| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第8-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 肉类食品中病原菌的耐药现状 | 第13-16页 |
| 1.2 肉类食品中耐药菌的产生 | 第16-20页 |
| 1.2.1 细菌耐药性产生和传播的分子机制 | 第16-19页 |
| 1.2.2 肉类食品中细菌耐药性产生的原因 | 第19-20页 |
| 1.3 肉类食品中耐药菌的预防与监控 | 第20-21页 |
| 1.3.1 兽用抗生素的合理使用 | 第20页 |
| 1.3.2 兽用抗生素的风险评估 | 第20-21页 |
| 1.3.3 耐药菌和基因的检测和监控 | 第21页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 1.5 技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 基于宏基因组学的冷鲜畜肉中耐药细菌多样性分析 | 第23-41页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-27页 |
| 2.1.1 材料与试剂 | 第23-24页 |
| 2.1.2 样品预处理 | 第24-25页 |
| 2.1.3 宏基因组DNA提取 | 第25页 |
| 2.1.4 文库构建及高通量测序 | 第25-26页 |
| 2.1.5 数据处理 | 第26-27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-39页 |
| 2.2.1 宏基因组DNA提取及 16Sr DNA扩增 | 第27-28页 |
| 2.2.2 测序数据分析 | 第28-33页 |
| 2.2.3 样本菌群结构分析 | 第33-39页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第39-41页 |
| 第三章 冷鲜畜肉中耐药细菌及耐药基因的分布规律研究 | 第41-60页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-47页 |
| 3.1.1 材料与试剂 | 第41-43页 |
| 3.1.2 样品采集与处理 | 第43-44页 |
| 3.1.3 菌落计数 | 第44页 |
| 3.1.4 耐药菌分离鉴定 | 第44-45页 |
| 3.1.5 样品中耐药基因检测鉴定 | 第45-47页 |
| 3.1.6 统计学分析 | 第47页 |
| 3.2 结果与分析 | 第47-58页 |
| 3.2.1 菌落计数统计结果 | 第47-49页 |
| 3.2.2 耐药菌鉴定及分布结果 | 第49-54页 |
| 3.2.3 耐药基因流行特征 | 第54-58页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第58-60页 |
| 第四章 抗生素耐药分离株的耐药特征研究 | 第60-70页 |
| 4.1 材料与方法 | 第60-65页 |
| 4.1.1 材料与试剂 | 第60-61页 |
| 4.1.2 药物敏感性试验（AST） | 第61-62页 |
| 4.1.3 ESBLs表型确认试验 | 第62-63页 |
| 4.1.4 ESBLs基因分型 | 第63-65页 |
| 4.2 结果与分析 | 第65-68页 |
| 4.2.1 药敏结果 | 第65-67页 |
| 4.2.2 ESBLs表型确认及基因分型结果 | 第67-68页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第68-70页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第70-72页 |
| 5.1 全文总结 | 第70-71页 |
| 5.2 展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第82页 |
