18页 |
| 1.4 细胞表面疏水性及外膜渗透性 | 第18页 |
| 1.5 本论文的主要研究内容 | 第18-20页 |
| 1.5.1 立项依据及研究意义 | 第18页 |
| 1.5.2 主要研究内容 | 第18-20页 |
| 第二章 脂多糖分子核心多糖突变菌株构建 | 第20-35页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 材料和方法 | 第20-28页 |
| 2.2.1 菌株、质粒和引物 | 第20-22页 |
| 2.2.2 试剂和仪器 | 第22-23页 |
| 2.2.3 培养基和培养条件 | 第23-24页 |
| 2.2.4 分子生物学基本操作 | 第24-25页 |
| 2.2.5 大肠杆菌核心多糖敲除突变菌株的构建 | 第25-26页 |
| 2.2.6 突变菌株的回补构建 | 第26-27页 |
| 2.2.7 大肠杆菌脂多糖分子的提取及鉴定 | 第27页 |
| 2.2.8 大肠杆菌类脂A的提取及鉴定 | 第27-28页 |
| 2.2.9 细菌生长曲线绘制 | 第28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-34页 |
| 2.3.1 大肠杆菌敲除质粒构建 | 第28-30页 |
| 2.3.2 核心多糖敲除突变菌株的构建 | 第30-31页 |
| 2.3.3 核心多糖基因突变回补菌株构建 | 第31页 |
| 2.3.4 菌株脂多糖分子的提取鉴定 | 第31-32页 |
| 2.3.5 菌株类脂A的提取鉴定 | 第32-33页 |
| 2.3.6 核心多糖突变菌株生长曲线绘制 | 第33-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34页 |
| 2.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第三章 核心多糖结构变化对细胞膜壁结构的影响 | 第35-49页 |
| 3.1 引言 | 第35页 |
| 3.2 材料与方法 | 第35-40页 |
| 3.2.1 菌株、质粒及引物 | 第35-36页 |
| 3.2.2 试剂和仪器 | 第36-37页 |
| 3.2.3 培养基和培养条件 | 第37页 |
| 3.2.4 细胞外膜渗透性的测定 | 第37页 |
| 3.2.5 细菌最小抑菌浓度（MIC）的测定 | 第37-38页 |
| 3.2.6 细菌细胞的透射电镜观察 | 第38页 |
| 3.2.7 鞭毛合成基因的表达分析 | 第38页 |
| 3.2.8 细菌荚膜多糖的媒染观察 | 第38-39页 |
| 3.2.9 细菌荚膜多糖的提取 | 第39页 |
| 3.2.10 荚膜多糖含量的测定 | 第39页 |
| 3.2.11 荚膜多糖合成途径关键基因的转录水平分析 | 第39-40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-47页 |
| 3.3.1 大肠杆菌细胞膜渗透性测定 | 第40页 |
| 3.3.2 大肠杆菌最小抑菌浓度测定 | 第40-41页 |
| 3.3.3 核心多糖结构变化对大肠杆菌鞭毛的影响 | 第41-42页 |
| 3.3.4 鞭毛合成相关基因RT-PCR分析 | 第42-43页 |
| 3.3.5 核心多糖突变菌株的粘液化 | 第43-44页 |
| 3.3.6 waaF基因回补菌株的形态观察 | 第44页 |
| 3.3.7 荚膜多糖的媒染显微观察 | 第44-45页 |
| 3.3.8 荚膜多糖含量测定 | 第45页 |
| 3.3.9 大肠杆菌荚膜多糖合成基因RT-PCR分析 | 第45-47页 |
| 3.4 讨论 | 第47页 |
| 3.5 本章小结 | 第47-49页 |
| 第四章 核心多糖结构变化对细胞内部代谢的影响 | 第49-62页 |
| 4.1 引言 | 第49页 |
| 4.2 材料与方法 | 第49-52页 |
| 4.2.1 菌株、质粒及引物 | 第49-50页 |
| 4.2.2 试剂和仪器 | 第50页 |
