| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-43页 |
| 1．1 代谢工程的研究范畴 | 第13页 |
| 1．2 从代谢网络看代谢工程研究的意义 | 第13-15页 |
| 1．3 代谢分析中研究方法 | 第15-17页 |
| 1．4 代谢通量分析 | 第17-24页 |
| 1．5 代谢控制分析 | 第24-26页 |
| 1．6 同位素标记在代谢通量分析上的应用 | 第26-27页 |
| 1．7 蛋白质组学研究进展 | 第27-31页 |
| 1．8 对酵母代谢调控过程的研究进展 | 第31-35页 |
| 1．9 本研究的基本思路 | 第35-43页 |
| 第二章 S．cerevisiae以葡萄糖、甘油和乙酸为碳源条件下中间代谢途径关键酶活分析 | 第43-53页 |
| 2．1 引言 | 第43页 |
| 2．2 材料与方法 | 第43-45页 |
| 2．2．1 菌种与培养条件 | 第43-44页 |
| 2．2．2 实验仪器 | 第44页 |
| 2．2．3 化学试剂 | 第44页 |
| 2．2．4 分析方法 | 第44页 |
| 2．2．5 样品制备 | 第44-45页 |
| 2．2．6 酶活性检测 | 第45页 |
| 2．3 结果与讨论 | 第45-49页 |
| 2．4 本章小结 | 第49-53页 |
| 第三章 S．cerevisiae在发酵不同阶段和以乳酸为碳源下的蛋白质组解析和酶活性分析 | 第53-67页 |
| 3．1 引言 | 第53页 |
| 3．2 材料与方法 | 第53-55页 |
| 3．2．1 菌种与培养条件 | 第53-54页 |
| 3．2．2 实验仪器 | 第54页 |
| 3．2．3 化学试剂 | 第54页 |
| 3．2．4 检测方法 | 第54页 |
| 3．2．5 蛋白质双向电泳 | 第54-55页 |
| 3．2．6 图像采集与分析 | 第55页 |
| 3．3 结果与讨论 | 第55-64页 |
| 3．3．1 菌体生长、底物消耗及部分胞外代谢产物的积累与消耗 | 第55-57页 |
| 3．3．2 酶活性检测 | 第57-60页 |
| 3．3．3 蛋白质双向电泳 | 第60-62页 |
| 3．3．4 糖酵解途径和磷酸戊糖途径 | 第62-63页 |
| 3．3．5 三羧酸循环、乙醛酸支路和糖异生途径 | 第63-64页 |
| 3．4 本章小结 | 第64-67页 |
| 第四章 基于系数矩阵模型的中间代谢途径代谢通量平衡分析 | 第67-75页 |
| 4．1 引言 | 第67页 |
| 4．2 中间代谢途径模型的建立 | 第67-69页 |
| 4．3 对中间代谢途径的代谢通量平衡 | 第69-72页 |
| 4．3．1 拟稳态 | 第69-71页 |
| 4．3．2 系数矩阵 | 第71-72页 |
| 4．4 本章小结 | 第72-75页 |
| 第五章 基于~(13)C标记实验的S．cerevisiae的中间代谢途径代谢通量分析方法 | 第75-97页 |
| 5．1 引言 | 第75页 |
| 5．2 对中间代谢途径化学反应的描述 | 第75-84页 |
| 5．2．1 中间代谢产物平衡 | 第75-77页 |
| 5．2．2 原子映射矩阵数据库的构建 | 第77-84页 |
| 5．3 中间代谢产物向量与同位素分布向量 | 第84-85页 |
| 5．4 同位素映射矩阵 | 第85-87页 |
| 5．5 非线性系统的偏微分形式Jacobi矩阵 | 第87-91页 |
| 5．5．1 同位素平衡非线性系统偏微分Jacobi矩阵的一般形式 | 第87-88页 |
| 5．5．2 以IDV为变量的分块矩阵形式 | 第88-91页 |
| 5．6 反应映射矩阵 | 第91-92页 |
| 5．7 代谢网络的同位素平衡分析 | 第92-93页 |
| 5．8 ~(13)C-~1H二维核磁共振实验 | 第93页 |
| 5．9 酵母中间代谢途径中中间代谢产物对氨基酸标记模式的贡献 | 第93-95页 |
| 5．10 本章小结 | 第95-97页 |
| 第六章 用基因杂合算法进行S．cerevisiae中间代谢途径代谢通量分析 | 第97-107页 |
| 6．1 引言 | 第97页 |
| 6．2 Sequential-Simplex技术局部优化 | 第97-98页 |
| 6．3 基因杂合算法在通量分析中的应用 | 第98-103页 |
| 6．4 本章小结 | 第103-107页 |
| 第七章 ~(13)C标记实验及不同碳源下代谢过程解析 | 第107-123页 |
| 7．1 引言 | 第107页 |
| 7．2 E．coliK12的~(13)C标记碳源培养实验 | 第107-111页 |
| 7．2．1 材料与方法 | 第107-108页 |
| 7．2．1．1 菌种与培养基 | 第107-108页 |
| 7．2．1．2 化学试剂 | 第108页 |
| 7．2．1．3 分析方法 | 第108页 |
| 7．2．1．4 二维核磁共振实验 | 第108页 |
| 7．2．2 结果与讨论 | 第108-111页 |
| 7．3 S．cerevisiae以葡萄糖，甘油，乙酸为碳源的~(13)C标记实验 | 第111-119页 |
| 7．3．1 材料与方法 | 第111-112页 |
| 7．3．1．1 菌种与培养基 | 第111页 |
| 7．3．1．2 连续培养~(13)C标记实验 | 第111-112页 |
| 7．3．1．3 化学试剂 | 第112页 |
| 7．3．1．4 分析方法 | 第112页 |
| 7．3．1．5 二维核磁共振实验 | 第112页 |
| 7．3．2 结果与讨论 | 第112-119页 |
| 7．3．2．1 不同碳源下发酵过程中生长相关参数 | 第112-113页 |
| 7．3．2．2 不同碳源下发酵过程中代谢通量分析 | 第113-119页 |
| 7．4 本章小结 | 第119-123页 |
| 第八章 结论与展望 | 第123-127页 |
| 8．1 S．cerevisiae在不同的培养条件下胞内代谢机理的变化 | 第123-125页 |
| 8．2 对S．cerevisiae中间代谢途径代谢通量分析数学模型的建立与改进 | 第125-126页 |
| 8．3 建议与展望 | 第126-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 论文发表情况 | 第128页 |
