基因芯片设计技术研究
摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第7-12页 |
·问题提出 | 第7-9页 |
·国内外研究现状 | 第9-10页 |
·论文的主要内容及贡献 | 第10-11页 |
·论文的结构 | 第11-12页 |
第二章 生物学基础 | 第12-21页 |
·引言 | 第12页 |
·核酸的分子组成 | 第12-14页 |
·核酸的分子结构 | 第14-17页 |
·DNA的分子结构 | 第14-17页 |
·RNA的分子结构 | 第17页 |
·核酸的变性、复性和分子杂交 | 第17-19页 |
·核酸的变性与复性 | 第17-18页 |
·核酸的分子杂交 | 第18-19页 |
·基因表达 | 第19页 |
·小结 | 第19-21页 |
第三章 基因芯片探针选择 | 第21-43页 |
·引言 | 第21页 |
·探针选择问题描述 | 第21-23页 |
·探针选择算法总体流程 | 第23-24页 |
·Suffix Array数据结构 | 第24-25页 |
·探针约束 | 第25-26页 |
·Markov概率准则 | 第26-31页 |
·理论描述 | 第26-27页 |
·具体实现 | 第27-28页 |
·准则评价 | 第28-31页 |
·解链温度计算 | 第31-37页 |
·DNA解链温度模型 | 第31-32页 |
·探针与基因的解链温度 | 第32-33页 |
·序列比对 | 第33-34页 |
·最大解链温度的计算 | 第34-36页 |
·温度比对算法有效性分析 | 第36-37页 |
·匹配温度和误配温度计算 | 第37-40页 |
·实验温度确定与探针选择 | 第40-41页 |
·结果分析 | 第41-42页 |
·小结 | 第42-43页 |
第四章 基于预测搜索的基因芯片优化方法 | 第43-50页 |
·引言 | 第43-45页 |
·芯片优化问题描述 | 第45-46页 |
·预测搜索方法 | 第46-47页 |
·结果分析 | 第47-49页 |
·小结 | 第49-50页 |
第五章 总结和展望 | 第50-52页 |
·全文总结 | 第50页 |
·研究展望 | 第50-52页 |
附录 DNA的NN模型参数 | 第52-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-60页 |