| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第9-11页 |
| 1.2.1 丝状真菌菌体形态差异对液态发酵的影响 | 第9页 |
| 1.2.2 转录组学技术的研究及其应用 | 第9-10页 |
| 1.2.3 转录组学技术分析方法 | 第10页 |
| 1.2.4 华根霉液态发酵的研究基础 | 第10-11页 |
| 1.3 立题意义 | 第11页 |
| 1.4 主要研究内容 | 第11-13页 |
| 第二章 材料与方法 | 第13-18页 |
| 2.1 实验材料 | 第13-14页 |
| 2.1.1 菌种及培养基 | 第13页 |
| 2.1.2 培养条件 | 第13页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第13-14页 |
| 2.1.4 实验配制试剂 | 第14页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第14页 |
| 2.2 华根霉脂肪酶发酵实验方法 | 第14-15页 |
| 2.2.1 孢子悬浮液制备及菌体培养 | 第14-15页 |
| 2.2.2 干菌体制备及干重测定 | 第15页 |
| 2.2.3 脂肪酶合成活性测定 | 第15页 |
| 2.3 转录组学实验方法 | 第15页 |
| 2.3.1 细胞总RNA提取 | 第15页 |
| 2.3.2 RNA纯度检测 | 第15页 |
| 2.3.3 cDNA文库构建及测序分析 | 第15页 |
| 2.4 转录组测序结果数据分析方法 | 第15-18页 |
| 2.4.1 基因组注释整理及表达量分析 | 第15-16页 |
| 2.4.2 表达差异基因分析及聚类分析 | 第16页 |
| 2.4.3 eggNOG与KOG功能注释及分析方法 | 第16页 |
| 2.4.4 GO功能注释及富集分析方法 | 第16-17页 |
| 2.4.5 KO功能注释分析及KEGG及富集分析方法 | 第17-18页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第18-54页 |
| 3.1 转录组样本的制备及测序 | 第18-20页 |
| 3.1.1 华根霉脂肪酶发酵特性与转录组测序样本的制备 | 第18-19页 |
| 3.1.2 样本RNA质量 | 第19页 |
| 3.1.3 RNA测序质量分析 | 第19-20页 |
| 3.2 不同形态华根霉基因差异表达整体分析 | 第20-22页 |
| 3.2.1 不同形态华根霉转录组测序基因表达量的整体分析 | 第20页 |
| 3.2.2 表达差异基因聚类分析 | 第20-22页 |
| 3.2.3 表达差异基因差异情况分析 | 第22页 |
| 3.3 转录组基因表达量RPKM分析 | 第22-47页 |
| 3.3.1 不同形态华根霉表达最高量的基因分析 | 第22-30页 |
| 3.3.2 不同形态华根霉表达量最高的独有表达基因分析 | 第30-37页 |
| 3.3.3 不同形态华根霉表达差异倍数最显著的基因分析 | 第37-45页 |
| 3.3.4 转录组基因表达量RPKM连续性分析 | 第45-47页 |
| 3.4 差异基因富集分析比较 | 第47-54页 |
| 3.4.1 GO功能注释及富集 | 第47-49页 |
| 3.4.2 KEGG功能注释及富集 | 第49-50页 |
| 3.4.3 GO富集分析差异基因通过KEGG，KOG注释分析 | 第50-51页 |
| 3.4.4 富集分析差异蛋白的功能分析 | 第51-52页 |
| 3.4.5 脂肪酶差异基因表达分析 | 第52-53页 |
| 3.4.6 小结 | 第53-54页 |
| 主要结论与展望 | 第54-56页 |
| 主要结论 | 第54-55页 |
| 展望 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 附表 | 第62-75页 |
| 附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第75页 |
