| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第16-24页 |
| 1.1 苹果采后损失状况 | 第16页 |
| 1.2 控制水果采后病害的主要方法 | 第16-18页 |
| 1.2.1 物理法 | 第16-17页 |
| 1.2.2 化学法 | 第17页 |
| 1.2.3 生物法 | 第17-18页 |
| 1.3 苹果采后病原菌及PAT污染状况 | 第18-20页 |
| 1.4 苹果及其制品中PAT的产生及控制PAT的传统方法 | 第20-21页 |
| 1.5 利用拮抗微生物控制PAT及其机制 | 第21-23页 |
| 1.6 论文立题意义与研究内容 | 第23-24页 |
| 第二章 R.mucilaginosa对苹果采后青霉病及PAT产生的影响及其生理机制研究 | 第24-40页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-29页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第25页 |
| 2.2.2 拮抗酵母 | 第25-26页 |
| 2.2.3 病原菌 | 第26页 |
| 2.2.4 苹果 | 第26页 |
| 2.2.5 R.mucilaginosa对苹果采后青霉病的控制效果 | 第26页 |
| 2.2.6 R.mucilaginosa对苹果上PAT含量的影响 | 第26-27页 |
| 2.2.7 提取R.mucilaginosa、P.expansum和完好苹果组织的DNA | 第27页 |
| 2.2.8 引物的特异性 | 第27-28页 |
| 2.2.9 RT-qPCR测定苹果伤口处P.expansum生物量 | 第28页 |
| 2.2.10 R.mucilaginosa对P.expansum产毒的影响 | 第28页 |
| 2.2.11 R.mucilaginosa在苹果表皮处的生长动态 | 第28页 |
| 2.2.12 R.mucilaginosa对苹果抗性酶活的影响 | 第28-29页 |
| 2.2.13 扫描电镜观察苹果果实伤口处酵母和霉菌的生长情况 | 第29页 |
| 2.2.14 数据统计与分析 | 第29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-37页 |
| 2.3.1 R.mucilaginosa对苹果青霉病的控制效果 | 第29-30页 |
| 2.3.2 R.mucilaginosa对苹果伤口处PAT含量的影响 | 第30-31页 |
| 2.3.3 引物的特异性 | 第31-32页 |
| 2.3.4 P.expansum生物量的量化方程 | 第32页 |
| 2.3.5 R.mucilaginosa对苹果伤口处P.expansum生物量的影响 | 第32-33页 |
| 2.3.6 R.mucilaginosa对P.expansum产毒的影响 | 第33-34页 |
| 2.3.7 R.mucilaginosa在苹果表面的生长动态 | 第34-35页 |
| 2.3.8 R.mucilaginosa对苹果抗性酶活的研究 | 第35-37页 |
| 2.3.9 扫描电镜观察果实伤口处酵母和霉菌的生长情况 | 第37页 |
| 2.4 本章小结 | 第37-40页 |
| 第三章 R.mucilaginosa体外降解PAT的机制 | 第40-49页 |
| 3.1 引言 | 第40页 |
| 3.2 材料和方法 | 第40-43页 |
| 3.2.1 主要仪器 | 第40页 |
| 3.2.2 拮抗酵母 | 第40页 |
| 3.2.3 PAT含量的测定 | 第40页 |
| 3.2.4 R.mucilaginosa对PAT的降解作用 | 第40-41页 |
| 3.2.5 R.mucilaginosa细胞壁对PAT的吸附作用 | 第41页 |
| 3.2.6 R.mucilaginosa分泌物对PAT的降解作用 | 第41页 |
