摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-12页 |
引言 | 第12-16页 |
1 研究背景 | 第12-15页 |
2 研究目的及意义 | 第15-16页 |
第一章 ERIC-PCR 和基因芯片技术概述 | 第16-24页 |
·ERIC-PCR 概述 | 第16-18页 |
·ERIC-PCR 的基本原理 | 第16-17页 |
·ERIC-PCR 的技术特点 | 第17页 |
·ERIC-PCR 技术在致病菌基因分型研究中的应用 | 第17-18页 |
·基因芯片技术概述 | 第18-22页 |
·基因芯片的基本原理 | 第18页 |
·基因芯片的主要类型 | 第18-19页 |
·基因芯片的主要特点 | 第19-20页 |
·基因芯片技术的流程 | 第20-21页 |
·基因芯片在食源性致病菌检测中的应用 | 第21-22页 |
·展望 | 第22-24页 |
第二章 副溶血性弧菌ERIC-PCR 分型方法的建立及毒力基因的检测 | 第24-35页 |
·实验材料 | 第24-25页 |
·菌株及来源 | 第24页 |
·主要培养基和试剂 | 第24页 |
·试剂盒 | 第24-25页 |
·引物 | 第25页 |
·PCR 反应试剂 | 第25页 |
·琼脂糖凝胶电泳用试剂 | 第25页 |
·主要仪器 | 第25页 |
·方法 | 第25-29页 |
·DNA 模板的制备 | 第25-26页 |
·ERIC-PCR 及毒力基因的引物 | 第26-27页 |
·ERIC-PCR 及毒力基因检测方法的建立 | 第27-28页 |
·ERIC-PCR 重复性实验 | 第28页 |
·ERIC-PCR 反应产物分析 | 第28-29页 |
·副溶血性弧菌ERIC-PCR 指纹图谱分析 | 第29页 |
·结果 | 第29-32页 |
·ERIC-PCR 的重复性 | 第29页 |
·副溶血性弧菌ERIC-PCR 扩增结果 | 第29-30页 |
·副溶血性弧菌ERIC-PCR 指纹图谱的分析 | 第30-31页 |
·tdh 和trh 基因检测结果 | 第31-32页 |
·讨论 | 第32-35页 |
·副溶血性弧菌基因分型的重要性 | 第32-33页 |
·基因分型方法的选择 | 第33-35页 |
第三章 副溶血性弧菌多重PCR 检测方法的建立 | 第35-46页 |
·实验材料 | 第35-36页 |
·菌株 | 第35页 |
·主要培养基 | 第35页 |
·试剂盒 | 第35页 |
·引物 | 第35-36页 |
·PCR 反应试剂 | 第36页 |
·琼脂糖凝胶电泳用试剂 | 第36页 |
·主要仪器 | 第36页 |
·方法 | 第36-38页 |
·菌株的培养 | 第36页 |
·DNA 模板的制备 | 第36页 |
·多重PCR 引物的设计 | 第36-37页 |
·多重PCR 方法的建立 | 第37页 |
·多重PCR 体系优化 | 第37-38页 |
·多重PCR 引物特异性分析 | 第38页 |
·多重PCR 灵敏度试验 | 第38页 |
·结果 | 第38-43页 |
·多重PCR 体系优化 | 第38-41页 |
·多重PCR 引物特异性分析 | 第41页 |
·多重PCR 灵敏度试验 | 第41-42页 |
·多重PCR 对大肠杆菌0157 和单核增生李斯特菌的检测 | 第42-43页 |
·讨论 | 第43-46页 |
·多重PCR 的优劣 | 第43-44页 |
·多重PCR 的优化 | 第44页 |
·多重PCR 特异性与灵敏度评价 | 第44-46页 |
第四章 副溶血性弧菌基因芯片检测方法的建立 | 第46-56页 |
·实验材料 | 第46-48页 |
·菌株 | 第46页 |
·主要培养基 | 第46页 |
·试剂盒 | 第46页 |
·芯片引物与探针 | 第46页 |
·PCR 反应试剂 | 第46页 |
·PCR 产物纯化试剂 | 第46页 |
·芯片杂交用试剂 | 第46-47页 |
·仪器设备 | 第47页 |
·醛基化修饰表面片基 | 第47-48页 |
·方法 | 第48-52页 |
·菌株的培养及模板DNA 的制备 | 第48页 |
·V.p 特异性基因的探针引物设计 | 第48-49页 |
·PCR 的反应体系 | 第49-50页 |
·PCR 产物纯化 | 第50页 |
·点制芯片 | 第50-51页 |
·芯片杂交和洗片 | 第51-52页 |
·芯片扫描和数据分析 | 第52页 |
·芯片检测特异性 | 第52页 |
·芯片检测灵敏度 | 第52页 |
·食品中致病微生物的检测 | 第52页 |
·结果 | 第52-54页 |
·基于多重PCR 的芯片检测 | 第52-53页 |
·芯片检测灵敏度试验 | 第53-54页 |
·模拟样品中致病微生物的检测 | 第54页 |
·食品中致病微生物的检测 | 第54页 |
·讨论 | 第54-56页 |
·探针的设计及特异性评价 | 第54-55页 |
·芯片检测的灵敏度评价 | 第55-56页 |
第五章 常见致病性弧菌基因芯片鉴定方法的建立 | 第56-63页 |
·实验材料 | 第56页 |
·菌株 | 第56页 |
·主要培养基 | 第56页 |
·试剂盒 | 第56页 |
·芯片引物与探针 | 第56页 |
·PCR 反应试剂 | 第56页 |
·PCR 产物纯化试剂 | 第56页 |
·芯片杂交用试剂 | 第56页 |
·仪器设备 | 第56页 |
·醛基化修饰表面片基 | 第56页 |
·方法 | 第56-59页 |
·菌株的培养及模板DNA 的制备 | 第56-57页 |
·PCR 的反应体系 | 第57页 |
·常见致病性弧菌165 rDNA 基因的引物和探针引物设计 | 第57-58页 |
·PCR 产物纯化 | 第58页 |
·点制芯片 | 第58页 |
·芯片杂交和洗片 | 第58页 |
·芯片扫描和数据分析 | 第58-59页 |
·芯片检测特异性 | 第59页 |
·芯片检测灵敏度 | 第59页 |
·食品中致病微生物的检测 | 第59页 |
·结果 | 第59-61页 |
·基于弧菌165 rDNA 基因的芯片检测 | 第59-60页 |
·芯片检测灵敏度试验 | 第60-61页 |
·模拟样品中致病微生物的检测 | 第61页 |
·食品中致病微生物的检测 | 第61页 |
·讨论 | 第61-63页 |
·探针的设计与特异性评价 | 第61页 |
·Vibrio spp.鉴定芯片的灵敏度评价 | 第61页 |
·Vibrio spp.鉴定芯片的不足与改进 | 第61-63页 |
全文总结 | 第63-65页 |
本论文创新点 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-73页 |
攻读硕士学位期间发表的文章 | 第73-74页 |
致谢 | 第74页 |