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东北传统发酵特色食品中主要微生物多样性研究

目录第1-7页
CONTENTS第7-11页
摘要第11-14页
Abstract第14-17页
前言第17-27页
第一章 东北传统发酵酸菜发酵液采集及其中乳酸菌的分离鉴定第27-37页
   ·试验材料第27-29页
     ·东北传统发酵酸菜发酵液样品第27页
     ·主要器材第27页
     ·主要试剂第27-28页
     ·培养基及染液第28-29页
   ·试验方法第29-30页
     ·样品采集第29页
     ·样品中乳酸菌的分离纯化第29页
     ·乳酸菌疑似菌株的保藏第29页
     ·利用16S rDNA序列分析进行鉴定第29-30页
   ·结果与分析第30-36页
     ·样品采集情况第30-34页
     ·菌株分离结果第34页
     ·16S rDNA序列分析第34-36页
   ·小结第36-37页
第二章 东北传统发酵大酱样品采集及其中乳酸菌的分离鉴定第37-48页
   ·试验材料第37-39页
     ·东北传统发酵大酱样品第37页
     ·主要器材第37-38页
     ·主要试剂第38页
     ·培养基及染液第38-39页
   ·试验方法第39-41页
     ·大酱样品的采集第39页
     ·大酱样品中乳酸菌总数的测定第39页
     ·大酱样品中乳酸菌的分离纯化第39-40页
     ·乳酸菌疑似菌株的保藏第40页
     ·利用16S rDNA序列分析进行鉴定第40-41页
   ·结果与分析第41-47页
     ·样品采集情况第41-42页
     ·大酱样品中乳酸菌总数测定第42-43页
     ·乳酸菌的分离纯化第43页
     ·乳酸菌疑似菌株总DNA提取及PCR扩增第43-44页
     ·乳酸菌16S rDNA序列分析及属种鉴定第44-46页
     ·乳酸菌系统发育树的构建第46-47页
   ·小结第47-48页
第三章 东北传统发酵大酱样品采集及其中酵母菌的分离鉴定第48-60页
   ·试验材料第48-50页
     ·东北传统发酵大酱样品第48页
     ·主要器材第48-49页
     ·主要试剂第49页
     ·培养基及染液第49-50页
   ·试验方法第50-52页
     ·大酱样品的采集第50页
     ·大酱样品中酵母菌总数的测定第50页
     ·大酱样品中酵母菌疑似菌株的分离纯化第50-51页
     ·酵母菌疑似菌株的26S rDNA D1/D2区序列分析第51-52页
   ·结果与分析第52-59页
     ·样品采集情况第52页
     ·大酱样品中酵母菌总数测定第52-53页
     ·酵母菌的分离纯化第53页
     ·酵母菌疑似菌株总DNA提取及PCR扩增第53-54页
     ·乳酸菌16S rDNA序列分析及属种鉴定第54-58页
     ·乳酸菌系统发育树的构建第58-59页
   ·小结第59-60页
第四章 利用PCR-DGGE技术分析传统发酵酸菜发酵液中乳酸菌的多样性第60-68页
   ·试验材料第60-61页
     ·试验材料第60页
     ·主要器材第60-61页
     ·主要试剂第61页
   ·试验方法第61-64页
     ·样品预处理第61页
     ·样品总DNA的快速提取第61-62页
     ·样品16S rDNA的PCR扩增第62页
     ·DGGE指纹图谱构建第62-63页
     ·染色第63页
     ·图谱分析、序列测定及同源性分析第63-64页
   ·结果与分析第64-67页
     ·总DNA提取结果第64页
     ·16S rDNA V3区的扩增结果第64-65页
     ·DGGE图谱构建与分析第65-67页
   ·小结第67-68页
第五章 利用PCR-DGGE技术分析东北传统发酵大酱中的乳酸菌多样性第68-76页
   ·试验材料第68-69页
     ·试验材料第68页
     ·主要器材第68页
     ·主要试剂第68-69页
   ·试验方法第69-72页
     ·样品预处理第69页
     ·样品总DNA的快速提取第69页
     ·PCR扩增第69-70页
     ·DGGE第70-71页
     ·染色第71页
     ·图谱分析、序列测定及同源性分析第71-72页
   ·结果与分析第72-75页
     ·总DNA提取结果第72页
     ·16S rDNA V3区的扩增结果第72-73页
     ·DGGE图谱构建与分析第73-75页
   ·小结第75-76页
第六章 利用新一代测序技术分析酸菜发酵液中的微生物多样性第76-90页
   ·试验材料第76页
     ·试验材料第76页
     ·主要器材第76页
     ·主要试剂第76页
   ·试验方法第76-79页
     ·样品微生物宏基因组提取第76-77页
     ·PCR扩增程序的标准化第77-78页
     ·正式PCR扩增及产物纯化第78页
     ·焦磷酸测序第78-79页
     ·生物信息学分析第79页
   ·结果与分析第79-89页
     ·样品微生物宏基因组提取第79页
     ·PCR扩增程序的标准化第79-80页
     ·正式PCR扩增及产物纯化第80-81页
     ·焦磷酸测序结果分析第81-89页
   ·小结第89-90页
第七章 利用新一代测序技术分析大酱中的乳酸菌多样性第90-105页
   ·试验材料第90页
     ·试验材料第90页
     ·主要器材第90页
     ·主要试剂第90页
   ·试验方法第90-93页
     ·样品微生物宏基因组提取第90-91页
     ·PCR扩增程序的标准化第91-92页
     ·正式PCR扩增及产物纯化第92页
     ·焦磷酸测序第92-93页
     ·生物信息学分析第93页
   ·结果与分析第93-103页
     ·样品微生物宏基因组提取第93-94页
     ·PCR扩增程序的标准化第94-95页
     ·正式PCR扩增及产物纯化第95页
     ·焦磷酸测序结果分析第95-103页
   ·小结第103-105页
全文讨论第105-110页
结论第110-114页
参考文献第114-121页
致谢第121-122页
攻读学位期间发表论文目录第122-124页
附录第124-127页

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