| 摘要 | 第4-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 引言 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 1.1 副溶血性弧菌生长及特性 | 第16-17页 |
| 1.2 副溶血性弧菌分布及流行状况 | 第17-18页 |
| 1.3 副溶血性弧菌毒力及相关因子 | 第18-24页 |
| 1.3.1 黏附素 | 第18-19页 |
| 1.3.2 溶血素 | 第19-20页 |
| 1.3.3 III型分泌系统 (T3SS) | 第20-24页 |
| 1.4 副溶血性弧菌受环境因子的影响 | 第24-26页 |
| 1.4.1 温度影响 | 第24-25页 |
| 1.4.2 酸影响 | 第25-26页 |
| 1.5 高通量测序技术在转录组学中的应用 | 第26-28页 |
| 1.5.1 测序技术简介 | 第26-27页 |
| 1.5.2 转录组学研究 | 第27页 |
| 1.5.3 病原菌转录组学研究现状 | 第27-28页 |
| 1.6 蛋白组学介绍 | 第28-31页 |
| 1.6.1 蛋白组学的发展 | 第28-29页 |
| 1.6.2 蛋白组学研究技术 | 第29-31页 |
| 1.6.3 蛋白组学应用 | 第31页 |
| 1.7 本论文研究目的及意义 | 第31-32页 |
| 第二章 副溶血性弧菌耐酸定向培养及特性 | 第32-51页 |
| 2.1 材料 | 第32-34页 |
| 2.1.1 菌株样品 | 第32页 |
| 2.1.2 细胞株 | 第32-33页 |
| 2.1.3 主要试剂及耗材 | 第33页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第33-34页 |
| 2.2 方法 | 第34-41页 |
| 2.2.1 耐酸菌株定向培养 | 第34-35页 |
| 2.2.2 生物学特性 | 第35-36页 |
| 2.2.3 成膜能力比较 | 第36页 |
| 2.2.4 能动性 | 第36-37页 |
| 2.2.5 耐药性 | 第37-38页 |
| 2.2.6 细胞毒性 | 第38-40页 |
| 2.2.7 数据统计学分析 | 第40-41页 |
| 2.3 结果 | 第41-48页 |
| 2.3.1 Challenge pH条件选择 | 第41页 |
| 2.3.2 耐酸菌株定向培养 | 第41-42页 |
| 2.3.3 生物学特性 | 第42-43页 |
| 2.3.4 成膜能力差异比较 | 第43-44页 |
| 2.3.5 能动性比较 | 第44-46页 |
| 2.3.6 耐药性变化 | 第46-47页 |
| 2.3.7 细胞毒性比较 | 第47-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-51页 |
| 第三章 耐酸菌株转录组表达谱分析 | 第51-77页 |
| 3.1 材料 | 第51-52页 |
| 3.1.1 菌株样品 | 第51页 |
| 3.1.2 主要试剂及耗材 | 第51页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第51-52页 |
| 3.2 方法 | 第52-55页 |
| 3.2.1 总RNA提取、质量检测及反转录 | 第52-53页 |
| 3.2.2 对照组与处理组RNA高通量测序 | 第53-54页 |
| 3.2.3 实时荧光定量PCR | 第54-55页 |
| 3.2.4 数据统计学分析 | 第55页 |
| 3.3 结果 | 第55-72页 |
| 3.3.1 总RNA质量检测 | 第55-56页 |
| 3.3.2 转录组数据组装结果及分析 | 第56-58页 |
| 3.3.3 基因表达水平分析 | 第58页 |
| 3.3.4 差异表达基因分析 | 第58-65页 |
| 3.3.4.1 差异表达基因分析 | 第58-60页 |
| 3.3.4.2 差异表达功能基因分类分析 | 第60-65页 |
| 3.3.5 GO功能分类及KEGG谢通路分析 | 第65-67页 |
| 3.3.6 内参评价及筛选 | 第67-71页 |
| 3.3.7 转录组学结果验证 | 第71-72页 |
| 3.4 讨论 | 第72-77页 |
| 第四章 耐酸菌株蛋白组学表达谱分析 | 第77-91页 |
| 4.1 材料 | 第77-78页 |
| 4.1.1 菌株样品 | 第77页 |
| 4.1.2 主要药品试剂 | 第77页 |
| 4.1.3 主要设备 | 第77-78页 |
| 4.2 方法 | 第78-80页 |
| 4.2.1 总蛋白提取、定量分析及检测 | 第78-79页 |
| 4.2.2 蛋白组测序分析 | 第79-80页 |
| 4.2.3 数据处理及统计学分析 | 第80页 |
| 4.3 结果 | 第80-88页 |
| 4.3.1 总蛋白质量定量和质控 | 第80-81页 |
| 4.3.2 差异蛋白鉴定 | 第81-83页 |
| 4.3.3 差异蛋白分析及功能富集 | 第83-85页 |
| 4.3.4 联合比较转录组数据，蛋白组差异表达数据 | 第85-88页 |
| 4.4 讨论 | 第88-91页 |
| 论文小结 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-100页 |
| 博士在读期间发表及投稿论文 | 第100-101页 |
| 致谢 | 第101页 |