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少动鞘氨醇单胞菌产结冷胶优化及其念珠藻黄素合成相关基因的功能分析

目录第5-11页
致谢第11-12页
英文缩略词(ABBREVIATION)第12-14页
摘要第14-16页
Abstract第16-18页
第一章 文献综述第19-44页
    1.1 少动鞘氨醇单胞菌产结冷胶的研究进展第19-38页
        1.1.1 结冷胶的结构第20页
        1.1.2 结冷胶的特性第20-22页
            1.1.2.1 稳定性好第20-21页
            1.1.2.2 高凝胶强度和透明度第21页
            1.1.2.3 温度滞后性第21页
            1.1.2.4 假塑性和流变性第21-22页
            1.1.2.5 良好的配伍性第22页
            1.1.2.6 熔点、凝固点、弹性、脆性、凝胶强度可以调节第22页
            1.1.2.7 优越的呈味性能和风味释放性第22页
        1.1.3 结冷胶的凝胶形成机制第22-23页
        1.1.4 影响结冷胶凝胶特性的因素第23-25页
            1.1.4.1 酰基含量第24页
            1.1.4.2 阳离子的类型和浓度第24页
            1.1.4.3 结冷胶浓度第24-25页
            1.1.4.4 pH值第25页
            1.1.4.5 亲水性成分第25页
        1.1.5 结冷胶的生物合成途径第25-30页
            1.1.5.1 糖核苷酸前体的合成第26-27页
            1.1.5.2 四糖重复单元的组装第27-28页
            1.1.5.3 四糖重复单元的聚合及结冷胶的分泌第28-29页
            1.1.5.4 结冷胶生物合成基因簇中功能未知的基因第29-30页
        1.1.6 结冷胶的发酵第30-33页
            1.1.6.1 菌种筛选第30页
            1.1.6.2 发酵工艺优化第30-33页
        1.1.7 结冷胶合成的代谢调控优化第33-36页
            1.1.7.1 对糖的分解代谢的改造第34页
            1.1.7.2 对结冷胶生物合成途径的改造第34-36页
            1.1.7.3 其它相关的基因工程改造第36页
        1.1.8 结冷胶的提取和纯化第36-37页
        1.1.9 结冷胶的应用第37-38页
    1.2 类胡萝卜素的结构、功能及生物合成途径第38-41页
        1.2.1 类胡萝卜素的结构第38-39页
        1.2.2 类胡萝卜素的功能第39-40页
        1.2.3 类胡萝卜素的生物合成途径第40-41页
    1.3 研究目的与研究内容第41-44页
第二章 结冷胶生产菌株的诱变选育第44-70页
    2.1 前言第44页
    2.2 材料第44-48页
        2.2.1 菌株第44-45页
        2.2.2 主要试剂第45页
        2.2.3 培养基与实验试剂的配制第45-47页
            2.2.3.1 YPG液体培养基第45页
            2.2.3.2 YPG固体培养基第45页
            2.2.3.3 种子培养基第45-46页
            2.2.3.4 摇瓶发酵培养基第46页
            2.2.3.5 发酵罐发酵培养基第46页
            2.2.3.6 发酵液残糖含量测定所需试剂第46页
            2.2.3.7 葡萄糖醛酸含量测定所需试剂第46-47页
            2.2.3.8 乙酰基含量测定所需试剂第47页
            2.2.3.9 结冷胶相对分子量测定所需试剂第47页
            2.2.3.10 发酵液丙酮酸含量测定所需试剂第47页
        2.2.4 主要仪器第47-48页
    2.3 方法第48-60页
        2.3.1 菌株诱变第48-49页
        2.3.2 结冷胶发酵流程第49页
            2.3.2.1 摇瓶发酵第49页
            2.3.2.2 罐上发酵第49页
        2.3.3 发酵液稳定性检测第49-50页
        2.3.4 乙酰基转移酶基因及其侧翼序列的分析第50-55页
            2.3.4.1 少动鞘氨醇单胞菌基因组DNA的提取第50页
            2.3.4.2 PCR扩增乙酰基转移酶基因第50-51页
            2.3.4.3 SiteFinding-PCR方法获得乙酰基转移酶基因侧翼序列第51-54页
            2.3.4.4 琼脂糖凝胶电泳第54页
            2.3.4.5 目的条带割胶回收后测序第54-55页
