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环介导等温扩增(LAMP)技术检测贝类中副溶血弧菌的研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 引言第11-28页
   ·立题背景及目的第11-12页
   ·副溶血弧菌简介第12-13页
     ·副溶血弧菌生物学性状第12页
     ·副溶血弧菌的流行病学特征第12-13页
     ·副溶血弧菌的毒力因子第13页
   ·副溶血弧菌检测方法研究现状第13-16页
   ·环介导等温扩增(LAMP)技术概述第16-26页
     ·LAMP 的特点第16-17页
     ·LAMP 方法的引物设计第17-19页
     ·LAMP 反应原理第19-23页
     ·LAMP 反应产物的检测方法第23-24页
     ·LAMP 方法的应用第24-26页
   ·研究内容第26-28页
2 材料与方法第28-40页
   ·试验材料第28-30页
     ·试验菌株第28-29页
     ·仪器与设备第29页
     ·主要培养基第29页
     ·样品与生化试剂第29-30页
   ·试验方法第30-31页
     ·副溶血弧菌培养第30页
     ·副溶血弧菌基因组DNA 的提取第30-31页
   ·引物设计和操作程序第31页
     ·LAMP 引物设计第31页
     ·LAMP 和PCR 操作程序第31页
   ·PCR 反应条件的优化第31-32页
   ·LAMP 反应条件优化第32-34页
     ·反应温度的优化第32页
     ·适宜Mg~(2+)浓度选择第32页
     ·dNTPs 浓度的优化第32页
     ·Bst 酶的优化第32-33页
     ·引物对LAMP 反应的影响第33页
     ·甜菜碱对LAMP 反应的影响第33页
     ·反应时间的优化第33-34页
   ·引物特异性的检测第34页
     ·LAMP 引物特异性的检测第34页
     ·PCR 引物特异性的检测第34页
   ·副溶血弧菌的灵敏度检测第34-35页
     ·LAMP 检测副溶血弧菌基因组灵敏度第34页
     ·PCR 检测副溶血弧菌基因组灵敏度第34页
     ·LAMP 检测副溶血弧菌纯培养的灵敏度第34-35页
     ·PCR 检测副溶血弧菌纯培养的灵敏度第35页
   ·LAMP 扩增产物的分析第35-36页
     ·LAMP 产物的可视结果分析第35页
     ·LAMP 产物的凝胶成像分析第35页
     ·LAMP 产物的荧光分析第35页
     ·LAMP 产物酶切结果的分析第35-36页
   ·人工污染贝肉中副溶血弧菌基因组DNA 提取方法比较第36-38页
     ·人工污染贝肉第36页
     ·试剂盒法(MiniBEST 细菌基因组 DNA 提取试剂盒)第36-37页
     ·溶剂提取热裂解法第37页
     ·普通热裂解法第37页
     ·蛋白酶K 法第37-38页
     ·FDA 提取DNA 法第38页
     ·苯酚-氯仿抽提法第38页
   ·人工污染贝肉的检出限第38-39页
     ·LAMP 法检测人工污染副溶血弧菌样品的检出限第39页
     ·PCR 的检出限第39页
   ·基于预增菌法LAMP 检测副溶血弧菌第39页
   ·实际样品(贝肉)检测第39-40页
3 结果与分析第40-57页
   ·LAMP 反应条件的优化第40-45页
     ·引物的优化第40-42页
     ·Mg~(2+)浓度的优化第42页
     ·dNTPs 浓度的优化第42-43页
     ·Bst 酶的优化第43页
     ·甜菜碱对LAMP 反应的影响第43-44页
     ·反应温度的优化第44页
     ·反应时间的优化第44-45页
     ·LAMP 反应的最佳反应体系第45页
   ·优化PCR 反应体系结果第45-48页
   ·引物特异性的研究第48页
     ·LAMP 引物特异性的研究第48页
     ·PCR 引物特异性的研究第48页
   ·副溶血弧菌灵敏度的研究第48-51页
     ·LAMP 检测副溶血弧菌的基因组灵敏度第48-49页
     ·PCR 检测副溶血弧菌基因组灵敏度第49-50页
     ·LAMP 检测副溶血弧菌的灵敏度第50页
     ·PCR 检测副溶血弧菌的灵敏度第50-51页
   ·LAMP 扩增产物的分析第51-53页
     ·LAMP 扩增的可视结果分析第51-52页
     ·LAMP 扩增产物的电泳分析第52页
     ·LAMP 产物的荧光分析第52-53页
     ·LAMP 扩增产物酶切鉴定第53页
   ·贝肉中副溶血弧菌DNA 提取方法比较第53-54页
   ·人工污染贝肉检出限比较第54-55页
     ·LAMP 检测贝肉中副溶血弧菌检出限第54页
     ·PCR 检测贝肉中副溶血弧菌检出限第54-55页
   ·副溶血性弧菌阳性样品增菌培养第55页
   ·实际样品(贝肉)检测第55-57页
4 讨论第57-62页
   ·环介导等温扩增(LAMP)方法检测副溶血弧菌方法学评价第57页
   ·环介导等温扩增(LAMP)引物的选择第57-58页
   ·LAMP 体系优化第58-59页
   ·模板 DNA 的提取第59-60页
   ·增菌计数时间的选择第60页
   ·LAMP 产物酶切电泳条件的选择第60页
   ·LAMP 污染问题,原因,注意事项第60-61页
   ·预增菌LAMP 检测第61页
   ·基因组检测灵敏度和纯菌检测灵敏度之间的差异第61-62页
5 结论第62-63页
参考文献第63-71页
硕士期间发表学术论文第71-73页
作者简介第73-74页
致谢第74-75页

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