计算机辅助酶耐热性研究及分子设计
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-32页 |
| ·南极假丝酵母脂肪酶B | 第11-16页 |
| ·CALB 的起源 | 第11页 |
| ·CALB 的结构 | 第11-15页 |
| ·CALB 的应用及存在问题 | 第15-16页 |
| ·影响酶分子催化性质的因素 | 第16-19页 |
| ·疏水性 | 第16-17页 |
| ·氨基酸的组成及属性 | 第17-18页 |
| ·氢键 | 第18页 |
| ·二硫键 | 第18页 |
| ·离子对 | 第18-19页 |
| ·酶分子改造的方法 | 第19-22页 |
| ·定向进化 | 第19-20页 |
| ·半理性设计 | 第20-22页 |
| ·生物信息学 | 第22-31页 |
| ·生物信息学概述 | 第22页 |
| ·生物信息学应用 | 第22-23页 |
| ·同源建模 | 第23-25页 |
| ·分子对接 | 第25-27页 |
| ·分子动力学模拟 | 第27-31页 |
| ·本课题的主要工作及研究意义 | 第31-32页 |
| 第二章 分子动力学模拟方法的建立 | 第32-43页 |
| ·研究对象与计算资源 | 第32-33页 |
| ·研究对象 | 第32页 |
| ·计算平台 | 第32-33页 |
| ·相关软件 | 第33页 |
| ·实验流程 | 第33-34页 |
| ·实验方法 | 第34-43页 |
| ·常用数据库 | 第34-35页 |
| ·同源建模 | 第35-37页 |
| ·分子对接 | 第37-40页 |
| ·分子动力学模拟 | 第40-43页 |
| 第三章 分子动力学模拟方法的应用及验证 | 第43-61页 |
| ·同源建模构建CALB 空间结构 | 第43-47页 |
| ·实验材料 | 第43页 |
| ·实验方法 | 第43页 |
| ·实验结果 | 第43-47页 |
| ·CALB 及突变子分子对接 | 第47-50页 |
| ·实验材料 | 第47页 |
| ·实验方法 | 第47页 |
| ·实验结果 | 第47-50页 |
| ·CALB 及突变子的分子动力学模拟 | 第50-54页 |
| ·实验材料 | 第51页 |
| ·实验方法 | 第51页 |
| ·结果分析 | 第51-54页 |
| ·分子动力学模拟方法的验证 | 第54-60页 |
| ·实验材料 | 第54-56页 |
| ·实验结果分析 | 第56-60页 |
| ·本章小结 | 第60-61页 |
| 第四章 计算机辅助分子设计 | 第61-66页 |
| ·实验材料 | 第61-62页 |
| ·突变位点 | 第61-62页 |
| ·计算平台 | 第62页 |
| ·实验结果 | 第62-65页 |
| ·同源建模结果 | 第62-63页 |
| ·分子对接结果 | 第63-64页 |
| ·分子动力学模拟结果 | 第64-65页 |
| ·实验验证结果 | 第65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| 结论与展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 攻读硕士期间取得的研究成果 | 第74-75页 |
| 附录 | 第75-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