        2.3.5 结冷胶发酵分析第55-60页
            2.3.5.1 结冷胶产量测定第55页
            2.3.5.2 发酵液粘度测定第55页
            2.3.5.3 发酵液残糖含量测定第55-57页
            2.3.5.4 结冷胶分析样品的制备第57页
            2.3.5.5 葡萄糖、鼠李糖、甘油酰基含量测定第57页
            2.3.5.6 葡萄糖醛酸含量测定第57-58页
            2.3.5.7 酰基含量测定第58页
            2.3.5.8 结冷胶相对分子量测定第58-59页
            2.3.5.9 发酵液类胡萝卜素含量测定第59页
            2.3.5.10 发酵液丙酮酸含量测定第59-60页
    2.4 结果与讨论第60-68页
        2.4.1 诱变选育第60-61页
        2.4.2 罐上发酵性能的测定第61-62页
        2.4.3 结冷胶的组分和分子量分析第62-64页
        2.4.4 发酵液中类胡萝卜素含量和丙酮酸含量分析第64-66页
        2.4.5 乙酰基转移酶基因及其侧翼序列的分析第66-67页
        2.4.6 发酵液稳定性检测第67-68页
    2.5 本章小结第68-70页
第三章 基因敲除方法构建黄色素生成缺陷的少动鞘氨醇单胞菌第70-94页
    3.1 前言第70-71页
    3.2 材料第71-75页
        3.2.1 菌株与质粒第71-72页
        3.2.2 主要试剂第72页
        3.2.3 培养基的配制第72-73页
            3.2.3.1 YPG液体培养基第72页
            3.2.3.2 YPG固体培养基第72-73页
            3.2.3.3 LB液体培养基第73页
            3.2.3.4 LB固体培养基第73页
            3.2.3.5 预培养培养基第73页
            3.2.3.6 8%蔗糖平板筛选培养基第73页
            3.2.3.7 YM固体培养基第73页
            3.2.3.8 发酵培养基第73页
        3.2.4 主要仪器第73-75页
    3.3 方法第75-87页
        3.3.1 八氢番茄红素脱氢酶基因(crtI)的克隆第75-79页
            3.3.1.1 少动鞘氨醇单胞菌基因组DNA的提取第75页
            3.3.1.2 简并引物PCR扩增第75-76页
            3.3.1.3 目的条带与T载体的连接第76-77页
            3.3.1.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第77页
            3.3.1.5 连接产物转化大肠杆菌感受态细胞第77页
            3.3.1.6 菌落PCR挑选转化子第77-78页
            3.3.1.7 SiteFinding-PCR方法克隆八氢番茄红素脱氢酶基因及其侧翼序列第78-79页
        3.3.2 crtI基因敲除质粒的构建第79-82页
            3.3.2.1 质粒DNA小量提取第79-80页
            3.3.2.2 PCR扩增crtI基因上下游片段第80-81页
            3.3.2.3 crtI基因上游片段限制性内切酶酶切第81页
            3.3.2.5 DNA连接第81-82页
            3.3.2.6 连接产物转化大肠杆菌S17-1感受态细胞第82页
            3.3.2.7 阳性克隆的筛选和鉴定第82页
            3.3.2.8 pLO3-I重组质粒的构建第82页
        3.3.3 △crtI重组菌株的构建第82-86页
            3.3.3.1 三亲接合第82-83页
            3.3.3.2 重组子的筛选第83-86页
        3.3.4 结冷胶发酵第86页
        3.3.5 类胡萝卜素的提取和鉴定第86-87页
    3.4 结果与讨论第87-93页
        3.4.1 crtI基因序列分析第87-88页
        3.4.2 △crtI重组菌株的表型第88-89页
        3.4.3 类胡萝卜素的分离和鉴定第89-91页
        3.4.4 发酵性能的测定第91-93页
    3.5 本章小结第93-94页
第四章 黄色素生成缺陷的少动鞘氨醇单胞菌产结冷胶提取工艺的优化第94-100页
    4.1 前言第94页
    4.2 材料第94-96页
        4.2.1 菌株第94-95页
        4.2.2 主要试剂第95页
        4.2.3 培养基与实验试剂的配制第95-96页
            4.2.3.1 YPG液体培养基第95页
            4.2.3.2 YPG固体培养基第95页
