| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-14页 |
| 1.1 氧化葡萄糖杆菌的研究进展 | 第7-8页 |
| 1.1.1 氧化葡萄糖酸杆菌概述 | 第7页 |
| 1.1.2 氧化葡萄糖酸杆菌的应用 | 第7-8页 |
| 1.2 吡咯喹啉醌的研究进展 | 第8-9页 |
| 1.2.1 PQQ性质与用途 | 第8页 |
| 1.2.2 PQQ合成与转运途径 | 第8-9页 |
| 1.3 系统生物学的研究进展 | 第9-12页 |
| 1.3.1 系统生物学简介 | 第9页 |
| 1.3.2 转录组学简介 | 第9-10页 |
| 1.3.3 蛋白质组学简介 | 第10-11页 |
| 1.3.4 系统生物学在氧化葡萄糖酸杆菌研究中的应用 | 第11-12页 |
| 1.4 立题依据和研究意义 | 第12页 |
| 1.5 主要研究内容 | 第12-14页 |
| 第二章 材料与方法 | 第14-22页 |
| 2.1 实验材料 | 第14-15页 |
| 2.1.1 菌种和质粒 | 第14页 |
| 2.1.2 培养基 | 第14页 |
| 2.1.3 实验所用主要试剂 | 第14-15页 |
| 2.1.4 实验所用主要仪器 | 第15页 |
| 2.2 转录组学实验方法 | 第15-16页 |
| 2.2.1 细胞培养及总RNA提取 | 第15-16页 |
| 2.2.2 c DNA文库的构建及Miseq上机测序 | 第16页 |
| 2.2.3 RNA-Seq数据处理与分析 | 第16页 |
| 2.3 蛋白质组学实验方法 | 第16-19页 |
| 2.3.1 细胞培养 | 第16-17页 |
| 2.3.2 细胞全蛋白提取 | 第17页 |
| 2.3.3 细胞膜蛋白提取 | 第17-18页 |
| 2.3.4 双向电泳 | 第18页 |
| 2.3.5 荧光双向电泳 | 第18-19页 |
| 2.3.6 质谱鉴定 | 第19页 |
| 2.3.7 生物信息学分析 | 第19页 |
| 2.4 分子生物学实验方法 | 第19-22页 |
| 2.4.1 q PCR验证 | 第19-20页 |
| 2.4.2 基因过表达实验方法 | 第20-21页 |
| 2.4.3 PQQ检测方法 | 第21页 |
| 2.4.4 不同PQQ浓度下测定G. oxydans生长曲线 | 第21-22页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第22-38页 |
| 3.1 G. oxydans双向电泳全蛋白与膜蛋白提取方法比较 | 第22-24页 |
| 3.1.1 G. oxydans总蛋白 2-DE图谱的建立 | 第22页 |
| 3.1.2 G. oxydans膜蛋白 2-DE图谱的建立 | 第22-24页 |
| 3.1.3 重复性验证 | 第24页 |
| 3.2 对照菌株与pqq B过表达重组菌株的比较组学分析 | 第24-32页 |
| 3.2.1 对照菌株与pqq B过表达重组菌株的比较转录组学结果 | 第25-26页 |
| 3.2.2 对照菌株与pqq B过表达重组菌株的比较蛋白组学研究结果 | 第26-27页 |
| 3.2.3 对照菌株与pqq B过表达重组菌株的差异表达聚类分析 | 第27-30页 |
| 3.2.4 关键差异表达基因和蛋白q PCR验证 | 第30-32页 |
| 3.3 外源PQQ刺激下G. oxydans的差异表达组学分析 | 第32-38页 |
| 3.3.1 不同PQQ浓度压力下G. oxydans生长情况 | 第32-33页 |
| 3.3.2 不同PQQ浓度刺激下氧化葡萄糖酸杆菌胞内外的影响 | 第33页 |
| 3.3.3 不同PQQ浓度刺激下G. oxydans的转录组学分析 | 第33-35页 |
| 3.3.4 不同PQQ浓度刺激下G. oxydans的蛋白质组学分析 | 第35页 |
| 3.3.5 不同PQQ浓度刺激下G. oxydans的差异表达聚类分析 | 第35-37页 |
| 3.3.6 关键差异表达基因和蛋白q PCR验证 | 第37-38页 |
| 主要结论与展望 | 第38-40页 |
| 主要结论 | 第38页 |
| 展望 | 第38-40页 |
| 致谢 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 附录 | 第45-61页 |
| 附录I：作者攻读专业学位硕士学位期间发表的论文 | 第45-46页 |
| 附录II：转录组学鉴定的对照菌与pqq B过表达菌株间的差异表达基因 | 第46-50页 |
| 附录III：蛋白组学鉴定的对照菌与pqq B过表达菌株间的差异表达蛋白 | 第50-55页 |
| 附录V：转录组学鉴定的不同PQQ浓度刺激下G. oxydans的差异表达基因 | 第55-59页 |
| 附录VI：转录组学鉴定的不同PQQ浓度刺激下G. oxydans的差异表达蛋白 | 第59-61页 |
