| 摘要 | 第2-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 引言 | 第15-16页 |
| 第一章 代谢组学技术的基本原理和食品品质控制的应用 | 第16-32页 |
| 1.1 代谢组学技术的的基本原理 | 第17-19页 |
| 1.1.1 化合物分析技术 | 第17-18页 |
| 1.1.2 数据处理和分析方法 | 第18-19页 |
| 1.2 代谢组学技术在食品安全和质量控制领域的应用 | 第19-31页 |
| 1.2.1 代谢组学技术鉴别鉴定在食品原料和产品 | 第19-23页 |
| 1.2.2 代谢组学技术在预测食品储运和机理 | 第23-27页 |
| 1.2.3 代谢组学技术预测食源性致病微生物的检测和预测方面应用 | 第27-31页 |
| 1.3 结论 | 第31-32页 |
| 第二章 典型贝类海洋生物活体储藏过程生存能力和能量储备物质的研究 | 第32-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第33-34页 |
| 2.1.1 试剂与材料 | 第33页 |
| 2.1.1.1 所用试剂 | 第33页 |
| 2.1.1.2 实验材料 | 第33页 |
| 2.1.2 实验设计与实验方法 | 第33-34页 |
| 2.1.2.1 模拟储藏 | 第33页 |
| 2.1.2.2 存活率检测 | 第33-34页 |
| 2.1.2.3 糖原水平测定 | 第34页 |
| 2.1.2.4 乳酸水平测定 | 第34页 |
| 2.1.2.5 蛋白质水平测定 | 第34页 |
| 2.1.2.6 统计分析和图表绘制 | 第34页 |
| 2.2 实验结果 | 第34-39页 |
| 2.2.1 存活曲线 | 第34-35页 |
| 2.2.2 糖原水平变化 | 第35-36页 |
| 2.2.3 乳酸水平变化 | 第36-38页 |
| 2.2.4 蛋白质水平 | 第38-39页 |
| 2.3 讨论 | 第39-41页 |
| 第三章 基于靶向代谢组学分析典型无脊椎海洋生物活体储藏过程代谢特性的研究 | 第41-57页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-44页 |
| 3.1.1 试剂与材料 | 第41-42页 |
| 3.1.1.1 化学试剂 | 第41页 |
| 3.1.1.2 实验材料 | 第41-42页 |
| 3.1.2 实验设计与实验方法 | 第42-44页 |
| 3.1.2.1 模拟储藏 | 第42页 |
| 3.1.2.2 样品前处理和MCF衍生化 | 第42页 |
| 3.1.2.3 GC-MS分析 | 第42-43页 |
| 3.1.2.4 色谱-质谱数据前处理 | 第43页 |
| 3.1.2.5 统计分析和模式识别 | 第43-44页 |
| 3.1.2.6 代谢通路分析 | 第44页 |
| 3.2 实验结果 | 第44-51页 |
| 3.2.1 GC-MS数据及其前处理 | 第44-46页 |
| 3.2.2 PCA | 第46-48页 |
| 3.2.3 PLS-DA | 第48-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-56页 |
| 3.3.1 能量代谢通路 | 第51-55页 |
| 3.3.1.1 非缺氧所致的有氧呼吸抑制和无氧呼吸加强 | 第52-53页 |
| 3.3.1.2 无氧呼吸通路的切换 | 第53页 |
| 3.3.1.3 糖原异生作用的加强 | 第53页 |
| 3.3.1.4 在保藏过程中氧气补充模块是次要条件 | 第53-55页 |
| 3.3.2 渗透调节系统 | 第55-56页 |
| 3.3.2.1 氧化损伤 | 第55页 |
| 3.3.2.2 其他生理影响 | 第55-56页 |
| 3.4 结论 | 第56-57页 |
| 第四章 典型水生脊椎动物麻醉运输血液生理特性的研究 | 第57-67页 |
| 4.1 材料与方法 | 第58-61页 |
| 4.1.1 试剂与材料 | 第58页 |
| 4.1.1.1 化学试剂 | 第58页 |
| 4.1.1.2 实验材料 | 第58页 |
| 4.1.2 实验设计和模拟运输 | 第58-59页 |
| 4.1.3 血浆中MS-222 的检测 | 第59页 |
| 4.1.3.1 样品前处理 | 第59页 |
| 4.1.3.2 色谱分离条件 | 第59页 |
| 4.1.4 血浆生化分析 | 第59-61页 |
| 4.1.4.1 ALB的检测 | 第60页 |
| 4.1.4.2 ALP的检测 | 第60页 |
