| 摘要 | 第4-7页 |
| abstract | 第7-10页 |
| 第1章 绪论 | 第14-35页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第14-15页 |
| 1.2 农作物秸秆的生物质能转化潜力 | 第15-18页 |
| 1.3 利用五碳糖发酵产乙醇的微生物 | 第18-22页 |
| 1.3.1 利用五碳糖发酵产乙醇的微生物种类 | 第18-21页 |
| 1.3.2 微生物的五碳糖代谢途径 | 第21-22页 |
| 1.4 尖胞镰刀菌在五碳糖发酵产乙醇中的应用 | 第22-24页 |
| 1.4.1 尖胞镰刀菌的形态 | 第22-23页 |
| 1.4.2 尖胞镰刀菌利用五碳糖产乙醇的概况 | 第23-24页 |
| 1.5 多组学研究技术在五碳糖代谢中的应用 | 第24-31页 |
| 1.5.1 高通量基因测序技术 | 第24-25页 |
| 1.5.2 真菌基因组测序研究 | 第25页 |
| 1.5.3 比较转录组学在真菌糖代谢中的应用 | 第25-29页 |
| 1.5.4 真菌线粒体基因组的研究 | 第29-31页 |
| 1.6 存在的问题 | 第31-32页 |
| 1.7 研究内容与技术路线 | 第32-35页 |
| 1.7.1 研究内容 | 第32-33页 |
| 1.7.2 研究技术路线 | 第33-35页 |
| 第2章 五碳糖发酵产乙醇菌株的筛选 | 第35-53页 |
| 2.1 试验材料和方法 | 第35-39页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第35-37页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第37-39页 |
| 2.2 结果与分析 | 第39-53页 |
| 2.2.1 五碳糖发酵产乙醇菌株的筛选 | 第39-46页 |
| 2.2.2 五碳糖发酵低产菌株的诱变 | 第46-48页 |
| 2.2.3 五碳糖发酵产乙醇的尖孢镰刀菌差异菌株筛选 | 第48-53页 |
| 第3章 尖孢镰刀菌差异株在五碳糖不同发酵时期的转录组(RNA-Seq)分析 | 第53-86页 |
| 3.1 试验材料与方法 | 第53-60页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第53-54页 |
| 3.1.2 试验仪器 | 第54页 |
| 3.1.3 试验方法 | 第54-60页 |
| 3.2 结果与分析 | 第60-86页 |
| 3.2.1 差异株的五碳糖发酵比较 | 第60页 |
| 3.2.2 RNA-Seq测序样品的质量检测 | 第60-63页 |
| 3.2.3 RNA-Seq测序与拼接 | 第63-65页 |
| 3.2.4 差异菌株不同五碳糖发酵时期的KOG分析 | 第65-71页 |
| 3.2.5 差异菌株在五碳糖代谢Pathway的表达情况比较分析 | 第71-78页 |
| 3.2.6 差异菌株在五碳糖同一发酵时期的差异表达分析 | 第78-84页 |
| 3.2.7 RNA-Seq差异基因的荧光定量PCR检测 | 第84-86页 |
| 第4章 五碳糖发酵产乙醇高产菌mh2-2的线粒体基因组分析 | 第86-106页 |
| 4.1 试验材料与方法 | 第86-88页 |
| 4.1.1 试验材料与试剂 | 第86-87页 |
| 4.1.2 试验方法 | 第87-88页 |
| 4.2 结果与分析 | 第88-106页 |
| 4.2.1 mh2-2线粒体基因组的组成及比较分析 | 第88-92页 |
| 4.2.2 mh2-2的蛋白质编码基因与镰刀菌线粒体基因组的分布比较 | 第92-93页 |
| 4.2.3 影响mh2-2基因组大小差异因素的定量分析 | 第93-95页 |
| 4.2.4 mh2-2在镰刀菌线粒体基因组中的系统发育分析 | 第95-96页 |
| 4.2.5 mh2-2非典型基因进化的轨迹 | 第96-99页 |
| 4.2.6 mh2-2线粒体基因功能与RNA-Seq表达关联的初探 | 第99-106页 |
| 第5章 讨论 | 第106-116页 |
| 5.1 尖孢镰刀菌mh2-2是优良的野生型五碳糖发酵产乙醇菌株 | 第106-109页 |
| 5.1.1 相对于本试验的细菌和酵母菌,mh2-2的五碳糖发酵产乙醇性能更优 | 第106-107页 |
| 5.1.2 紫外、辐照诱变可用于五碳糖高转化乙醇突变株的筛选 | 第107-108页 |
| 5.1.3 尖孢镰刀菌生理小种五碳糖发酵的生物学差异明显 | 第108-109页 |
| 5.2 RNA-Seq测序可以更直观的发现菌株的表达差异基因 | 第109-112页 |
| 5.2.1 通过RNA-Seq测序技术可全面获知尖孢镰刀菌的基因表达情况 | 第109-111页 |
| 5.2.2 ABCtransporter在五碳糖发酵产乙醇的衰退期可能发挥了重要作用 | 第111-112页 |
| 5.2.3 L-艾杜醇脱氢酶与木酮糖激酶在利用五碳糖产乙醇的差异株中具有表达差异 | 第112页 |
| 5.3 利用木糖产乙醇高产菌mh2-2的线粒体基因组研究及推测 | 第112-116页 |
| 5.3.1 线粒体在五碳糖代谢生成乙醇的过程中发挥着重要的作用 | 第113页 |
| 5.3.2 线粒体基因组进化研究可为镰刀菌菌株的种间功能差异提供依据 | 第113-114页 |
| 5.3.3 首次对自私基因元件HEGs进行表达量分析,发现其参与菌株的生理活动 | 第114-116页 |
| 创新点 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-133页 |
| 附表 | 第133-136页 |
| 致谢 | 第136-138页 |
| 作者简介 | 第138页 |
