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基于靶序列环化的新型滚环扩增方法的建立及其应用

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
0 前言第14-49页
   ·核酸扩增技术的发展历史与研究现状第14-18页
     ·聚合酶链式反应第14-17页
     ·连接酶链式反应第17-18页
   ·等温核酸扩增方法的研究进展第18-25页
     ·环介导等温扩增第18-20页
     ·核酸序列依赖扩增第20-21页
     ·链置换扩增第21-22页
     ·等温多重取代扩增第22-23页
     ·依赖解旋酶 DNA 等温扩增第23-24页
     ·滚环扩增第24-25页
   ·滚环扩增的研究进展与应用第25-33页
     ·RCA 检测核酸序列第25-30页
     ·RCA 进行全基因组扩增第30-31页
     ·利用 RCA 检测单核苷酸多态性第31-33页
   ·固相滚环扩增检测技术第33-38页
     ·磁珠第33-35页
     ·微阵列第35-37页
     ·微流控芯片第37-38页
   ·水产品中有害微生物的检测第38-41页
     ·PCR 检测水产品中有害微生物第38-39页
     ·免疫法检测水产品中有害微生物第39-40页
     ·基因芯片检测水产品中有害微生物第40-41页
   ·本论文研究意义第41-42页
 参考文献第42-49页
1. TC-RCA 等温 DNA 扩增方法的初探第49-70页
   ·仪器与材料第51-53页
   ·TC-RCA 扩增 PCR 产物酶切片段第53-58页
     ·方法与步骤第53-55页
       ·pUC-18 质粒的提取和 TspR I 酶切第53页
       ·PCR 扩增质粒特定序列片段第53-54页
       ·PCR 产物胶回收提取第54页
       ·胶回收产物与提取质粒 TspR I 限制性内切酶酶切第54页
       ·酶切模板连接反应第54-55页
       ·RCA 反应第55页
       ·RCA 产物 TspR I 再酶切第55页
     ·结果与讨论第55-58页
   ·TC-RCA 优化接头扩增质粒酶切片段第58-64页
     ·方法与步骤第58-59页
       ·pUC-18 质粒 TspR I 酶切第58页
       ·连接反应第58页
       ·RCA 扩增反应第58-59页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第59页
     ·结果与讨论第59-64页
   ·TC-RCA 在固相磁珠表面扩增质粒酶切片段第64-68页
     ·方法与步骤第64-66页
       ·负载接头的磁珠制备第64页
       ·pUC-18 质粒 TspR I 酶切第64-65页
       ·连接反应第65页
       ·RCA 扩增反应第65页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第65-66页
       ·固相磁珠负载接头的稳定性第66页
     ·结果与讨论第66-68页
   ·本章小结第68-69页
 参考文献第69-70页
2. 高背景核酸条件下 TC-RCA 扩增目的 DNA 序列第70-91页
   ·仪器与材料第71-73页
   ·T4 DNA 连接酶介导的从牡蛎基因组 DNA 中扩增质粒片段第73-85页
     ·方法与步骤第73-74页
       ·牡蛎基因组 DNA 的提取第73页
       ·pUC-18 质粒混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第73页
       ·连接反应第73-74页
       ·RCA 扩增反应第74页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第74页
     ·结果与讨论第74-84页
     ·小结第84-85页
   ·Taq DNA 连接酶介导的从牡蛎基因组 DNA 中扩增质粒片段第85-89页
     ·方法与步骤第85-87页
       ·牡蛎基因组 DNA 的提取第85页
       ·pUC-18 质粒混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第85-86页
       ·连接(Ligation)反应第86页
       ·RCA 扩增反应第86页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第86-87页
     ·结果与讨论第87-88页
     ·小结第88-89页
   ·本章小结第89页
 参考文献第89-91页
3. 磁珠辅助 TC-RCA 扩增技术的研究第91-132页
   ·仪器与材料第91-94页
   ·磁珠辅助 Taq DNA 连接酶介导的 TC-RCA 扩增第94-102页
     ·方法与步骤第94-96页
       ·牡蛎基因组 DNA 的提取第94页
       ·pUC-18 质粒混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第94页
       ·连接反应第94-95页
       ·RCA 扩增反应第95页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第95页
       ·PCR 在牡蛎基因组存在下扩增 pUC-18 质粒第95-96页
     ·结果与讨论第96-101页
     ·小结第101-102页
   ·磁珠辅助 TC-RCA 扩增方法敏感度优化第102-114页
     ·方法与步骤第102-104页
       ·牡蛎基因组 DNA 的提取第102页
       ·pUC-18 质粒混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第102页
       ·连接反应第102-103页
       ·RCA 扩增反应第103页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第103-104页
     ·结果与讨论第104-113页
     ·本节小结第113-114页
   ·磁珠辅助 TC-RCA 扩增方法效率的提升优化第114-129页
     ·方法与步骤第114-118页
       ·牡蛎基因组 DNA 的提取第114页
       ·pUC-18 质粒混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第114-115页
       ·连接反应第115页
       ·RCA 扩增反应第115-116页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第116页
       ·SYBR Green I 染色第116页
       ·Real-time 实时荧光定量系统进行 RT-RCA第116-118页
     ·结果与讨论第118-128页
     ·小结第128-129页
   ·本章小结第129页
 参考文献第129-132页
4. 磁珠辅助 TC-RCA 检测水产品中的有害细菌第132-152页
   ·仪器与材料第133-135页
   ·磁珠辅助 TC-RCA 检测牡蛎基因组中细菌 DNA第135-143页
     ·方法与步骤第135-138页
       ·细菌的活化与培养第135页
       ·扩增细菌接头与引物的设计第135-136页
       ·细菌基因组 DNA 与牡蛎基因组 DNA 的提取第136页
       ·细菌 DNA 混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第136页
       ·连接反应第136-137页
       ·RCA 扩增反应第137页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第137-138页
       ·SYBR Green I 染色第138页
     ·结果与讨论第138-142页
     ·小结第142-143页
   ·磁珠辅助 TC-RCA 检测牡蛎中有害细菌的侵染第143-150页
     ·方法与步骤第143-147页
       ·细菌的活化与培养第143页
       ·扩增细菌接头与引物的设计第143页
       ·副溶血弧菌人工污染牡蛎样品的构建第143-144页
       ·人工污染样品基因组 DNA 的提取第144-145页
       ·细菌 DNA 混合牡蛎基因组 DNA TspR I 酶切第145页
       ·连接反应第145-146页
       ·RCA 扩增反应第146页
       ·RCA 产物 TspR I 酶切第146页
       ·SYBR Green I 染色第146-147页
     ·结果与讨论第147-149页
       ·副溶血弧菌菌落计数结果第147页
       ·细菌基因组 DNA 提取试剂盒提取样品的检测第147-148页
       ·海洋生物基因组 DNA 提取试剂盒提取样品的检测第148页
       ·联合 DNA 提取法提取样品的检测第148-149页
     ·小结第149-150页
   ·本章小结第150页
 参考文献第150-152页
论文结论第152-153页
已发表学术论文第153-154页
参加的项目课题第154-155页
个人简历第155-156页
致谢第156-157页

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