| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-31页 |
| 1.1 微生物多糖的研究进展及其应用 | 第10-30页 |
| 1.1.1 微生物多糖的应用 | 第10-11页 |
| 1.1.2 重要的微生物多糖 | 第11-15页 |
| 1.1.3 微生物菌体的测定 | 第15-17页 |
| 1.1.4 微生物多糖的发酵动力学 | 第17-18页 |
| 1.1.5 微生物多糖的生物合成途径及氮源的影响 | 第18-22页 |
| 1.1.6 流变学分析 | 第22-24页 |
| 1.1.7 微生物多糖分离纯化和结构鉴定 | 第24-28页 |
| 1.1.8 转录组研究及生物信息学技术 | 第28-30页 |
| 1.2 研究目的和研究内容 | 第30-31页 |
| 1.2.1 研究目的和意义 | 第30页 |
| 1.2.2 研究内容 | 第30-31页 |
| 第二章 Sphingomonas sp. ATCC 31555 生物量测定及其发酵动力学研究 | 第31-40页 |
| 2.1 前言 | 第31-32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-34页 |
| 2.2.1 菌种试剂与仪器 | 第32页 |
| 2.2.2 化学试剂 | 第32页 |
| 2.2.3 仪器与设备 | 第32-33页 |
| 2.2.4 培养基 | 第33页 |
| 2.2.5 培养方法 | 第33页 |
| 2.2.6 分析方法 | 第33-34页 |
| 2.2.7 发酵液中NaNO3浓度的测定 | 第34页 |
| 2.2.8 发酵动力学模拟 | 第34页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第34-39页 |
| 2.3.2 通过测定N-乙酰葡萄糖胺的量表征Sphingomonas sp. ATCC 31555 的菌体量 | 第34-37页 |
| 2.3.3 公式模拟与实测的对比 | 第37-38页 |
| 2.3.4 拟合的方程及其参数 | 第38-39页 |
| 2.4 小结 | 第39-40页 |
| 第三章 Sphingomonas sp. ATCC31555发酵氮源优化及威兰胶结构鉴定 | 第40-50页 |
| 3.1 前言 | 第40页 |
| 3.2 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.2.1 仪器与设备 | 第40页 |
| 3.2.2 威兰胶的提取纯化 | 第40-41页 |
| 3.2.3 粘度的测定 | 第41页 |
| 3.2.4 单糖组成分析 | 第41页 |
| 3.2.5 多糖分子量测定方法：高效凝胶过滤色谱法（HPGFC） | 第41页 |
| 3.2.6 傅立叶红外光谱（FT-IR）分析 | 第41页 |
| 3.2.7 乙酰基、丙酰基测定 | 第41-42页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第42-48页 |
| 3.3.1 不同氮源对威兰胶产量的影响 | 第42-45页 |
| 3.3.2 不同氮源对威兰胶结构的影响 | 第45-48页 |
| 3.4 小结 | 第48-50页 |
| 第四章 不同氮源产威兰胶的流变学特性研究 | 第50-59页 |
| 4.1 前言 | 第50页 |
| 4.2 材料与方法 | 第50-52页 |
| 4.2.1 实验菌株 | 第50页 |
| 4.2.2 主要仪器和试剂 | 第50页 |
| 4.2.3 培养基 | 第50-51页 |
| 4.2.4 发酵工艺 | 第51页 |
| 4.2.5 威兰胶的提取 | 第51页 |
| 4.2.6 待测样品制备 | 第51页 |
| 4.2.7 金属离子对威兰胶溶液粘度的影响 | 第51页 |
| 4.2.8 pH对威兰胶溶液粘度的影响 | 第51页 |
| 4.2.9 不同转速对威兰胶溶液粘度的影响 | 第51页 |
| 4.2.10 长时间高温对威兰胶溶液粘度的影响 | 第51页 |
| 4.2.11 持续升温条件对威兰胶溶液动态模量的影响 | 第51-52页 |
| 4.2.12 不同pH对威兰胶溶液动态模量的影响 | 第52页 |
| 4.2.13 不同金属离子对威兰胶溶液动态模量的影响 | 第52页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第52-58页 |
| 4.3.1 金属离子对威兰胶溶液粘度的影响 | 第52-53页 |
| 4.3.2 pH对威兰胶溶液粘度的影响 | 第53页 |
| 4.3.3 转速对威兰胶溶液粘度的影响 | 第53-54页 |
| 4.3.4 温度对威兰胶溶液流变性的影响 | 第54-56页 |
| 4.3.5 金属离子对威兰胶溶液流变性的影响 | 第56-57页 |
| 4.3.6 pH对威兰胶溶液流变性的影响 | 第57-58页 |
| 4.4 小结 | 第58-59页 |
| 第五章 不同氮源的Sphingomonas sp. ATCC 31555 比较转录组分析和验证 | 第59-84页 |
| 5.1 前言 | 第59页 |
| 5.2 材料与方法 | 第59-66页 |
| 5.2.1 菌株 | 第59页 |
| 5.2.2 培养基 | 第59页 |
| 5.2.3 菌株培养 | 第59-60页 |
| 5.2.4 菌体生物量和威兰胶浓度的测定 | 第60页 |
| 5.2.5 RNA提取 | 第60页 |
| 5.2.6 cDNA文库构建及测序 | 第60页 |
| 5.2.7 数据过滤 | 第60-61页 |
| 5.2.8 UniGene组装 | 第61页 |
| 5.2.9 基因区段预测 | 第61页 |
| 5.2.10 简单重复序列(simple sequence repeats，SSRs)的识别 | 第61-62页 |
| 5.2.11 基因注释 | 第62页 |
| 5.2.12 Unigene的功能分类 | 第62页 |
| 5.2.13 基因的差异表达分析 | 第62页 |
| 5.2.14 差异表达基因的功能富集分析 | 第62-63页 |
| 5.2.15 实时定量PCR（RT-qPCR）验证基因表达水平 | 第63-64页 |
| 5.2.16 统计分析 | 第64-66页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第66-82页 |
| 5.3.1 测序产量统计及质量评估 | 第66页 |
| 5.3.2 转录本拼接及质量评估 | 第66页 |
| 5.3.3 SSR序列分析 | 第66-68页 |
| 5.3.4 Unigenes的注释和功能分类 | 第68页 |
| 5.3.5 不同氮源下基因表达水平的差异 | 第68-71页 |
| 5.3.6 差异表达基因的功能富集分析 | 第71-76页 |
| 5.3.7 重要酶对应的基因表达比较 | 第76-77页 |
| 5.3.8 差异表达基因的表达水平验证 | 第77-79页 |
| 5.3.9 重要酶的差异表达基因表达水平验证 | 第79-82页 |
| 5.4 小结 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 论文创新点 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-96页 |
| 附录Ⅰ作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第96页 |