| 4.2.3 培养基和培养条件 | 第50页 |
| 4.2.4 大肠杆菌发酵参数测定 | 第50-51页 |
| 4.2.5 大肠杆菌胞内蛋白质含量测定 | 第51-52页 |
| 4.2.6 产PHB重组菌的显微观察 | 第52页 |
| 4.2.7 重组菌产PHB含量测定 | 第52页 |
| 4.2.8 产PHB重组菌发酵参数测定 | 第52页 |
| 4.3 结果与分析 | 第52-60页 |
| 4.3.1 大肠杆菌核心多糖突变菌株的发酵参数测定 | 第52-55页 |
| 4.3.2 大肠杆菌核心多糖结构变化对胞内蛋白质含量的影响 | 第55页 |
| 4.3.3 核心多糖结构变化对大肠杆菌PHB合成的影响 | 第55-57页 |
| 4.3.4 产PHB重组菌发酵参数测定 | 第57-60页 |
| 4.4 讨论 | 第60-61页 |
| 4.5 本章小结 | 第61-62页 |
| 第五章 核心多糖结构变化对细胞间相互作用的影响 | 第62-75页 |
| 5.1 引言 | 第62-63页 |
| 5.2 材料与方法 | 第63-65页 |
| 5.2.1 菌株、质粒及引物 | 第63页 |
| 5.2.2 试剂和仪器 | 第63页 |
| 5.2.3 培养基和培养条件 | 第63页 |
| 5.2.4 分子生物学操作 | 第63-64页 |
| 5.2.5 菌膜形成条件分析 | 第64页 |
| 5.2.6 核心多糖结构变化对菌膜形成的影响 | 第64页 |
| 5.2.7 大肠杆菌自凝集特性分析 | 第64-65页 |
| 5.2.8 自凝集因子Ag43的表达在大肠杆菌自凝集中的作用 | 第65页 |
| 5.2.9 细胞表面疏水性测定 | 第65页 |
| 5.2.10 信号分子编码基因luxS的转录水平分析 | 第65页 |
| 5.3 结果与分析 | 第65-73页 |
| 5.3.1 培养条件对大肠杆菌菌膜形成的影响 | 第65-66页 |
| 5.3.2 核心多糖结构对大肠杆菌菌膜形成的影响 | 第66-68页 |
| 5.3.3 大肠杆菌菌膜结构电镜观察 | 第68页 |
| 5.3.4 不同核心多糖结构对细菌自凝集特性的影响 | 第68-69页 |
| 5.3.5 培养温度及菌液浓度对菌株自凝集的影响 | 第69-70页 |
| 5.3.6 自转运蛋白Ag43的表达对大肠杆菌凝集特性的影响 | 第70-71页 |
| 5.3.7 核心多糖结构变化对细胞表面疏水性的影响 | 第71-72页 |
| 5.3.8 群体效应信号分子转录水平分析 | 第72-73页 |
| 5.4 讨论 | 第73-74页 |
| 5.5 本章小结 | 第74-75页 |
| 第六章 大肠杆菌细胞转录组基因表达差异分析 | 第75-94页 |
| 6.1 引言 | 第75页 |
| 6.2 材料与方法 | 第75-77页 |
| 6.2.1 菌株 | 第75页 |
| 6.2.2 试剂和仪器 | 第75-76页 |
| 6.2.3 培养基和培养条件 | 第76页 |
| 6.2.4 转录组分析 | 第76页 |
| 6.2.5 差异表达基因的筛选与功能分析 | 第76-77页 |
| 6.3 结果与分析 | 第77-92页 |
| 6.3.1 转录组分析总览 | 第77-78页 |
| 6.3.2 差异表达基因的富集分析 | 第78-82页 |
| 6.3.3 鞭毛合成相关基因的差异表达分析 | 第82-88页 |
| 6.3.4 细菌趋化性相关基因的差异表达分析 | 第88-90页 |
| 6.3.5 菌膜形成相关基因的差异表达分析 | 第90-92页 |
| 6.3.6 部分差异基因的RT-PCR验证 | 第92页 |
| 6.4 讨论 | 第92-93页 |
| 6.5 本章小结 | 第93-94页 |
| 主要结论与展望 | 第94-96页 |
| 论文主要创新点 | 第96-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-105页 |
| 附录 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第105页 |
