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绒山羊胎儿成纤维细胞ERK功能抑制的转录组分析及其在脂合成中的作用

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-7页
英文词缩略表第11-13页
第一章 文献综述第13-19页
    1.1 内蒙古白绒山羊及其特性第13页
    1.2 肌内脂肪与羊肉品质第13-14页
    1.3 脂代谢及其调控第14-15页
    1.4 MAPK/ERK信号通路及其在脂代谢中的调控作用第15-17页
        1.4.1 JNK/SAPK通路第16页
        1.4.2 p38MAPK通路第16-17页
        1.4.3 ERK通路第17页
    1.5 mTOR信号通路与脂代谢第17-18页
    1.6 转录组与转录组学研究第18-19页
        1.6.1 转录组测序技术第18页
        1.6.2 转录组技术的应用研究第18-19页
第二章 绒山羊胎儿成纤维细胞ERK功能抑制的转录组分析及其在脂合成中的作用第19-55页
    1 引言第19-21页
        1.1 ERK的发现与功能第19页
        1.2 ERK与mTOR信号通路第19-20页
        1.3 研究目的和意义第20-21页
    2 材料和方法第21-32页
        2.1 材料第21-23页
            2.1.1 实验细胞系第21页
            2.1.2 实验材料第21-22页
            2.1.3 实验主要仪器设备第22-23页
        2.2 方法第23-32页
            2.2.1 细胞培养第23-24页
                2.2.1.1 细胞解冻与复苏第23页
                2.2.1.2 细胞换液与传代第23-24页
                2.2.1.3 细胞冻存第24页
            2.2.2 MTT法第24页
            2.2.3 台盼蓝法第24-25页
                2.2.3.1 生长曲线测定第24-25页
                2.2.3.2 敏感性测定第25页
            2.2.4 WesternBlot第25-26页
                2.2.4.1 SCH772984处理细胞第25页
                2.2.4.2 细胞总蛋白的提取第25页
                2.2.4.3 WesternBlot分析第25-26页
            2.2.5 ELISA检测甘油三酯、软脂酸和二十二碳六烯酸第26-27页
                2.2.5.1 SCH772984处理细胞第26页
                2.2.5.2 细胞总蛋白的提取第26页
                2.2.5.3 ELISA分析第26-27页
            2.2.6 qRT-PCR第27-29页
                2.2.6.1 SCH772984处理细胞第27页
                2.2.6.2 细胞总RNA的提取第27页
                2.2.6.3 总RNA反转录为cDNA第27-28页
                2.2.6.4 qPCR分析第28-29页
            2.2.7 转录组测序RNA样品制备与质量检测第29-30页
            2.2.8 RNA文库建立第30-31页
            2.2.9 文库质控与上机测序第31页
            2.2.10 生物信息学分析流程第31-32页
            2.2.11 数据分析方法第32页
    3 结果第32-53页
        3.1 SCH772984抑制绒山羊胎儿成纤维细胞(GFb)增殖及甘油三酯(TAG)、软脂酸(PA)和二十二碳六烯酸(DHA)合成第32-40页
            3.1.1 SCH772984抑制GFb细胞增殖第32-33页
            3.1.2 SCH772984对GFb细胞生长抑制具有剂量效应第33-34页
            3.1.3 SCH772984抑制ERK和mTORC1活性及TAG、PA和DHA的合成第34-38页
                3.1.3.1 10nM和15nMSCH772984处理细胞24h抑制ERK/mTORC1的活性但不抑制TAG、PA和DHA合成第34-36页
                3.1.3.2 0.1μM和1μMSCH772984处理细胞24h抑制ERK/mTORC1的活性及TAG、PA和DHA合成第36-38页
            3.1.4 SCH772984抑制SREBP1、PPARγ、Lipin1、DGAT1、ACC、FAS编码基因转录第38-40页
        3.2 ERK1/2功能抑制条件下的GFb比较转录组分析第40-53页
            3.2.1 总RNA样品检测结果第40-41页
                3.2.1.1 总RNA浓度检测符合转录组测序要求第40页
                3.2.1.2 总RNA电泳检测质量符合要求第40-41页
                3.2.1.3 测序数据产出统计第41页
            3.2.2 生物信息学分析第41-53页
                3.2.2.1 SNP分析第41-42页
                3.2.2.2 新基因(转录本)分析第42-43页
                3.2.2.3 差异表达基因分析第43-46页
                3.2.2.4 差异表达基因功能注释和GO分类第46-48页
                3.2.2.5 差异表达基因功能注释和COG分类第48页
                3.2.2.6 差异表达基因功能注释和KEGG分类第48-53页
    4 讨论第53-54页
    5 结论第54-55页
参考文献第55-59页
附录第59-71页
    附录 Ⅰ第59-62页
    附录 Ⅱ第62-67页
    附录 Ⅲ第67-71页
致谢第71-72页
攻读硕士学位期间发表的论文第72页

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