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常见致病性弧菌的基因分型和基因芯片检测技术研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
引言第12-16页
 1 研究背景第12-15页
 2 研究目的及意义第15-16页
第一章 ERIC-PCR 和基因芯片技术概述第16-24页
   ·ERIC-PCR 概述第16-18页
     ·ERIC-PCR 的基本原理第16-17页
     ·ERIC-PCR 的技术特点第17页
     ·ERIC-PCR 技术在致病菌基因分型研究中的应用第17-18页
   ·基因芯片技术概述第18-22页
     ·基因芯片的基本原理第18页
     ·基因芯片的主要类型第18-19页
     ·基因芯片的主要特点第19-20页
     ·基因芯片技术的流程第20-21页
     ·基因芯片在食源性致病菌检测中的应用第21-22页
   ·展望第22-24页
第二章 副溶血性弧菌ERIC-PCR 分型方法的建立及毒力基因的检测第24-35页
   ·实验材料第24-25页
     ·菌株及来源第24页
     ·主要培养基和试剂第24页
     ·试剂盒第24-25页
     ·引物第25页
     ·PCR 反应试剂第25页
     ·琼脂糖凝胶电泳用试剂第25页
     ·主要仪器第25页
   ·方法第25-29页
     ·DNA 模板的制备第25-26页
     ·ERIC-PCR 及毒力基因的引物第26-27页
     ·ERIC-PCR 及毒力基因检测方法的建立第27-28页
     ·ERIC-PCR 重复性实验第28页
     ·ERIC-PCR 反应产物分析第28-29页
     ·副溶血性弧菌ERIC-PCR 指纹图谱分析第29页
   ·结果第29-32页
     ·ERIC-PCR 的重复性第29页
     ·副溶血性弧菌ERIC-PCR 扩增结果第29-30页
     ·副溶血性弧菌ERIC-PCR 指纹图谱的分析第30-31页
     ·tdh 和trh 基因检测结果第31-32页
   ·讨论第32-35页
     ·副溶血性弧菌基因分型的重要性第32-33页
     ·基因分型方法的选择第33-35页
第三章 副溶血性弧菌多重PCR 检测方法的建立第35-46页
   ·实验材料第35-36页
     ·菌株第35页
     ·主要培养基第35页
     ·试剂盒第35页
     ·引物第35-36页
     ·PCR 反应试剂第36页
     ·琼脂糖凝胶电泳用试剂第36页
     ·主要仪器第36页
   ·方法第36-38页
     ·菌株的培养第36页
     ·DNA 模板的制备第36页
     ·多重PCR 引物的设计第36-37页
     ·多重PCR 方法的建立第37页
     ·多重PCR 体系优化第37-38页
     ·多重PCR 引物特异性分析第38页
     ·多重PCR 灵敏度试验第38页
   ·结果第38-43页
     ·多重PCR 体系优化第38-41页
     ·多重PCR 引物特异性分析第41页
     ·多重PCR 灵敏度试验第41-42页
     ·多重PCR 对大肠杆菌0157 和单核增生李斯特菌的检测第42-43页
   ·讨论第43-46页
     ·多重PCR 的优劣第43-44页
     ·多重PCR 的优化第44页
     ·多重PCR 特异性与灵敏度评价第44-46页
第四章 副溶血性弧菌基因芯片检测方法的建立第46-56页
   ·实验材料第46-48页
     ·菌株第46页
     ·主要培养基第46页
     ·试剂盒第46页
     ·芯片引物与探针第46页
     ·PCR 反应试剂第46页
     ·PCR 产物纯化试剂第46页
     ·芯片杂交用试剂第46-47页
     ·仪器设备第47页
     ·醛基化修饰表面片基第47-48页
   ·方法第48-52页
     ·菌株的培养及模板DNA 的制备第48页
     ·V.p 特异性基因的探针引物设计第48-49页
     ·PCR 的反应体系第49-50页
     ·PCR 产物纯化第50页
     ·点制芯片第50-51页
     ·芯片杂交和洗片第51-52页
     ·芯片扫描和数据分析第52页
     ·芯片检测特异性第52页
     ·芯片检测灵敏度第52页
     ·食品中致病微生物的检测第52页
   ·结果第52-54页
     ·基于多重PCR 的芯片检测第52-53页
     ·芯片检测灵敏度试验第53-54页
     ·模拟样品中致病微生物的检测第54页
     ·食品中致病微生物的检测第54页
   ·讨论第54-56页
     ·探针的设计及特异性评价第54-55页
     ·芯片检测的灵敏度评价第55-56页
第五章 常见致病性弧菌基因芯片鉴定方法的建立第56-63页
   ·实验材料第56页
     ·菌株第56页
     ·主要培养基第56页
     ·试剂盒第56页
     ·芯片引物与探针第56页
     ·PCR 反应试剂第56页
     ·PCR 产物纯化试剂第56页
     ·芯片杂交用试剂第56页
     ·仪器设备第56页
     ·醛基化修饰表面片基第56页
   ·方法第56-59页
     ·菌株的培养及模板DNA 的制备第56-57页
     ·PCR 的反应体系第57页
     ·常见致病性弧菌165 rDNA 基因的引物和探针引物设计第57-58页
     ·PCR 产物纯化第58页
     ·点制芯片第58页
     ·芯片杂交和洗片第58页
     ·芯片扫描和数据分析第58-59页
     ·芯片检测特异性第59页
     ·芯片检测灵敏度第59页
     ·食品中致病微生物的检测第59页
   ·结果第59-61页
     ·基于弧菌165 rDNA 基因的芯片检测第59-60页
     ·芯片检测灵敏度试验第60-61页
     ·模拟样品中致病微生物的检测第61页
     ·食品中致病微生物的检测第61页
   ·讨论第61-63页
     ·探针的设计与特异性评价第61页
     ·Vibrio spp.鉴定芯片的灵敏度评价第61页
     ·Vibrio spp.鉴定芯片的不足与改进第61-63页
全文总结第63-65页
本论文创新点第65-66页
参考文献第66-73页
攻读硕士学位期间发表的文章第73-74页
致谢第74页

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