| 3.2.7 PAT刺激R.mucilaginosa产生的外代谢物对PAT的降解作用 | 第41-42页 |
| 3.2.8 PAT刺激下R.mucilaginosa产生的胞内酶对PAT的降解作用 | 第42页 |
| 3.2.9 环己酰亚胺对R.mucilaginosa降解PAT的影响 | 第42-43页 |
| 3.2.10 数据统计与分析 | 第43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-47页 |
| 3.3.1 R.mucilaginosa对PAT的降解作用 | 第43-44页 |
| 3.3.2 R.mucilaginosa细胞壁对PAT的吸附作用 | 第44-45页 |
| 3.3.3 R.mucilaginosa细胞外代谢物对PAT的降解作用 | 第45页 |
| 3.3.4 PAT刺激R.mucilaginosa产生的外代谢物对PAT的降解作用 | 第45-46页 |
| 3.3.5 PAT刺激下R.mucilaginosa产生的胞内酶对PAT的降解作用 | 第46-47页 |
| 3.3.6 环己酰亚胺对R.mucilaginosa降解PAT的影响 | 第47页 |
| 3.4 本章小结 | 第47-49页 |
| 第四章 基于iTRAQ技术的R.mucilaginosa对PAT应答调控的蛋白质组研究 | 第49-64页 |
| 4.1 引言 | 第49页 |
| 4.2 材料和方法 | 第49-53页 |
| 4.2.1 主要仪器 | 第49-50页 |
| 4.2.2 拮抗酵母 | 第50页 |
| 4.2.3 提取R.mucilaginosa总蛋白 | 第50页 |
| 4.2.4 胰酶酶解 | 第50页 |
| 4.2.5 标记 | 第50-51页 |
| 4.2.6 液相色谱-质谱联用技术 | 第51页 |
| 4.2.7 数据库搜索 | 第51页 |
| 4.2.8 质谱数据的质量控制 | 第51-52页 |
| 4.2.9 生物信息学分析 | 第52-53页 |
| 4.3 结果与分析 | 第53-60页 |
| 4.3.1 在PAT应力下R.mucilaginosa蛋白质组的量化和分析 | 第53-56页 |
| 4.3.2 GO富集分析 | 第56-58页 |
| 4.3.3 KEGG通路富集 | 第58-60页 |
| 4.3.4 蛋白结构域富集 | 第60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-64页 |
| 第五章 基于乙酰化蛋白修饰技术分析R.mucilaginosa对PAT的应答调控 | 第64-76页 |
| 5.1 引言 | 第64-65页 |
| 5.2 材料和方法 | 第65-67页 |
| 5.2.1 主要仪器 | 第65页 |
| 5.2.2 拮抗酵母 | 第65页 |
| 5.2.3 提取R.mucilaginosa总蛋白 | 第65页 |
| 5.2.4 胰酶酶解 | 第65页 |
| 5.2.5 标记 | 第65页 |
| 5.2.6 富集 | 第65-66页 |
| 5.2.7 LC-MS/MS分析 | 第66-67页 |
| 5.2.8 数据库检索 | 第67页 |
| 5.2.9 质谱数据的质量控制 | 第67页 |
| 5.2.10 生物信息学分析 | 第67页 |
| 5.3 结果与分析 | 第67-74页 |
| 5.3.1 在PAT应力R.mucilaginosa蛋白乙酰化修饰的量化和分析 | 第67-69页 |
| 5.3.2 GO分析 | 第69-70页 |
| 5.3.3 Motif分析 | 第70-72页 |
| 5.3.4 乙酰化蛋白质互作网络 | 第72-73页 |
| 5.3.5 差异乙酰化修饰蛋白参与的代谢过程 | 第73-74页 |
| 5.4 本章小结 | 第74-76页 |
| 第六章 基于巴豆酰化蛋白修饰技术分析R.mucilaginosa对PAT的应答调控 | 第76-88页 |
| 6.1 引言 | 第76页 |
| 6.2 材料和方法 | 第76-78页 |
| 6.2.1 主要仪器 | 第76页 |
