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序列捕获高通量测序技术建立citrin缺乏症基因检测平台及其应用

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 绪论第11-31页
    1.1 CITRIN缺乏症第11-17页
        1.1.1 Citrin缺乏症的发病机制第11-12页
        1.1.2 Citrin缺乏症的临床特征第12-15页
        1.1.3 Citrin缺乏症临床诊疗策略第15页
        1.1.4 Citrin缺乏症诊断流程及确诊第15-17页
    1.2 高通量SOLEXA测序技术第17-25页
        1.2.1 文库制备第18-19页
        1.2.2 DNA簇的生成第19-22页
        1.2.3 上机测序第22-25页
    1.3 目标区域重测序和NIMBLEGEN目标序列捕获技术第25-27页
    1.4 生物信息学的发展对高通量测序的促进第27-28页
    1.5 二代高通量测序技术在临床医学中的应用前景第28-30页
    1.6 本课题研究的目的意义与内容第30-31页
第二章 利用序列捕获和高通量测序构建SLC25A13基因突变检测平台第31-59页
    2.1 材料与方法第32-33页
        2.1.1 研究对象及其样本来源第32-33页
        2.1.2 主要实验仪器与试剂第33页
    2.2 实验步骤第33-59页
        2.2.1 标本采集第33页
        2.2.2 外周血基因组DNA提取及检测第33-34页
        2.2.3 人基因组g DNA溶液的质量检测与浓度测定第34-35页
        2.2.4 高通量测序的人基因组g DNA建库第35-40页
        2.2.5 芯片捕获目的DNA片段第40-51页
        2.2.6 上机前捕获文库扩增前准备第51页
        2.2.7 上机测序第51-53页
        2.2.8 数据处理第53-54页
        2.2.9 SNP的致病性预测分析第54-59页
第三章 结果与讨论第59-75页
    3.1 通过YH炎黄标准DNA样本确定信息分析过滤参数第59-60页
    3.2 建立SLC25A13基因和ASS基因的正常中国人变异数据库第60-62页
    3.3 两例CITRIN缺乏症患者的SLC25A13基因突变分析与新突变类型的发现第62-68页
    3.4 SANGER方法的验证结果第68-70页
    3.5 突变对蛋白质功能或结构影响的分析预测第70-73页
    3.6 讨论第73-75页
第四章 结论第75-76页
参考文献第76-85页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第85-86页
致谢第86-87页
附件第87页

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