摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第一章 绪论 | 第11-31页 |
1.1 CITRIN缺乏症 | 第11-17页 |
1.1.1 Citrin缺乏症的发病机制 | 第11-12页 |
1.1.2 Citrin缺乏症的临床特征 | 第12-15页 |
1.1.3 Citrin缺乏症临床诊疗策略 | 第15页 |
1.1.4 Citrin缺乏症诊断流程及确诊 | 第15-17页 |
1.2 高通量SOLEXA测序技术 | 第17-25页 |
1.2.1 文库制备 | 第18-19页 |
1.2.2 DNA簇的生成 | 第19-22页 |
1.2.3 上机测序 | 第22-25页 |
1.3 目标区域重测序和NIMBLEGEN目标序列捕获技术 | 第25-27页 |
1.4 生物信息学的发展对高通量测序的促进 | 第27-28页 |
1.5 二代高通量测序技术在临床医学中的应用前景 | 第28-30页 |
1.6 本课题研究的目的意义与内容 | 第30-31页 |
第二章 利用序列捕获和高通量测序构建SLC25A13基因突变检测平台 | 第31-59页 |
2.1 材料与方法 | 第32-33页 |
2.1.1 研究对象及其样本来源 | 第32-33页 |
2.1.2 主要实验仪器与试剂 | 第33页 |
2.2 实验步骤 | 第33-59页 |
2.2.1 标本采集 | 第33页 |
2.2.2 外周血基因组DNA提取及检测 | 第33-34页 |
2.2.3 人基因组g DNA溶液的质量检测与浓度测定 | 第34-35页 |
2.2.4 高通量测序的人基因组g DNA建库 | 第35-40页 |
2.2.5 芯片捕获目的DNA片段 | 第40-51页 |
2.2.6 上机前捕获文库扩增前准备 | 第51页 |
2.2.7 上机测序 | 第51-53页 |
2.2.8 数据处理 | 第53-54页 |
2.2.9 SNP的致病性预测分析 | 第54-59页 |
第三章 结果与讨论 | 第59-75页 |
3.1 通过YH炎黄标准DNA样本确定信息分析过滤参数 | 第59-60页 |
3.2 建立SLC25A13基因和ASS基因的正常中国人变异数据库 | 第60-62页 |
3.3 两例CITRIN缺乏症患者的SLC25A13基因突变分析与新突变类型的发现 | 第62-68页 |
3.4 SANGER方法的验证结果 | 第68-70页 |
3.5 突变对蛋白质功能或结构影响的分析预测 | 第70-73页 |
3.6 讨论 | 第73-75页 |
第四章 结论 | 第75-76页 |
参考文献 | 第76-85页 |
攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第85-86页 |
致谢 | 第86-87页 |
附件 | 第87页 |