基因芯片检测转基因植物方法学的建立
| 全文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-8页 |
| 第一部分 综述 | 第8-39页 |
| 第一章 转基因植物检测现状及其发展 | 第8-25页 |
| 第二章 基因芯片技术及其应用 | 第25-39页 |
| 第二部分 实验 | 第39-80页 |
| 第一章 芯片引物延伸法检测转基因水稻方法建立 | 第39-57页 |
| 前言 | 第39-40页 |
| 1. 材料 | 第40-42页 |
| ·芯片基片 | 第40页 |
| ·样品 | 第40-41页 |
| ·试剂 | 第41页 |
| ·芯片制备所用试剂 | 第41页 |
| ·样品制备所用试剂 | 第41页 |
| ·芯片引物延伸体系所用试剂 | 第41页 |
| ·芯片的洗脱及显色所用试剂 | 第41页 |
| ·仪器和设备 | 第41页 |
| ·计算机分析软件 | 第41-42页 |
| 2. 方法原理 | 第42页 |
| 3. 样品提取 | 第42-43页 |
| 4. 芯片制备 | 第43-46页 |
| ·引物(探针)设计 | 第43-45页 |
| ·探针合成 | 第45页 |
| ·点样与固定 | 第45-46页 |
| 5. 探针浓度梯度试验 | 第46-47页 |
| 6. 设计引物的特异性验证试验 | 第47-48页 |
| 7. 探针结合的稳定性实验 | 第48-49页 |
| 8. 芯片上的引物延伸反应 | 第49-54页 |
| ·方法 | 第49-50页 |
| ·引物延伸体系 | 第49页 |
| ·芯片的洗脱及显色 | 第49-50页 |
| ·两条探针的芯片引物延伸实验 | 第50-51页 |
| ·芯片制作 | 第50页 |
| ·质粒样品在管子中PCR条件的摸索 | 第50-51页 |
| ·对质粒样品直接进行芯片上引物延伸实验 | 第51页 |
| ·四条探针芯片引物延伸实验 | 第51-54页 |
| ·芯片制作 | 第51页 |
| ·质粒样品在管子中PCR条件的摸索 | 第51-52页 |
| ·引物延伸实验条件摸索 | 第52-54页 |
| ·芯片引物延伸方法检测结果 | 第54页 |
| 9. 总结 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-57页 |
| 第二章 微测序芯片检测转基因水稻方法的建立 | 第57-80页 |
| 前言 | 第57-58页 |
| 1. 材料 | 第58-60页 |
| ·芯片基片 | 第58页 |
| ·样品 | 第58页 |
| ·试剂 | 第58-59页 |
| ·芯片制备所用试剂 | 第58-59页 |
| ·样品制备所用试剂 | 第59页 |
| ·芯片处理所需试剂 | 第59页 |
| ·芯片杂交体系所用试剂 | 第59页 |
| ·微测序反应所需试剂 | 第59页 |
| ·芯片洗脱及显色所用试剂 | 第59页 |
| ·仪器和设备 | 第59-60页 |
| ·计算机分析软件 | 第60页 |
| 2. 方法原理 | 第60-61页 |
| 3. 样品提取 | 第61页 |
| 4. 样品处理过程 | 第61-67页 |
| ·引物设计 | 第61页 |
| ·不对称PCR扩增和常规PCR扩增体系 | 第61-62页 |
| ·PCR扩增程序 | 第62页 |
| ·PCR产物验证 | 第62-67页 |
| 5. 芯片制备 | 第67-68页 |
| ·探针设计及合成 | 第67页 |
| ·点样与固定 | 第67-68页 |
| 6. 探针固定效率实验 | 第68-69页 |
| ·荧光标记寡核苷酸探针 | 第68-69页 |
| ·基片固定率实验 | 第69页 |
| 7. 芯片表面处理 | 第69-70页 |
| 8. 样品不同处理方法比较实验 | 第70-74页 |
| ·PCR扩增 | 第70页 |
| ·杂交 | 第70-73页 |
| ·杂交温度的确立 | 第73-74页 |
| 9. 微测序反应 | 第74-76页 |
| ·方法 | 第74-75页 |
| ·杂交反应 | 第74页 |
| ·芯片上延伸反应 | 第74-75页 |
| ·芯片的洗脱及信号检测 | 第75页 |
| ·微测序方法检测结果 | 第75-76页 |
| 10. 总结 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 附录1 | 第81-82页 |
| 附录2 | 第82页 |