| 4.1.4.3 AST的测定 | 第60页 |
| 4.1.4.4 总蛋白的测定 | 第60页 |
| 4.1.4.5 ALT的测定 | 第60-61页 |
| 4.1.4.6 CREA的测定 | 第61页 |
| 4.1.4.7 生化分析仪的参数设置 | 第61页 |
| 4.1.5 数据分析 | 第61页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第61-67页 |
| 4.2.1 血浆样品中MS-222 残留量的测定 | 第61-64页 |
| 4.2.2 血浆样品的生化分析 | 第64-65页 |
| 4.2.3 血浆生化分析对MS-222 麻醉运输后复苏时间不足的判断能力 | 第65-67页 |
| 第五章 基于非靶向代谢组学技术分析典型水生脊椎动物麻醉生理代谢特性的研究 | 第67-88页 |
| 5.1 材料与方法 | 第68-73页 |
| 5.1.1 试剂与材料 | 第68页 |
| 5.1.1.1 化学试剂 | 第68页 |
| 5.1.1.2 实验设计 | 第68页 |
| 5.1.2 化学分析 | 第68-70页 |
| 5.1.2.1 GC-MS分析 | 第68-69页 |
| 5.1.2.2 RP-MS和Hilic-MS分析 | 第69-70页 |
| 5.1.3 数据预处理 | 第70-71页 |
| 5.1.3.1 峰提取，保留时间矫正和归一化 | 第70页 |
| 5.1.3.2 PCA和质量控制检验 | 第70-71页 |
| 5.1.4 机器学习特征选择，训练，验证和可视化 | 第71-73页 |
| 5.1.4.1 基于随机森林的特征选择 | 第71页 |
| 5.1.4.2 基于分层聚类分析的特征选择结果可视化 | 第71页 |
| 5.1.4.3 SVM模型的训练 | 第71-72页 |
| 5.1.4.4 SVM模型的可视化 | 第72-73页 |
| 5.1.4.5 生物标记物的筛选 | 第73页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第73-86页 |
| 5.2.1 数据预处理 | 第73页 |
| 5.2.2 色-质谱数据的预处理 | 第73-76页 |
| 5.2.2.1 质量控制检验 | 第74-76页 |
| 5.2.3 基于RF的特征选择 | 第76-77页 |
| 5.2.4 SVM模型的训练优化，可视化和验证 | 第77-80页 |
| 5.2.4.1 SVM模型的训练优化 | 第77-78页 |
| 5.2.4.2 SVM模型的可视化 | 第78-80页 |
| 5.2.5 生物标记物筛选 | 第80-84页 |
| 5.2.6 通路分析 | 第84-86页 |
| 5.2.6.1 能量代谢和中心碳循环 | 第85页 |
| 5.2.6.2 酪氨酸和苯丙氨酸代谢影响 | 第85页 |
| 5.2.6.3 色氨酸代谢影响 | 第85-86页 |
| 5.2.6.4 脂质代谢影响 | 第86页 |
| 5.2.6.5 麻醉运输过程中的鳃损伤 | 第86页 |
| 5.3 结论 | 第86-88页 |
| 第六章 典型水生脊椎动物麻醉运输蛋白质组变化特性的研究 | 第88-97页 |
| 6.1 材料与方法 | 第88-91页 |
| 6.1.1 实验方法 | 第88-90页 |
| 6.1.1.1 蛋白质的制备 | 第88-89页 |
| 6.1.1.2 BCA蛋白质定量 | 第89页 |
| 6.1.1.3 蛋白质的FASP酶解 | 第89-90页 |
| 6.1.1.4 酶解产物的LCMS/MS分析 | 第90页 |
| 6.1.2 数据分析 | 第90-91页 |
| 6.1.2.1 原始质谱数据 | 第90页 |
| 6.1.2.2 数据库 | 第90页 |
| 6.1.2.3 Maxquant的非标记分析 | 第90-91页 |
| 6.2 结果与讨论 | 第91-97页 |
| 6.2.1 蛋白质样品的质控（SDS-PAGE） | 第91-92页 |
| 6.2.2 预实验蛋白质标准曲线及定量统计 | 第92-93页 |
| 6.2.3 蛋白质鉴定结果 | 第93-94页 |
| 6.2.3.1 肽段长度分布 | 第93-94页 |
| 6.2.4 蛋白质定量分析 | 第94-97页 |
| 6.2.4.1 显著性差异蛋白质 | 第94-95页 |
| 6.2.4.2 蛋白质通路分析 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-111页 |
| 附件 | 第111-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
