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代谢工程技术构建产均聚物聚3-巯基丙酯的Advenella mimigardefordensis菌株

摘要第1-16页
ABSTRACT第16-20页
符号说明以及縮写词第20-23页
第一章 文献综述第23-46页
   ·PHA概述第23-28页
     ·PHA的组成和分类第23-24页
     ·PHA的微生物合成第24-26页
     ·PHA的物理化学特性和应用第26-28页
   ·聚硫脂(PTE)第28-40页
     ·PTE的化学合成第28-31页
     ·微生物法合成聚硫脂第31-32页
       ·微生物硫脂共聚物(PTE copolymer)第31页
       ·微生物硫脂均聚物(PTE homopolymer)第31-32页
     ·微生物PTE合成的代谢途径第32-33页
     ·微生物PTE鉴定分析方法和物理特性第33-36页
     ·微生物PTE的不可降解性第36-37页
     ·PTE前体底物第37-40页
   ·DTDP降解菌A.mimigardfordensis DPN7~T第40-44页
     ·菌株的获得和鉴定第41-42页
     ·DTDP降解途径的发现和鉴定第42-44页
   ·本论文的研究工作和意义第44-46页
第二章 合成PMP的A.mimigardefordensis菌株的初步构建第46-81页
   ·实验材料第49-56页
     ·菌株、质粒和引物第49-51页
       ·菌株和质粒第49-50页
       ·引物第50-51页
     ·培养基第51-52页
     ·抗生素第52-53页
     ·试验中常用的工具酶第53页
     ·常用的试剂盒第53页
     ·常用的试剂第53页
     ·分子量标记物第53页
     ·聚合酶链式反应(PCR)第53-54页
     ·仪器和设备第54页
     ·常用的试剂配方第54-56页
   ·实验方法第56-62页
     ·菌种保存方法第56页
     ·分子生物学常规操作第56-57页
       ·基因的克隆构建第56页
       ·用于基因敲除的自杀质粒的构建第56-57页
       ·DNA测序和序列分析第57页
     ·感受态制备,DNA转入细胞方法以及基因敲除方法第57-60页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第57页
       ·大肠杆菌的常规转化第57页
       ·大肠杆菌到A.mimigardefordensis菌株结合转移第57-58页
       ·A.mimigardefordensis菌株之间的电转化方法第58页
       ·利用自杀质粒对A.mimigardefordensis菌株内基因的精确敲除的方法第58-60页
     ·不同菌株的用途,培养方法和菌浓检测方法第60-61页
     ·PHA以及PMP的GC检测第61-62页
     ·PHA和PMP的GC/MS分析第62页
     ·HPLC对发酵液上清分析第62页
   ·实验结果第62-77页
     ·菌株和重组质粒系统的选择第62-64页
     ·3MP,3HB以及3HV的GC检测标准曲线的构建第64-65页
     ·重组质粒pBBR1MCS5::BPEC的构建和验证第65-66页
     ·菌株SHX1,STn5-1S,STn5-2S出现的问题第66-69页
     ·菌株SHX1的PMP生产初步尝试第69-72页
     ·buk-ptb操纵子对菌株生长抑制作用的发现第72-73页
     ·mdo基因的敲除、buk-ptb操纵子整合和recA基因敲除第73-75页
     ·RT-PCR验证第75-76页
     ·重组优化菌株进行PMP合成第76-77页
   ·讨论第77-79页
   ·本章小结第79-81页
第三章 A.mimigardefordensis菌株合成PMP的优化第81-117页
   ·实验材料第81-84页
     ·菌株、质粒和引物第81-84页
       ·菌株和质粒第81-83页
       ·引物第83-84页
   ·实验方法第84-85页
     ·基因的克隆构建第84页
     ·用于基因敲除和基因插入的自杀质粒的构建第84页
     ·不同菌株的用途和培养方法第84-85页
   ·实验结果第85-110页
     ·碳源的优化第85-91页
       ·单一碳源的尝试第85-87页
       ·甘油和丙酸钠作为混合碳源的优缺点第87-91页
     ·发酵方式的优化第91-96页
       ·带有挡板的摇瓶不适合A.mimigardefordensis发酵第91-92页
       ·一阶法发酵的尝试和缺点第92-94页
       ·二阶培养法中第一阶培养终点的优化第94-96页
     ·菌株SHX5发酵中各成分随时间的变化分析第96-97页
     ·新PMP合成途径的发现与优化第97-105页
       ·关键酶PhaC_(Am)的发现以及和重组表达的同工酶PhaEC活力比较第97-99页
       ·不同来源PHA合成酶活力的比较分析第99-101页
       ·内源PHA合成酶的优化提高了PMP含量第101-103页
       ·PHA合成酶含量的最优化选择第103-105页
     ·PMP高产菌株SHX22批次摇瓶发酵中各组分随时间的变化分析第105-106页
     ·3MP“相对剩余”现象的解决策略第106-110页
       ·三种策略的提出第106-108页
       ·降低DTDP浓度(策略B)的实验结果第108-109页
       ·催化3MP变为3MP-CoA的酶的寻找(策略C)第109-110页
   ·讨论第110-115页
   ·本章小结第115-117页
第四章 均聚物PMP提纯和鉴定第117-130页
   ·背景简介第117-121页
     ·PHA定性鉴定方法第117页
     ·PHA和PMP的纯化方法第117-118页
     ·活性PHA颗粒和PMP颗粒简介第118-121页
     ·本章研究工作第121页
   ·实验方法第121-124页
     ·尼罗红染色第121页
     ·PMP的提取实验第121页
     ·甘油密度梯度离心提取PMP颗粒第121-122页
     ·PMP颗粒上的蛋白SDS-PAGE分析第122-124页
     ·非特异性的蛋白考马斯亮蓝染色第124页
   ·实验结果第124-127页
     ·活性PMP颗粒的观察第125页
     ·活性PMP颗粒纯化以及颗粒上嵌入蛋白的初步分析第125-126页
     ·PMP的纯化和鉴定第126-127页
   ·结果讨论第127-128页
   ·本章小结第128-130页
创新型成果和展望第130-131页
参考文献第131-139页
致谢第139-140页
攻读学位期间发表的论文第140-141页
附件第141-186页

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