            4.2.3.3 种子培养基第95页
            4.2.3.4 发酵罐发酵培养基第95页
            4.2.3.5 结冷胶的提取和纯化所需试剂第95-96页
        4.2.4 主要仪器第96页
    4.3 方法第96-97页
        4.3.1 结冷胶发酵第96页
        4.3.2 结冷胶的提取和纯化第96-97页
        4.3.3 制备的结冷胶成品中类胡萝卜素含量的测定第97页
            4.3.3.1 野生型菌株发酵制备的结冷胶成品第97页
            4.3.3.2 △crtI3发酵制备的结冷胶成品第97页
    4.4 结果与讨论第97-99页
        4.4.1 两种提取方法效果的比较第97-99页
    4.5 本章小结第99-100页
第五章 少动鞘氨醇单胞菌类胡萝卜素合成途径的研究第100-128页
    5.1 前言第100-101页
    5.2 材料第101-105页
        5.2.1 菌株与质粒第101-102页
        5.2.2 主要试剂第102-103页
        5.2.3 培养基与实验试剂的配制第103-104页
            5.2.3.1 YPG液体培养基第103页
            5.2.3.2 YPG固体培养基第103页
            5.2.3.3 LB液体培养基第103页
            5.2.3.4 LB固体培养基第103页
            5.2.3.5 YG培养基第103-104页
            5.2.3.6 预培养培养基第104页
            5.2.3.7 8%蔗糖平板筛选培养基第104页
            5.2.3.8 YM固体培养基第104页
            5.2.3.9 crtG基因诱导表达时IPTG的配制第104页
        5.2.4 主要仪器第104-105页
    5.3 方法第105-116页
        5.3.1 类胡萝卜素合成相关基因的克隆第105-108页
            5.3.1.1 少动鞘氨醇单胞菌基因组DNA的提取第105页
            5.3.1.2 类胡萝卜素生物合成基因簇的克隆第105页
            5.3.1.3 crtZ基因(β-胡萝卜素羟化酶基因)的克隆第105-108页
        5.3.2 序列分析和进化树构建第108页
        5.3.3 基因缺失菌株的构建第108-110页
            5.3.3.1 基因敲除质粒的构建第108页
            5.3.3.2 三亲接合及重组子的筛选第108-110页
        5.3.4 crtZ基因表达载体pACCAR16AcrtX-Z的构建第110-113页
            5.3.4.1 PCR扩增crtZ基因、Pantoea ananatis crtE基因第110-112页
            5.3.4.2 限制性内切酶酶切第112页
            5.3.4.3 DNA连接第112-113页
            5.3.4.4 连接产物转化大肠杆菌JM109感受态细胞第113页
            5.3.4.5 阳性克隆的筛选和鉴定第113页
        5.3.5 crtG基因表达载体pUC18G的构建第113-115页
            5.3.5.1 PCR扩增crtG基因第113-114页
            5.3.5.2 crtG基因片段、pUC18质粒限制性内切酶酶切第114-115页
            5.3.5.3 DNA连接第115页
            5.3.5.4 连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞第115页
            5.3.5.5 阳性克隆的筛选和鉴定第115页
        5.3.6 类胡萝卜素的提取和鉴定第115-116页
            5.3.6.1 少动鞘氨醇单胞菌菌体培养第115-116页
            5.3.6.2 大肠杆菌菌体培养第116页
            5.3.6.3 类胡萝卜素的分离和鉴定第116页
    5.4 结果与讨论第116-126页
        5.4.1 类胡萝卜素合成相关基因的克隆第116-117页
        5.4.2 类胡萝卜素合成相关基因的序列分析第117-121页
        5.4.3 基因缺失菌株所产类胡萝卜素的鉴定第121-123页
        5.4.4 crtZ、crtG基因在大肠杆菌中的表达第123-126页
    5.5 本章小结第126-128页
第六章 全文总结及后续工作建议第128-132页
    6.1 全文总结第128-130页
    6.2 本文创新点第130-131页
    6.3 后续工作建议第131-132页
参考文献第132-145页
攻读学位期间发表的论文第145-146页

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