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溶源性发酵乳杆菌及其温和噬菌体的研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-15页
符号说明及缩写词第15-16页
第一章 绪论第16-35页
   ·乳酸菌第16-19页
     ·概述第16页
     ·发酵乳杆菌的发现及其在乳酸菌分类中的地位第16-17页
     ·发酵乳杆菌的应用研究第17-19页
   ·噬菌体第19-21页
     ·噬菌体的研究概况第19-20页
     ·噬菌体的形态与分类第20-21页
   ·乳酸菌噬菌体第21-27页
     ·乳酸菌噬菌体的危害第21-22页
     ·乳酸菌噬菌体的分类第22页
     ·乳酸菌噬菌体的生活周期第22-24页
     ·乳酸菌噬菌体的包装机制第24-27页
   ·乳酸菌噬菌体基因组的研究第27-34页
     ·乳酸菌噬菌体基因组的研究现状第27页
     ·乳酸菌噬菌体基因组的组成及结构特征第27-30页
     ·几类主要的乳酸菌噬菌体基因组特征第30-31页
     ·乳酸菌噬菌体基因组的进化分析第31-34页
   ·本文的研究意义和主要研究内容第34-35页
第二章 乳杆菌温和噬菌体的分离纯化及其生物学性质的研究第35-47页
   ·引言第35-36页
   ·材料与方法第36-39页
     ·培养基及试剂第36页
     ·乳杆菌的分离纯化及初步鉴定第36页
     ·温和噬菌体的诱导第36-37页
     ·噬菌体的浓缩第37页
     ·噬菌斑的检测第37页
     ·噬菌体颗粒的形态观察第37页
     ·噬菌体基因组的提取第37-38页
     ·噬菌体基因组DNA限制性酶切图谱分析第38页
     ·噬菌体外壳蛋白的SDS-PAGE分析第38页
     ·前噬菌体治愈菌株的制备及验证第38-39页
   ·结果与讨论第39-46页
     ·乳杆菌的分离纯化与初步鉴定第39页
     ·温和噬菌体的诱导第39-40页
     ·噬菌体颗粒的形态观察第40-41页
     ·噬菌体颗粒的限制性酶切图谱分析第41-42页
     ·噬菌体外壳蛋白的SDS-PAGE分析第42页
     ·包装体制的证明第42-43页
     ·治愈菌株的验证第43-44页
     ·溶源菌株与治愈菌株细胞和菌落形态的比较第44-45页
     ·溶源菌株与治愈菌株的生长及发酵特性比较第45-46页
   ·小结第46-47页
第三章 溶源性菌株YB5 16S rDNA鉴定及其生理特征的研究第47-59页
   ·引言第47页
   ·材料与方法第47-51页
     ·菌株与载体第47页
     ·培养基第47-48页
     ·细菌基因组DNA提取第48页
     ·用16S rDNA方法对YB5菌株鉴定第48-50页
     ·耐渗透压能力的测定第50页
     ·耐胆酸盐能力的测定第50页
     ·耐酸能力的测定第50页
     ·淀粉酶活力的测定第50-51页
     ·发酵乳杆菌YB5抑菌活性的测定第51页
   ·结果与分析第51-57页
     ·溶源性菌株YB5 16S rDNA序列鉴定第51-52页
     ·发酵乳杆菌YB5耐渗透压的能力第52页
     ·发酵乳杆菌YB5的耐酸性第52-53页
     ·发酵乳杆菌YB5淀粉酶活力测定第53-54页
     ·发酵乳杆菌YB5抑菌活性的研究第54-57页
   ·小结第57-59页
第四章 温和噬菌体ΦYB5基因组序列的测定及其生物信息学分析第59-95页
   ·引言第59页
   ·材料第59-60页
     ·菌株与质粒第59页
     ·培养基及主要试剂第59-60页
   ·方法第60-63页
     ·噬菌体ΦYB5基因组的提取第60页
     ·噬菌体ΦYB5基因组序列的测定第60-62页
     ·测序结果的分析及序列拼接第62页
     ·重叠群的生物信息学分析第62-63页
   ·结果与讨论第63-93页
     ·噬菌体ΦYB5基因组DNA的制备第63-64页
     ·噬菌体ΦYB5基因组序列的测定第64-68页
     ·重叠群的生物信息学分析第68-93页
   ·小结第93-95页
第五章 噬菌体蛋白的结构预测、进化分析及裂解素基因原核表达载体的构建第95-128页
   ·引言第95-96页
   ·材料与方法第96-99页
     ·噬菌体蛋白的结构预测及功能分析软件第96-97页
     ·质粒和载体第97页
     ·裂解素基因原核表达载体的构建第97-99页
   ·结果与分析第99-126页
     ·前头部成熟蛋白酶的结构预测与进化分析第99-102页
     ·主要头部蛋白的结构预测及进化分析第102-106页
     ·穿孔素蛋白的结构预测及进化分析第106-110页
     ·裂解素蛋白的结构预测及进化分析第110-114页
     ·整合酶蛋白的结构预测及进化分析第114-120页
     ·穿孔素和裂解素跨膜结构域的预测第120-123页
     ·裂解素信号肽的预测第123-124页
     ·噬菌体ΦYB5裂解素基因原核表达载体的构建第124-126页
   ·小结第126-128页
参考文献第128-139页
附录 课题涉及的引物信息统计表第139-141页
读博期间发表的文章第141-142页
致谢第142-143页

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