摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
英文词缩略表 | 第11-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-19页 |
1.1 内蒙古白绒山羊及其特性 | 第13页 |
1.2 肌内脂肪与羊肉品质 | 第13-14页 |
1.3 脂代谢及其调控 | 第14-15页 |
1.4 MAPK/ERK信号通路及其在脂代谢中的调控作用 | 第15-17页 |
1.4.1 JNK/SAPK通路 | 第16页 |
1.4.2 p38MAPK通路 | 第16-17页 |
1.4.3 ERK通路 | 第17页 |
1.5 mTOR信号通路与脂代谢 | 第17-18页 |
1.6 转录组与转录组学研究 | 第18-19页 |
1.6.1 转录组测序技术 | 第18页 |
1.6.2 转录组技术的应用研究 | 第18-19页 |
第二章 绒山羊胎儿成纤维细胞ERK功能抑制的转录组分析及其在脂合成中的作用 | 第19-55页 |
1 引言 | 第19-21页 |
1.1 ERK的发现与功能 | 第19页 |
1.2 ERK与mTOR信号通路 | 第19-20页 |
1.3 研究目的和意义 | 第20-21页 |
2 材料和方法 | 第21-32页 |
2.1 材料 | 第21-23页 |
2.1.1 实验细胞系 | 第21页 |
2.1.2 实验材料 | 第21-22页 |
2.1.3 实验主要仪器设备 | 第22-23页 |
2.2 方法 | 第23-32页 |
2.2.1 细胞培养 | 第23-24页 |
2.2.1.1 细胞解冻与复苏 | 第23页 |
2.2.1.2 细胞换液与传代 | 第23-24页 |
2.2.1.3 细胞冻存 | 第24页 |
2.2.2 MTT法 | 第24页 |
2.2.3 台盼蓝法 | 第24-25页 |
2.2.3.1 生长曲线测定 | 第24-25页 |
2.2.3.2 敏感性测定 | 第25页 |
2.2.4 WesternBlot | 第25-26页 |
2.2.4.1 SCH772984处理细胞 | 第25页 |
2.2.4.2 细胞总蛋白的提取 | 第25页 |
2.2.4.3 WesternBlot分析 | 第25-26页 |
2.2.5 ELISA检测甘油三酯、软脂酸和二十二碳六烯酸 | 第26-27页 |
2.2.5.1 SCH772984处理细胞 | 第26页 |
2.2.5.2 细胞总蛋白的提取 | 第26页 |
2.2.5.3 ELISA分析 | 第26-27页 |
2.2.6 qRT-PCR | 第27-29页 |
2.2.6.1 SCH772984处理细胞 | 第27页 |
2.2.6.2 细胞总RNA的提取 | 第27页 |
2.2.6.3 总RNA反转录为cDNA | 第27-28页 |
2.2.6.4 qPCR分析 | 第28-29页 |
2.2.7 转录组测序RNA样品制备与质量检测 | 第29-30页 |
2.2.8 RNA文库建立 | 第30-31页 |
2.2.9 文库质控与上机测序 | 第31页 |
2.2.10 生物信息学分析流程 | 第31-32页 |
2.2.11 数据分析方法 | 第32页 |
3 结果 | 第32-53页 |
3.1 SCH772984抑制绒山羊胎儿成纤维细胞(GFb)增殖及甘油三酯(TAG)、软脂酸(PA)和二十二碳六烯酸(DHA)合成 | 第32-40页 |
3.1.1 SCH772984抑制GFb细胞增殖 | 第32-33页 |
3.1.2 SCH772984对GFb细胞生长抑制具有剂量效应 | 第33-34页 |
3.1.3 SCH772984抑制ERK和mTORC1活性及TAG、PA和DHA的合成 | 第34-38页 |
3.1.3.1 10nM和15nMSCH772984处理细胞24h抑制ERK/mTORC1的活性但不抑制TAG、PA和DHA合成 | 第34-36页 |
3.1.3.2 0.1μM和1μMSCH772984处理细胞24h抑制ERK/mTORC1的活性及TAG、PA和DHA合成 | 第36-38页 |
3.1.4 SCH772984抑制SREBP1、PPARγ、Lipin1、DGAT1、ACC、FAS编码基因转录 | 第38-40页 |
3.2 ERK1/2功能抑制条件下的GFb比较转录组分析 | 第40-53页 |
3.2.1 总RNA样品检测结果 | 第40-41页 |
3.2.1.1 总RNA浓度检测符合转录组测序要求 | 第40页 |
3.2.1.2 总RNA电泳检测质量符合要求 | 第40-41页 |
3.2.1.3 测序数据产出统计 | 第41页 |
3.2.2 生物信息学分析 | 第41-53页 |
3.2.2.1 SNP分析 | 第41-42页 |
3.2.2.2 新基因(转录本)分析 | 第42-43页 |
3.2.2.3 差异表达基因分析 | 第43-46页 |
3.2.2.4 差异表达基因功能注释和GO分类 | 第46-48页 |
3.2.2.5 差异表达基因功能注释和COG分类 | 第48页 |
3.2.2.6 差异表达基因功能注释和KEGG分类 | 第48-53页 |
4 讨论 | 第53-54页 |
5 结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
附录 | 第59-71页 |
附录 Ⅰ | 第59-62页 |
附录 Ⅱ | 第62-67页 |
附录 Ⅲ | 第67-71页 |
致谢 | 第71-72页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第72页 |