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基于转录组学的Streptococcus thermophilus TF96中心碳代谢机制的研究

摘要第8-10页
英文摘要第10-12页
1 前言第13-26页
    1.1 立题背景第13-14页
    1.2 嗜热链球菌概述第14-15页
    1.3 乳酸菌中心碳代谢第15-18页
        1.3.1 糖转运和代谢第15-17页
        1.3.2 同型乳酸发酵和混合酸发酵第17-18页
    1.4 乳酸菌细胞壁生物合成和降解第18-19页
        1.4.1 乳酸菌细胞壁结构第18-19页
        1.4.2 乳酸菌细胞壁的降解第19页
    1.5 转录组学研究第19-23页
        1.5.1 转录组学研究方法第20-23页
    1.6 国内外研究动态第23-24页
    1.7 研究的目的及意义第24-25页
    1.8 试验技术路线第25-26页
2 材料与方法第26-33页
    2.1 试验材料第26-29页
        2.1.1 供试菌株第26页
        2.1.2 培养基第26-27页
        2.1.3 仪器与设备第27-28页
        2.1.4 主要试剂第28-29页
    2.2 试验方法第29-33页
        2.2.1 菌株的活化第29-30页
        2.2.2 嗜热链球菌TF96生长曲线的建立以及取样点的确定第30页
        2.2.3 嗜热链球菌TF96的发酵试验第30页
        2.2.4 样品总RNA的提取及纯化第30-31页
        2.2.5 cDNA文库的构建、转录组测序和数据分析第31页
        2.2.6 嗜热链球菌TF96胞内和胞外碳水化合物浓度的测定第31-32页
        2.2.7 数据处理和分析第32-33页
3 结果与分析第33-59页
    3.1 嗜热链球菌TF96的生长曲线与取样点的确定第33-34页
    3.2 总RNA纯度和完整性检测第34-35页
    3.3 RNA-Seq测序产量及质量第35-36页
    3.4 Unigene功能注释第36-38页
    3.5 嗜热链球菌TF96碳水化合物代谢差异表达基因趋势分析第38-41页
    3.6 嗜热链球菌TF96碳水化合物转运系统差异表达基因分析第41-43页
    3.7 嗜热链球菌TF96碳水化合物代谢特定途径差异表达基因分析第43-52页
        3.7.1 嗜热链球菌TF96半乳糖代谢途径差异表达基因分析第44-45页
        3.7.2 嗜热链球菌TF96糖酵解途径差异表达基因分析第45-47页
        3.7.3 嗜热链球菌TF96丙酮酸代谢和TCA途径差异表达基因分析第47-52页
    3.8 嗜热链球菌TF96细胞壁和细胞膜生物合成差异表达基因分析第52-56页
    3.9 LC-MS/MS测定嗜热链球菌TF96不同时间点碳水化合物代谢第56-59页
        3.9.1 嗜热链球菌TF96生长过程中胞外碳水化合物丰度变化第56-57页
        3.9.2 嗜热链球菌TF96不同生长阶段胞内碳水化合物丰度变化第57-59页
4 讨论第59-64页
    4.1 嗜热链球菌TF96批次发酵过程中中心碳代谢调控机制第59-61页
    4.2 嗜热链球菌培养过程中细胞壁/膜生物合成相关途径分析第61页
    4.3 嗜热链球菌TF96发酵过程中胞内和胞外碳水化合物丰度变化第61-64页
5 结论第64-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-74页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第74页

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