| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 沙门氏菌及其危害 | 第11-13页 |
| 1.1.1 沙门氏菌生物学特性 | 第11页 |
| 1.1.2 沙门氏菌的危害 | 第11-12页 |
| 1.1.3 沙门氏菌分类 | 第12-13页 |
| 1.2 沙门氏菌分型方法 | 第13-17页 |
| 1.2.1 沙门氏菌血清分型 | 第13-14页 |
| 1.2.2 沙门氏菌分子分型 | 第14-17页 |
| 1.3 沙门氏菌属特异分子检测靶点 | 第17-20页 |
| 1.3.1 常用的沙门氏菌检测靶点 | 第17-19页 |
| 1.3.1.1 毒力岛(SPI)基因 | 第18页 |
| 1.3.1.2 鞭毛菌毛等抗原特异性基因 | 第18-19页 |
| 1.3.1.3 毒力毒素基因 | 第19页 |
| 1.3.2 用生物信息学方法发掘新靶点 | 第19-20页 |
| 1.4 PCR技术的应用和发展 | 第20-21页 |
| 1.4.1 PCR技术在检测中的应用 | 第20-21页 |
| 1.4.2 PCR技术应用于沙门氏菌的血清分子分型 | 第21页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第21-23页 |
| 第二章 沙门氏菌属特异检测靶点血清分型能力的分析 | 第23-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 菌株信息 | 第23-24页 |
| 2.1.2 软件分析原理及注意事项 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 菌株信息的下载与整理 | 第25页 |
| 2.2.2 对应靶点序列的获取 | 第25-26页 |
| 2.2.3 对应靶点序列SNP位点分析方法 | 第26-27页 |
| 2.2.4 靶点序列碱基差异位点表的建立 | 第27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-30页 |
| 2.3.1 对应靶点序列的SNP位点数目 | 第27-28页 |
| 2.3.2 分子靶点血清型差异位点表的建立 | 第28-30页 |
| 2.4 小结 | 第30-31页 |
| 第三章 分子靶点对国内常见38种沙门氏菌血清分型的研究 | 第31-45页 |
| 3.1 实验材料 | 第31-34页 |
| 3.1.1 实验菌株 | 第31-32页 |
| 3.1.2 培养基及其配制 | 第32-33页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第33页 |
| 3.1.4 仪器与设备 | 第33-34页 |
| 3.2 实验方法 | 第34-39页 |
| 3.2.1 沙门氏菌DNA提取方法的比较 | 第34-36页 |
| 3.2.2 特异性靶点PCR扩增 | 第36-38页 |
| 3.2.3 琼脂糖凝胶电泳 | 第38页 |
| 3.2.4 测序与软件分析 | 第38-39页 |
| 3.3 结果与分析 | 第39-44页 |
| 3.3.1 DNA提取结果与分析 | 第39-41页 |
| 3.3.2 分子靶点血清分型碱基差异位点表的建立 | 第41-44页 |
| 3.4 小结 | 第44-45页 |
| 第四章 分子靶点血清分型方法应用于食品样品中沙门氏菌血清分型 | 第45-53页 |
| 4.1 实验材料 | 第45页 |
| 4.1.1 样品采集 | 第45页 |
| 4.1.2 培养基 | 第45页 |
| 4.1.3 主要试剂及配制 | 第45页 |
| 4.1.4 仪器与设备 | 第45页 |
| 4.2 实验方法 | 第45-48页 |
| 4.2.1 食品样品的处理 | 第45-46页 |
| 4.2.2 DNA的提取 | 第46页 |
| 4.2.3 PCR反应及电泳检测 | 第46-47页 |
| 4.2.4 测序序列与碱基差异位点表的比对 | 第47页 |
| 4.2.5 传统玻片凝集对血清型的再鉴定 | 第47-48页 |
| 4.3 结果与分析 | 第48-51页 |
| 4.3.1 食品样品中的菌株分离结果 | 第48页 |
| 4.3.2 可疑沙门氏菌的鉴定结果 | 第48-49页 |
| 4.3.3 分子靶点血清分型方法对沙门氏菌的血清判定 | 第49-50页 |
| 4.3.4 传统血清分型方法对沙门氏菌血清型的鉴定 | 第50-51页 |
| 4.4 小结 | 第51-53页 |
| 第五章 总结与展望 | 第53-55页 |
| 5.1 总结 | 第53页 |
| 5.2 创新 | 第53-54页 |
| 5.3 展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读学位期间已发表和准备中的学术论文 | 第66-68页 |