| 6.2.2 拮抗酵母 | 第76页 |
| 6.2.3 提取R.mucilaginosa总蛋白 | 第76-77页 |
| 6.2.4 胰酶酶解 | 第77页 |
| 6.2.5 标记 | 第77页 |
| 6.2.6 富集 | 第77页 |
| 6.2.7 LC-MS/MS分析 | 第77页 |
| 6.2.8 数据库检索 | 第77页 |
| 6.2.9 质谱数据的质量控制 | 第77-78页 |
| 6.2.10 生物信息学分析 | 第78页 |
| 6.3 结果与分析 | 第78-86页 |
| 6.3.1 在PAT应力下R.mucilaginosa蛋白巴豆酰化修饰的量化和鉴定 | 第78-79页 |
| 6.3.2 差异巴豆酰化修饰蛋白的功能分类 | 第79-82页 |
| 6.3.3 差异巴豆酰化修饰蛋白的功能富集 | 第82-84页 |
| 6.3.4 巴豆酰化修饰蛋白质互作网络 | 第84-86页 |
| 6.4 本章小结 | 第86-88页 |
| 第七章 R.mucilaginosa对PAT应答调控的转录组分析 | 第88-102页 |
| 7.1 引言 | 第88页 |
| 7.2 材料和方法 | 第88-92页 |
| 7.2.1 主要仪器 | 第88-89页 |
| 7.2.2 拮抗酵母 | 第89页 |
| 7.2.3 样品制备 | 第89页 |
| 7.2.4 总RNA的提取与检测 | 第89页 |
| 7.2.5 文库的构建 | 第89页 |
| 7.2.6 文库质控 | 第89-90页 |
| 7.2.7 上机测序 | 第90页 |
| 7.2.8 生物信息学分析 | 第90页 |
| 7.2.9 测序数据及其质量控制 | 第90页 |
| 7.2.10 转录组测序数据组装 | 第90页 |
| 7.2.11 转录组文库质量评估 | 第90-91页 |
| 7.2.12 Unigene功能注释 | 第91页 |
| 7.2.13 Unigene表达量计算 | 第91页 |
| 7.2.14 差异表达基因筛选 | 第91页 |
| 7.2.15 RT-qPCR验证相关基因 | 第91-92页 |
| 7.3 结果与分析 | 第92-99页 |
| 7.3.1 测序数据与质量 | 第92页 |
| 7.3.2 转录组测序数据组装结果 | 第92-94页 |
| 7.3.3 Unigene功能注释 | 第94页 |
| 7.3.4 差异表达基因数目统计和功能分析 | 第94-98页 |
| 7.3.5 RT-qPCR结果分析 | 第98-99页 |
| 7.4 本章小结 | 第99-102页 |
| 第八章 R.mucilaginosa降解PAT的产物及其安全性研究 | 第102-110页 |
| 8.1 引言 | 第102页 |
| 8.2 材料和方法 | 第102-104页 |
| 8.2.1 主要仪器 | 第102页 |
| 8.2.2 拮抗酵母 | 第102-103页 |
| 8.2.3 PAT含量的测定 | 第103页 |
| 8.2.4 R.mucilaginosa降解PAT的产物 | 第103页 |
| 8.2.5 R.mucilaginosa降解PAT产物的毒性研究 | 第103-104页 |
| 8.2.6 数据统计与分析 | 第104页 |
| 8.3 结果与分析 | 第104-109页 |
| 8.3.1 R.mucilaginosa降解PAT产物的确定 | 第104-107页 |
| 8.3.2 R.mucilaginosa降解PAT产物毒性研究 | 第107-109页 |
| 8.4 本章小结 | 第109-110页 |
| 第九章 结论与展望 | 第110-112页 |
| 9.1 主要结论 | 第110-111页 |
| 9.2 本论文创新点 | 第111页 |
| 9.3 展望 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-131页 |
| 附录 | 第131-158页 |
| 致谢 | 第158-160页 |
| 博士期间取得的科研成果 | 第160-162页 |
