| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1.1 新疆地区传统发酵乳制品概述 | 第10-11页 |
| 1.1.1 新疆地区传统发酵乳制品及其种类 | 第10页 |
| 1.1.2 新疆地区传统发酵乳制品中的微生物 | 第10-11页 |
| 1.2 肠球菌概述 | 第11-14页 |
| 1.2.1 肠球菌属的命名及分类 | 第11-12页 |
| 1.2.2 肠球菌的基本特征及分布 | 第12-14页 |
| 1.2.3 肠球菌在食品中的益生性与安全性 | 第14页 |
| 1.3 肠球菌基因分型方法 | 第14-18页 |
| 1.3.1 随机扩增多态性DNA(Randomly amplified polymorphic DNA, RAPD) | 第14-15页 |
| 1.3.2 扩增片段长度多态性分析(Amplified Fragment Length Polymorphism, AFLP) | 第15页 |
| 1.3.3 短重复序列PCR(rep-PCR) | 第15-16页 |
| 1.3.4 单重PCR及多重PCR | 第16-17页 |
| 1.3.5 多位点序列分析(MLSA) | 第17-18页 |
| 1.4 肠球菌的耐药性研究 | 第18-19页 |
| 1.5 本研究的目的和意义及主要研究内容 | 第19-21页 |
| 1.5.1 研究目的 | 第19页 |
| 1.5.2 研究意义 | 第19-20页 |
| 1.5.3 主要研究内容 | 第20-21页 |
| 1.6 本课题的研究路线 | 第21-22页 |
| 第二章 新疆北疆地区发酵乳制品中肠球菌的分离鉴定及系统发育分析 | 第22-38页 |
| 2.1 前言 | 第22页 |
| 2.2 试验材料 | 第22-23页 |
| 2.2.1 主要试剂和仪器 | 第22页 |
| 2.2.2 样品采集与处理 | 第22-23页 |
| 2.2.3 菌株分离培养基 | 第23页 |
| 2.3 实验方法 | 第23-26页 |
| 2.3.1 新疆北疆地区发酵乳制品中肠球菌的分离与纯化 | 第23页 |
| 2.3.2 分离菌株DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.3.3 肠球菌种属特异引物鉴定 | 第24-25页 |
| 2.3.4 rep-PCR扩增 | 第25-26页 |
| 2.3.5 菌株的 16SrRNA基因扩增 | 第26页 |
| 2.3.6 16SrRNA基因测序及数据处理 | 第26页 |
| 2.4 结果与分析 | 第26-36页 |
| 2.4.1 新疆北疆地区发酵乳制品中肠球菌分离结果 | 第26-29页 |
| 2.4.2 新疆北疆地区不同地区发酵乳制品中肠球菌种群分布 | 第29-30页 |
| 2.4.3 新疆北疆地区不同样本类型发酵乳制品中肠球菌种群分布 | 第30-31页 |
| 2.4.4 rep-PCR结果分析 | 第31-34页 |
| 2.4.5 16SrRNA基因的扩增结果 | 第34页 |
| 2.4.6 16SrRNA基因的系统发育分析 | 第34-36页 |
| 2.5 讨论 | 第36页 |
| 2.6 本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基于rpoA和pheS分析新疆北疆地区发酵乳制品中肠球菌的种群遗传差异 | 第38-45页 |
| 3.1 引言 | 第38页 |
| 3.2 实验材料 | 第38页 |
| 3.2.1 菌株来源 | 第38页 |
| 3.2.2 主要试剂和仪器 | 第38页 |
| 3.3 实验方法 | 第38-39页 |
| 3.3.1 肠球菌的rpoA和pheS基因扩增 | 第38-39页 |
| 3.3.2 测序及数据处理 | 第39页 |
| 3.4 结果与分析 | 第39-44页 |
| 3.4.1 PCR扩增结果 | 第39-40页 |
| 3.4.2 测序结果及系统发育树分析 | 第40-44页 |
| 3.5 讨论 | 第44页 |
| 3.6 本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 新疆北疆地区发酵乳制品中肠球菌的万古霉素抗性研究 | 第45-50页 |
| 4.1 引言 | 第45页 |
| 4.2 实验材料 | 第45-46页 |
| 4.2.1 菌株来源 | 第45页 |
| 4.2.2 主要试剂和仪器 | 第45-46页 |
| 4.3 实验方法 | 第46页 |
| 4.3.1 万古霉素抗性基因扩增 | 第46页 |
| 4.3.2 万古霉素抗性基因扩增结果检测 | 第46页 |
| 4.4 结果与分析 | 第46-48页 |
| 4.4.1 万古霉素抗性基因扩增结果 | 第46-47页 |
| 4.4.2 万古霉素抗性菌株遗传差异分析 | 第47-48页 |
| 4.5 讨论 | 第48-49页 |
| 4.6 本章小结 | 第49-50页 |
| 第五章 结论与展望 | 第50-52页 |
| 5.1 结论 | 第50页 |
| 5.2 展望 | 第50-51页 |
| 5.3 本研究创新点 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 作者简介 | 第61-62页 |
| 石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表 | 第62页 |
